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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004707`

染色体: Chr08 坐标: 56517028-56519769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004707`
名称	SmilChr08G004707
描述	toMV resistant protein Tm-2 netted virescent-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56517028 - 56519769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999365`
GeneID	`130999365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999365`
原始查询	`SmilChr08G004707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	toMV resistant protein Tm-2 netted virescent-like
产物	toMV resistant protein Tm-2 netted virescent-like
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=37.6; qcov=0.606; evalue=6.2e-24; confidence=medium
Rice	`Os06g0146100` (Pi9(t)) - identity=38.8; qcov=0.568; evalue=1.44e-24; confidence=medium
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057780876.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780876.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780876.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780876.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780876.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56518228`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	68	A14,A16,A2,A21,A25,A5,A9,B1,B105,B106,B109,B11,B111,B114,B115,B126,B127,B128,B13,B135,B14,B15,B16,B19,B2,B20,B27,B28,B29,B3,B30,B44,B53,B57,B59,B64,B67,B68,B74,B78,B8,B82,B83,B85,B87,B91,B93,B98,C11,C18,C2,C27,C29,C30,C33,C42,C47,C51,C6,C69,C7,C70,C72,C75,C78,C80,D7,D8
`Chr8:56518230`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B33,C55,C67
`Chr8:56518230`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B33,C55,C67
`Chr8:56518248`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	B19,B85,C87
`Chr8:56518248`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B19,B85,C87
`Chr8:56518330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B107,B110,B138,B70
`Chr8:56518353`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B19,B85,C87
`Chr8:56518353`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B19,B85,C87
`Chr8:56518372`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C76,D6
`Chr8:56518372`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C76,D6
`Chr8:56518390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:56518403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780876.1

259 aa

130

259

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 151-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780876.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	151	203	5e-10	40.0	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924893.1
TTTTGTCTTCCTCTCTCCACCGCCCTTCCACCGCCCCGTCTCCTCGTTTCCCCACCTTCGACTTTAATGCTCGACCCCTTTTAATCCCCGCTGCATTGGCTTTCCATTTAGAGGGAGTTTTACACACTGTTTGATCGGAAGGCTCTGCTATTCCTTCCCGAAGTGTCGCCGGATTCCTGTTGGTGGTTTCCTGTTTGGTGACTGTGTGTGTGAACCTCGCTCCGATTGATTGCGTGTATCGCCGGATTCCTGACCGTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999365
ATGGCGGCTTATGCAGCTCTGCTTTCTCTCTCGACAATCAATCAGATCCAATTCCTTCAGAAAAAGGCTGATTTCATAGAGGCCTATAATCACGGTGGAGGTAGTAAACAGGCACAACATCTCGAGAGACAAATCTCGCACGTGATTGAATCGTGGATCGAATTCATTCTGTATCCAATCAAGCAAGCCTTGGATGCACGGTCGATCTGCAGCAGAGGGCTTCCTCTGTCGGTCACTGTGATCGGAGGGCTTCTTCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780876.1
MAAYAALLSLSTINQIQFLQKKADFIEAYNHGGGSKQAQHLERQISHVIESWIEFILYPIKQALDARSICSRGLPLSVTVIGGLLQKSAKTVEYWHNVLENIRSILSSGEGDQCLNVLYSSYSHLPAHLKPCFLYMGTFQEDREIPVSRTAEGFLKPKAARVLEEVAEDYLKDLIDRNLVLVGKYRKNGKVTSVCIHDLLRNLCISLAEKDKFFSSARVWYASEDSSVGDLSRKCKLRFFAYNPANFAEFDLTSSISFV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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