当前解析结果
SmilChr08G004688| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004688 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004688 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004688 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 56331222 - 56332979 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998778 |
|---|---|
| GeneID | 130998778 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998778 |
| 原始查询 | SmilChr08G004688 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998778 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780167.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057780167.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.80000 | XP_057780167.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780167.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780167.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:56331418 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr8:56331424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr8:56331599 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr8:56331614 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B105,C64 |
Chr8:56331614 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,C64 |
Chr8:56331757 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B106,B110,B119,B125,B27,B4,B45,B83,B97,C59,C76 |
Chr8:56331769 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A8,B115,B23,B53,B66 |
Chr8:56331837 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B89 |
Chr8:56331837 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B89 |
Chr8:56331986 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B42 |
Chr8:56332044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr8:56332214 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,C64,C66 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。