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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004722`

染色体: Chr08 坐标: 56635283-56637159 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004722`
名称	SmilChr08G004722
描述	photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56635283 - 56637159 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999372`
GeneID	`130999372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999372`
原始查询	`SmilChr08G004722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic
产物	photosystem I reaction center subunit XI%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G12800` (PSAL) photosystem I subunit l [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826892] identity=82.7; qcov=1; evalue=5.8e-109; confidence=high
Rice	`Os12g0420400` (PsaL) - identity=78.1; qcov=1; evalue=7.7e-100; confidence=high
GO	GO:0009522 (photosystem I); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009538 (photosystem I reaction center); GO:0015979 (photosynthesis)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02605 (PsaL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780887.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057780887.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057780887.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780887.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56636713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B127,B48,C12,C79
`Chr8:56636716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56636721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:56636745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B127,B48,C12,C79
`Chr8:56636754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56636760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,B60,C32,C68
`Chr8:56636765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B35
`Chr8:56636769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B22
`Chr8:56636773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr8:56636802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B127,B48,C12,C79
`Chr8:56636804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:56636826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780887.1

219 aa

110

219

PsaL

PF02605 PsaL 61-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780887.1`	Pfam	`PF02605`	PsaL	Family	61	212	3.9e-57	192.9	Photosystem I reaction centre subunit XI

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924904.1
TTCAATAAATCCCACAAAAAACCACATCACAAATCCCTGGGGCCCTATATGGATAAGTGATAAGGTATCAAACACAATCCCACCCAATCAAACACATTTCTCCCCACAGAAACAACTCACAACCACCAAATCCAGCAGCAAAAGATACTGCAACATATCTTTATTATAAATTTTATTTTTTGAGTTATAAACAGCCTCTTCCAATCAAGAAATCTCAGTCAAGAAATGGCAGCTGCTGCTTCAACAATGGCAAGCCAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999372
ATGGCAGCTGCTGCTTCAACAATGGCAAGCCAACTCCAAAGCAACTTTGCCTCTTCACTCACAAGGAAGCTTGCCACTCCAAAGGGCATCTCTGGTGCTCCCTTTAGAGTCTTGCCCTCTGGGAGGAGAGCCACTTCCTTCACCGTCAAGGCCATCCAATCGGAAAAGCCTACATACCAAGTCATTCAACCAATCAATGGTGACCCATTCATTGGGAGTCTCGAGACACCTGTCACCTCAAGCCCATTGGTGGCATGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780887.1
MAAAASTMASQLQSNFASSLTRKLATPKGISGAPFRVLPSGRRATSFTVKAIQSEKPTYQVIQPINGDPFIGSLETPVTSSPLVAWYLSNLPAYRTAVNPLLRGVEVGLAHGFLLVGPFVKTGPLRNTPIAGSAGSLGAAGLVVILSICLTIYGIASFKEGEPSTAPGLTLTGRKKEPDQLQTADGWAKFTGGFFFGGISGVTWAYFLLYVLDLPYFVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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