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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004763`

染色体: Chr08 坐标: 56988296-56990510 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004763`
名称	SmilChr08G004763
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56988296 - 56990510 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999433`
GeneID	`130999433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999433`
原始查询	`SmilChr08G004763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT2G43280` (AT2G43280) Far-red impaired responsive (FAR1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818930] identity=55.8; qcov=0.801; evalue=1.12e-65; confidence=high
Rice	`Os03g0655600` - identity=39.4; qcov=0.628; evalue=8.72e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780938.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780938.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780938.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780938.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56989645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr8:56989716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:56989833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C46
`Chr8:56989836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C46
`Chr8:56990004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C39,C47,C86
`Chr8:56990068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:56990105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B78,C85
`Chr8:56990165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B53,B91,B94
`Chr8:56990166`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A10,A13,A14,A16,A2,A20,A21,A22,A25,A8,B103,B104,B108,B117,B123,B124,B133,B135,B138,B14,B17,B26,B35,B36,B4,B41,B47,B54,B56,B6,B61,B69,B70,B72,B73,B8,B83,B96,C1,C15,C19,C2,C23,C30,C35,C38,C39,C4,C44,C47,C50,C52,C56,C57,C6,C65,C67,C7,C79,C82,C86,D2,D6,D8
`Chr8:56990170`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A10,A13,A14,A16,A2,A20,A21,A22,A25,A8,B103,B104,B108,B117,B123,B124,B133,B135,B138,B14,B17,B26,B36,B4,B41,B47,B54,B56,B6,B61,B69,B70,B72,B73,B8,B83,B96,C1,C15,C19,C2,C23,C30,C35,C38,C39,C4,C44,C47,C50,C52,C56,C57,C6,C65,C67,C7,C79,C82,C86,D2,D6,D8
`Chr8:56990176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A10,A13,A14,A16,A2,A21,A22,A25,A8,B103,B104,B108,B117,B123,B124,B133,B135,B138,B14,B17,B26,B35,B36,B4,B41,B47,B54,B56,B6,B61,B69,B70,B73,B8,B83,B96,C1,C15,C19,C2,C23,C30,C35,C38,C39,C4,C44,C47,C56,C57,C6,C65,C67,C7,C79,C82,C86,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780938.1

254 aa

127

254

FAR1

PF03101 FAR1 57-146 aa

XP_057780940.1

226 aa

113

226

FAR1

PF03101 FAR1 57-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780938.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	57	146	1.4e-29	103.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057780940.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	57	146	1.3e-29	103.4	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924957.1
AAATTTTATTTAAAAAAAAAAGATAAAAGGGAAAGAAAATTCTAACTTAAGAAATGTGGAAGTTCTGCAACGGGTGGGTGCCCATACACTGCGGTGTTCAGCTTCGAAGCTCAGAATAAATCGCCCAAAAACTGCTCACTTTCACTTTCGATTCGCAATTCTCTCCACATTTCGTCTTAATCCTTTGATTGTATCTCCATCAACATGGTAGAAGCAGCGGCTGGTGACTCGGACAAAGAGGATTTGAACTCAAGGGACTC...

XM_057924955.1
GGAAAGAAAATTCTAACTTAAGAAATGTGGAAGTTCTGCAACGGGTGGGTGCCCATACACTGCGGTGTTCAGCTTCGAAGCTCAGAATAAATCGCCCAAAAACTGCTCACTTTCACTTTCGATTCGCAATTCTCTCCACATTTCGTCTTAATCCTTTGATTGTATCTCCATCAACATGGTAGAAGCAGCGGCTGGTGACTCGGACAAAGAGGATTTGAACTCAAGGGACTCAGACGAAGATGATCTTGCTGAAGCCGAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999433
ATGGTAGAAGCAGCGGCTGGTGACTCGGACAAAGAGGATTTGAACTCAAGGGACTCAGACGAAGATGATCTTGCTGAAGCCGAGGAGGAGAAGACGTGGTCGGGTGAAGGAGGTGAAGTTGTCGAACCACATGTAGGTATGGAATTCGACTCAGAAGATGATGCTAGGAGATTCTATAATGACTATGCTAGGAGGGTAGGATTCGTCGTGCGCGTCATGCAACGCCGCCGTTCCGAGATTGACGGTAGAACCCTTGCCCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780938.1
MVEAAAGDSDKEDLNSRDSDEDDLAEAEEEKTWSGEGGEVVEPHVGMEFDSEDDARRFYNDYARRVGFVVRVMQRRRSEIDGRTLARRLGCNKQGFSPNTKGMIGPEKKPRPSAREGCKATILFKLEKSGKWVVTRFVKEHNHPLVVTAQEDTNVVRPTPSSSHIYQLFQQKLPVLIICSRMQLDKDKRIQELARELQRQEELCAAYRERLINLLSTVESQADQMSSKVLAVVESVKKAEAEALTEALTIPLDK

XP_057780940.1
MVEAAAGDSDKEDLNSRDSDEDDLAEAEEEKTWSGEGGEVVEPHVGMEFDSEDDARRFYNDYARRVGFVVRVMQRRRSEIDGRTLARRLGCNKQGFSPNTKGMIGPEKKPRPSAREGCKATILFKLEKSGKWVVTRFVKEHNHPLVVTAQEDTNVLDKDKRIQELARELQRQEELCAAYRERLINLLSTVESQADQMSSKVLAVVESVKKAEAEALTEALTIPLDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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