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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004806`

染色体: Chr08 坐标: 57363286-57365842 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004806`
名称	SmilChr08G004806
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57363286 - 57365842 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999468`
GeneID	`130999468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999468`
原始查询	`SmilChr08G004806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=38.82; qcov=0.98; evalue=1.69e-70; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=27.01; qcov=0.963; evalue=5.58e-40; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13191 (AAA_16); PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999468

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780980.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57363930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B130,B139
`Chr8:57363988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:57363997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B49,C73
`Chr8:57364018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C19
`Chr8:57364560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B13,B95,C54
`Chr8:57364611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr8:57364639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B41,B53,C50
`Chr8:57364669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B130,B65
`Chr8:57364698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B132,B70,C21
`Chr8:57364711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B132,B70,C21
`Chr8:57364712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:57364717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780980.1

405 aa

202

405

Rx_N

AAA_16

NB-ARC

PF18052 Rx_N 5-89 aa PF13191 AAA_16 168-286 aa PF00931 NB-ARC 172-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780980.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	89	3.5e-20	72.6	Rx N-terminal domain
`XP_057780980.1`	Pfam	`PF13191`	AAA_16	Domain	168	286	2e-08	35.7	AAA ATPase domain
`XP_057780980.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	172	345	2.1e-36	125.8	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924997.1
TTTCTCATAAGCTAAACTACTTTCACACTTTTGCCCGCAAACGAAAGTCAAACCTCTCCCTTCTTCCTCATACAACTCTCCAAGAACTAATTTCTCTGTTCCAGAAAATCCAAATTCTTCGCAATCTCCATTGAAGAATTTGTATTCACAACAACGAGTTCCATATCCTTATTCCTCTCTATATACTCTCACCAATACTAAATCAGTTTGACCAAAGAAATTCGAGTTTGGAATTGTTGCGATGGCAGAAGCTGTTGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999468
ATGGCAGAAGCTGTTGTGTCGACTGCTCTGGAAACCTTGCGCGATTTGTTGGTGGATGAAGCAAGGTTTTTATCTGGTGTGGGTGACCAAGTGAAAGAGCTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTCTTCTCAAAGATGCCGAAAGAAGACGACATGAAAATGAAACCATTTTCAATTGGATCTCAGAGATCAAAGATCTTGTGTACATAGCAGAAGCTGCCATTGAAAGACACGCAGCTCATCAAGTGACTTCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780980.1
MAEAVVSTALETLRDLLVDEARFLSGVGDQVKELEIQLKEMKCLLKDAERRRHENETIFNWISEIKDLVYIAEAAIERHAAHQVTSRRRRGLRQLVRKCSCSLEEYKSIHQLGSEISPIKSRLERINKEMLESGIKKSIINNTDEGESSSANNRARKSFPEFEIGECFVGMKDELKQLLHLLLEDEKHRVISVWGMGGSGKTTIAKKLYNETNTSFDLCAWVCISQQCQSFQSVWNDVLMQLQHQNTKDGPKIRKDVTSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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