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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004781`

染色体: Chr08 坐标: 57136023-57139282 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004781`
名称	SmilChr08G004781
描述	probable sodium/metabolite cotransporter BASS3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57136023 - 57139282 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999450`
GeneID	`130999450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999450`
原始查询	`SmilChr08G004781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sodium/metabolite cotransporter BASS3, chloroplastic
产物	probable sodium/metabolite cotransporter BASS3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G25410` (AT3G25410) Sodium Bile acid symporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822125] identity=73.5; qcov=0.895; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0475400` (BASS3) - identity=70.6; qcov=0.857; evalue=7.26e-170; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01758 (SBF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780960.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057780960.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780960.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780960.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57136305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:57136321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B127,B60,C49,D6
`Chr8:57136327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:57136340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B4,C22,C40
`Chr8:57136350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr8:57136524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:57137486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:57137525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:57137641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:57137871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B140,C71
`Chr8:57137885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr8:57137903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B140,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780960.1

421 aa

210

421

SBF

PF01758 SBF 134-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780960.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	134	312	3.6e-33	115.6	Sodium Bile acid symporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924977.1
TAGTGGTGTGATATAGATCAACGACACAACTTATTTTCATGTGATATCCATGTGATTACAACCAATCAAATTACTCCACCTATAAATATAGCATTATAAATAAATAATTTTATTTGTGACATCAAACGTGAATATATAATAATTATTCTATTAAAAAAACACTTTAATTATTACCTTATCACCTCCTCCTCCACCGCCGCCGTCCACAACTCGCCGGGAAACTCTCAGTTTCCTCCGGCGAGCCAAAGCAATGTCACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999450
ATGTCACAAACGCCTTGCCTCTCGCTCCAAACCGCCCCCAAAACACTTCTCCTCCGCCGTATCTCCGCCTCCAAGAGCTCAATTCCCATAAAAAGCAATCTCTTCTCTCCGATTCCAAACGCGATTTCGGGAAACTGCAGAGGTGTTAAACGGGGCTCTTTGATCGCCGTTGGGTGCTCAACTTCGTCGCCCTTCATAGGGAGGGTTGGGCTGCACAAACGGGAGGGGAATTTCACGCTGCTTTCATTCGGCGCCGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780960.1
MSQTPCLSLQTAPKTLLLRRISASKSSIPIKSNLFSPIPNAISGNCRGVKRGSLIAVGCSTSSPFIGRVGLHKREGNFTLLSFGAESTIAAAEDKSDASQVLSALLPVVVALTAVAALSKPSTFTWVSRELYAPALGGIMLSIGIRLSIDDFALAFKRPLPLSVGFMAQYALKPVLGVVVARAFGMSPMFYAGFVLMACVAGAQLSSYASFLSKGDVALSILLTSSSTIASVLVTPLLTGLLIGSVVPVDAVAMSKSILQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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