当前解析结果
SmilChr08G004689| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004689 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004689 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004689 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 56333748 - 56335010 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130999381 |
|---|---|
| GeneID | 130999381 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999381 |
| 原始查询 | SmilChr08G004689 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999381 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780895.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057780895.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057780895.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780895.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780895.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:56334352 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B90 |
Chr8:56334559 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr8:56334588 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C70 |
Chr8:56334728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B103,B96,C47,C61 |
Chr8:56334741 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A24,B110,B115,B134,B16,B17,B24,B53,B66,B80,B91,D6 |
Chr8:56334746 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A3,B110,B62,B98,C53,C59,C6,C61,D11 |
Chr8:56334776 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 20 | A13,A19,A22,A8,B104,B30,B36,B61,B88,C36,C39,C41,C42,C59,C62,C64,C66,C68,C74,C87 |
Chr8:56334797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,B32,C36,C44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。