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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004732`

染色体: Chr08 坐标: 56697603-56698111 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004732`
名称	SmilChr08G004732
描述	receptor-like protein 53
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56697603 - 56698111 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998791`
GeneID	`130998791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998791`
原始查询	`SmilChr08G004732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 53
产物	receptor-like protein 53
Arabidopsis	`AT2G33170` (AT2G33170) Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817878] identity=36.2; qcov=0.958; evalue=6.89e-22; confidence=medium
Rice	`Os01g0170300` - identity=39.9; qcov=0.958; evalue=6.96e-24; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780180.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780180.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780180.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780180.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56697610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C30,C55
`Chr8:56697613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr8:56697619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B72
`Chr8:56697620`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B72
`Chr8:56697620`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B72
`Chr8:56697632`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B96,C4,C40,C62
`Chr8:56697632`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B96,C4,C40,C62
`Chr8:56697633`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B72,C11
`Chr8:56697633`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B72,C11
`Chr8:56697635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A13,B105,B128,B135,B21,B56,B60,B71,C21,C29,C41,C55
`Chr8:56697637`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B72
`Chr8:56697637`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780180.1

144 aa

144

LRR_1

PF00560 LRR_1 7-29 aa PF00560 LRR_1 32-53 aa PF00560 LRR_1 55-77 aa PF00560 LRR_1 104-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780180.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	7	29	2.1e-15	54.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057780180.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	32	53	2.1e-15	54.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057780180.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	55	77	2.1e-15	54.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057780180.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	104	125	2.1e-15	54.2	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924197.1
ATGTGCCGTAATCTTCCATCTCTTACAGGGCTTCATCTTTCTAAAAATCAATTGAGTGGCACGATTCCCACAAATCTATCCCAATGTTCAGGGGTTGAGGTGTTGAGCCTCTCTTACAACTCTTTTTGTGGGGAGATACCTTCAGAAATCGGCTACTTAACATCTCTTCAGTTGTTATATCTTGGTGGTAACAATTTGAATGGAATACTACCACATGAGATTGGCCATCTTCAGAGTCTGGTTAGTTTTGGTGCTGAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998791
ATGTGCCGTAATCTTCCATCTCTTACAGGGCTTCATCTTTCTAAAAATCAATTGAGTGGCACGATTCCCACAAATCTATCCCAATGTTCAGGGGTTGAGGTGTTGAGCCTCTCTTACAACTCTTTTTGTGGGGAGATACCTTCAGAAATCGGCTACTTAACATCTCTTCAGTTGTTATATCTTGGTGGTAACAATTTGAATGGAATACTACCACATGAGATTGGCCATCTTCAGAGTCTGGTTAGTTTTGGTGCTGAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780180.1
MCRNLPSLTGLHLSKNQLSGTIPTNLSQCSGVEVLSLSYNSFCGEIPSEIGYLTSLQLLYLGGNNLNGILPHEIGHLQSLVSFGAEQNEIAGSIDFNIFMNMSSLQNINLWRNKFTGNLSRDVGNITMLTELYFQENHLTGTTE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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