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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004809`

染色体: Chr08 坐标: 57402066-57404461 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004809`
名称	SmilChr08G004809
描述	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57402066 - 57404461 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999471`
GeneID	`130999471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999471`
原始查询	`SmilChr08G004809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, chloroplastic-like
产物	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G45440` (DHDPS2) dihydrodipicolinate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819152] identity=80.6; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0574800` - identity=78.1; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008840 (4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase activity); GO:0009089 (GO:0009089)
KEGG	smil00261 (Monobactam biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00300 (Lysine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00701 (DHDPS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780984.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057780984.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780984.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780984.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780984.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57402327`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B119,B37,B5,B69,C32,C43,C49,C68,C7,C71,D2
`Chr8:57402393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B61
`Chr8:57402467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B28,B98,C24,C58
`Chr8:57402480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:57402490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:57402555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B122,C76,D8
`Chr8:57402589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr8:57402658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57402762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B28,B98,C24,C58
`Chr8:57402791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:57402819`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	B102,B123,B127,B131,B42,B45,B65,B78,B79,B91,C30,C34,C35,C4,C5,D3
`Chr8:57402913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780984.1

352 aa

176

352

DHDPS

PF00701 DHDPS 53-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780984.1`	Pfam	`PF00701`	DHDPS	Domain	53	326	1.2e-91	307.2	Dihydrodipicolinate synthetase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925001.1
TCCCCCGCCTACCAATCAAAATCTCGCCGCCGCCACCTCCGCCGCTCCTCCGCCTTTCCGCCGCCGCGCTCACGCAAATTAAGCTAGCGACTGTTGGAGTTGAACAAATAAAGTGTAATGCAGCTGTGCTGCTCCTCTCAAAGCGCCAGTCATTCCGGCGGATGCGGAGCCACAGCCACCGCACGTTGCCGGCGAATTAAGTGAAATCGCGTTTTATTCCTCAAATCGATCGCATTATTTCTCCGTTTGAATCATTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999471
ATGGCGTCGGCTATCGGATGCTATTCTCTCAATGGTAGCCATCGAGGAGGGATCCCAAAATGGAGGTCACCTAGGGCAGCTGTAATCCCCACTTTTCATCTTCCAATGCGTAGTTATGAAGTTAAAAACAGGACTAATGTTGATGACATAAAGTCGCTTAGGTTGATTACAGCCATCAAAACACCTTATTTGCCGGATGGTAGATTCGACCTTGAGGCCTACGATGCCCTGATGAACGTGCAGATCAACGACGGTGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780984.1
MASAIGCYSLNGSHRGGIPKWRSPRAAVIPTFHLPMRSYEVKNRTNVDDIKSLRLITAIKTPYLPDGRFDLEAYDALMNVQINDGVEGVIVGGTTGEGQLMSWDEHIMLIGHTVNCYGGSIKVIGNTGSNSTREAIHATEQGFAVGMHAALHINPYYGKTSLEGLIAHFNSVLPMGPTIVYNVPSRTGQDIPPDVIKKIAKSPNLAGVKECVGHGRVEQYMSSGVVVWSGNDDQCHDSRWDHGATGVISVASNLVPGLMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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