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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004780`

染色体: Chr08 坐标: 57130694-57133417 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004780`
名称	SmilChr08G004780
描述	uncharacterized SmilChr08G004780
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57130694 - 57133417 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999456`
GeneID	`130999456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999456`
原始查询	`SmilChr08G004780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G07470` (AT3G07470) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935] identity=55.9; qcov=0.8; evalue=8.13e-51; confidence=high
Rice	`Os01g0913100` - identity=62; qcov=0.665; evalue=2.35e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057780966.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057780966.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057780966.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780966.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57131171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B135,C6
`Chr8:57131176`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B7
`Chr8:57131176`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B7
`Chr8:57131278`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	66	A14,A15,A2,A21,A3,A8,B100,B102,B11,B110,B115,B118,B120,B130,B131,B136,B16,B18,B2,B28,B31,B32,B36,B38,B47,B53,B54,B62,B69,B78,B79,B80,B81,B87,C1,C10,C15,C20,C21,C22,C23,C26,C28,C34,C42,C46,C50,C54,C58,C59,C62,C63,C66,C67,C70,C72,C73,C76,C78,C82,C85,D10,D11,D4,D8,D9
`Chr8:57131282`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	68	A14,A15,A2,A21,A3,A8,B100,B102,B11,B110,B115,B118,B120,B130,B131,B136,B16,B18,B2,B27,B28,B31,B32,B36,B38,B47,B53,B54,B62,B69,B78,B79,B80,B81,B87,C1,C10,C15,C20,C21,C22,C23,C26,C28,C34,C42,C46,C50,C54,C58,C59,C62,C63,C66,C67,C70,C72,C73,C75,C76,C78,C82,C85,D10,D11,D4,D8,D9
`Chr8:57131376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:57131459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780966.1

170 aa

170

DUF538

PF04398 DUF538 32-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780966.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	32	139	7.9e-31	107.6	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093521.1
AAATCATAAAACAAAACAACCAATTATTTCACCACTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTTCCCAACCTCATCCGCCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGCGCCACCGCCCTTACCGAAATCCAGAAACCCAACATGCCATAGCCCCCCCAAATCAACAAACCCAAAAAGAAAAATTTCAAAAAATGCTCTCCCCGCGCGATTTACTCTCTCTCTCTCTACTAATCTGCTCATCATTAGTAATACTCCCATTCTCTCACTGCGTGGAA...

XM_057924983.1
TGCTCATCAATTATCACCCACTCCTCCCCCACTGGACCACACTCCATTACTCGCCCATCCATTCAAAATCCACCACGTGTCCACATCAAAATTCCAAAATCCCCATTTTACCCCTAAAGTCACAATCTCCTTCATCCGCCACGTGCCCAAAATCATAAAACAAAACAACCAATTATTTCACCACTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTTCCCAACCTCATCCGCCGCAGCCGCCGCCGCCGCGGCGCCACCGCCCTTACCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999456
ATGCTCTCCCCGCGCGATTTACTCTCTCTCTCTCTACTAATCTGCTCATCATTAGTAATACTCCCATTCTCTCACTGCGTGGAAGAAGCCTCAATCTACGAAGCTCTGCAGCTCCACGGCCTCCCGATGGGCCTCCTCCCCAAAGGGATCAAGAACTTTACGCTGGAAAGTTCCGGAATGTTCGAGGCCCGCCTCGACCGCGCCTGCAACGCCAAGTTCGAGAACGAGCTCCACTACGACATGAGAGTCTCCGGCGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780966.1
MLSPRDLLSLSLLICSSLVILPFSHCVEEASIYEALQLHGLPMGLLPKGIKNFTLESSGMFEARLDRACNAKFENELHYDMRVSGALRYGRIDEVSGISAQDLFLWFPVIGIRVDVPSSGLIYFDVGVVSKQFSLSSFETPRDCFAVAQIPSEKVQPYELDHGNAARTTW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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