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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004779`

染色体: Chr08 坐标: 57117938-57122542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004779`
名称	SmilChr08G004779
描述	serine carboxypeptidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57117938 - 57122542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999448`
GeneID	`130999448`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999448`
原始查询	`SmilChr08G004779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase 1-like
产物	serine carboxypeptidase 1-like
Arabidopsis	`AT4G12910` (scpl20) serine carboxypeptidase-like 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826903] identity=67.3; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0257000` (CBP1) - identity=65.3; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups); GO:0019748 (secondary metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999448

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057780958.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057780958.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780958.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780958.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57118246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B129,B131,B28,C42
`Chr8:57118277`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:57118277`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57118763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B98,C43,C5,C79
`Chr8:57118770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B98,C43,C5,C79
`Chr8:57118787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B98,C43,C5,C79
`Chr8:57119035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:57119037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:57119076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:57119089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr8:57119219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B99,C17
`Chr8:57119237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780958.1

492 aa

246

492

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 37-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780958.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	37	488	1.2e-136	457.2	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924975.1
AAAACAAATAAAGGGAAAAACAAAAAAACAAAAGTGTAATGGAATTCCACTGTAATAACCTCCCCCACTTTTGCTCCACACTTTACTTGTAAGCTAAACTAAGACTCCAACAACACCCAAGTCAAAATATATATAACCCCAATCTTCACAGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTGCTTGGAAATTCAAGAAATAATTTATCAAAAAATCTCCTCTTTTTTCCATTTTGCAAAATGAGATTTTTACACCCTTTTCACTGTGTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999448
ATGAGATTTTTACACCCTTTTCACTGTGTGGGTCTTATTTTGATTCAAATTGCATTCAGCTCGAATCCAGCATTCTCAGCTCCTGATGGAGCTCTTGTTACAGAGCTTCCTGGTTTCAATGGCAGCTTCCCTTCCAAACACTATTCTGGGTATGTCACCATTGATGAGAAGAAATTGTATTACTATTTTGTGGAGTCTGAGGGGAATCCATCCAAGGACCCTGTTGTGCTCTGGCTCAACGGTGGGCCCGGTTGCTCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780958.1
MRFLHPFHCVGLILIQIAFSSNPAFSAPDGALVTELPGFNGSFPSKHYSGYVTIDEKKLYYYFVESEGNPSKDPVVLWLNGGPGCSSFDGFIYEHGPFNFAKDPLGGFPTLHPNPYSWSKVSSMIYLDSPAGVGLSYSTNTSDYITGDLKTASDSHTFLLKWFELYPEYQSNPFYISGESYAGIYVPTLAYEVANGIDAGAKPILNLKGYLVGNGVADDVFDGNALVPFAHGMGLISDELFEAVNSECNGVYYNPTSQNC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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