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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004737`

染色体: Chr08 坐标: 56770043-56781241 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004737`
名称	SmilChr08G004737
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56770043 - 56781241 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999407`
GeneID	`130999407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999407`
原始查询	`SmilChr08G004737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47090` (AT3G47090) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823862] identity=45.9; qcov=0.967; evalue=1.33e-52; confidence=high
Rice	`Os11g0692500` - identity=49.5; qcov=0.906; evalue=1.3e-60; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057780912.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057780912.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780912.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780912.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780912.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56770622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B121,C6
`Chr8:56770625`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:56770625`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56770630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B112,C7
`Chr8:56770632`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A2,A3,C6
`Chr8:56770632`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A2,A3,C6
`Chr8:56770647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B118,B15,B85,B87
`Chr8:56770686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B82
`Chr8:56770689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:56770708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:56770746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,D6
`Chr8:56770767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B75,B81,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780912.1

212 aa

106

212

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 29-183 aa PF00069 Pkinase 30-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780912.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	29	183	9.2e-30	104.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057780912.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	30	186	4e-32	112.4	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924929.1
CGACAAAATTCTACCGAGAAATATGGCGGCGTGGTTAGACCTCATTCTTGGGATAGTTTTGTAGTTGTGACCACTGAAATTAAAAGCTGAAGAATTGGGGAAGCTCGCTGTTGAAAATAGAGAGATAGGGTTTTGTGAGAAGAAAGGTAAAGTAGATCTGGTTATGATTAAGAACATCAACAACCGTGCACCCAGTCCAGCAATGGTATTGCACCCAGTGCAGCTAGAAGGTATTTCAAGAATATTTGATGTCGAATGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999407
ATGATTAAGAACATCAACAACCGTGCACCCAGTCCAGCAATGGTATTGCACCCAGTGCAGCTAGAAGGTATTTCAAGAATATTTGATGTCGAATGTGAGATACTACGTAGCATTCGACACAGGAATCTGACAAGCGTCATAAGCAGTTGCTCCAATGAAGAGTTCAGGGCATTAGTACTTGAATATATGGCAAAGGGAAACCTTGAAAAATGGTTATATTCCCACAACTATTGGTTGAATATGATGGAAAGATTGAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780912.1
MIKNINNRAPSPAMVLHPVQLEGISRIFDVECEILRSIRHRNLTSVISSCSNEEFRALVLEYMAKGNLEKWLYSHNYWLNMMERLNIMIDVASALEYLHHGYSMPIVHSDLKPSNVLLDEDMVAHVSDFGIAKLLCDGDSSVLTNTLATLGYIAPEYGLEGLVSTRCDVYSCRVMLIETFTRKRPGDDMFGGNISLKRWVELSLSKIPDMPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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