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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004764`

染色体: Chr08 坐标: 56990495-56993508 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004764`
名称	SmilChr08G004764
描述	uncharacterized CRM domain-containing protein At3g25440, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56990495 - 56993508 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999431`
GeneID	`130999431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999431`
原始查询	`SmilChr08G004764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0492900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0492900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G25440` (LOH1) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822128] identity=51.9; qcov=1.02; evalue=1.14e-141; confidence=high
Rice	`Os04g0492900` - identity=53.9; qcov=0.975; evalue=3.65e-143; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780936.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057780936.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780936.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780936.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56990992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:56991067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B88,B98,C25
`Chr8:56991188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C49,C76,D6
`Chr8:56991195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B8,B82
`Chr8:56991203`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C39
`Chr8:56991203`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C39
`Chr8:56991205`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B50
`Chr8:56991205`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B50
`Chr8:56991214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A14,C35,C44,C7
`Chr8:56991228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr8:56991263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:56991270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C22,C39,C47,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780936.1

447 aa

224

447

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 163-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780936.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	163	247	7.3e-17	62.2	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924953.1
TTGCCATTTTTCCGAACTATAGAATTTACAGAGGCAAAGCAGAGCAAACTTCGAAAGCAAAGAAAAACAAAAATGGCGGTGAGAAATTTGGCATCTAAATTCTCATTCCTCAAACATCTCCGCCCAAATTCCACGCCCTTGTCGCCTCTCTTCTCCCATTCTCAAATCATATTTCAAAGCTCGAGTATTGTTAGCAGAAGCATACCTCCTGCTGCTGGGAATCGTGTGATTGTGGGGCAAATATGTAACTTTGGCGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999431
ATGGCGGTGAGAAATTTGGCATCTAAATTCTCATTCCTCAAACATCTCCGCCCAAATTCCACGCCCTTGTCGCCTCTCTTCTCCCATTCTCAAATCATATTTCAAAGCTCGAGTATTGTTAGCAGAAGCATACCTCCTGCTGCTGGGAATCGTGTGATTGTGGGGCAAATATGTAACTTTGGCGGGTTCCATTCGGGTCGGGTTCTGAGGAATGCGGAGCCTGAGGTGGGGCAAAATGGTGGGGCGGATGATGGGACGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780936.1
MAVRNLASKFSFLKHLRPNSTPLSPLFSHSQIIFQSSSIVSRSIPPAAGNRVIVGQICNFGGFHSGRVLRNAEPEVGQNGGADDGTSAGRATKRKKLKGKRAVVRWLKHFRYKKKKSYERMTAEEKILYKLMKARRKEERLLEALRKIEPKETSDTMHDPEILTPEEHFYFLKMGEKSKNYVPVGRRGLYQGVILNMHLHWKKHQTLKVIVKTFSPEEVKEIASELARLSGGIVLDIQEDNTIIMYRGKNYCQPPTEIMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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