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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004812`

染色体: Chr08 坐标: 57420582-57424093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004812`
名称	SmilChr08G004812
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57420582 - 57424093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999474`
GeneID	`130999474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999474`
原始查询	`SmilChr08G004812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290-like
产物	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290-like
Arabidopsis	`AT3G25290` (AT3G25290) Auxin-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822123] identity=54.1; qcov=0.987; evalue=2.61e-133; confidence=high
Rice	`Os08g0524200` (OJ1191_A10.101) - identity=52.7; qcov=0.919; evalue=5.93e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561); PF04526 (DUF568)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780986.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780986.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780986.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780986.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57420630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B4,B48,B79
`Chr8:57420650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:57420658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:57420869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C76,D8
`Chr8:57420908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:57420915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B40,C62
`Chr8:57420975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B50,C12,C83
`Chr8:57421013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:57421026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B40,C62
`Chr8:57421035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57421040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B94,C23,C32,C68
`Chr8:57421137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780986.1

384 aa

192

384

DUF568

Cytochrom_B561

PF04526 DUF568 88-189 aa PF03188 Cytochrom_B561 212-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780986.1`	Pfam	`PF04526`	DUF568	Family	88	189	8.1e-27	94.6	Protein of unknown function (DUF568)
`XP_057780986.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	212	336	2.9e-06	28.3	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925003.1
ACCGCCATGCATGCCTTCCTCCGCCCATGACCAATGGCTTCTCTCCCCCACACTCTCATCTTCCTCCTCGCGCTAGCTTCGCTACTCTCACCGTCACAGCCGGCGGCGCCGTGCGCGTCGCGGCGCTTCTCCAACGGCAAAACCTACGCCCTCTGCGCCGACCTCCCCGCCCTCGGCGCCTCCCTCCACTGGGCCTACGACGAGGCCCGCTCGGCCCTCGCGGTCGCCTTCGTGGCCGCCCCGGCCCGGCCCGACGGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999474
ATGGCTTCTCTCCCCCACACTCTCATCTTCCTCCTCGCGCTAGCTTCGCTACTCTCACCGTCACAGCCGGCGGCGCCGTGCGCGTCGCGGCGCTTCTCCAACGGCAAAACCTACGCCCTCTGCGCCGACCTCCCCGCCCTCGGCGCCTCCCTCCACTGGGCCTACGACGAGGCCCGCTCGGCCCTCGCGGTCGCCTTCGTGGCCGCCCCGGCCCGGCCCGACGGCTGGATCTCGTGGGCCATCAACCCCACGGGCTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780986.1
MASLPHTLIFLLALASLLSPSQPAAPCASRRFSNGKTYALCADLPALGASLHWAYDEARSALAVAFVAAPARPDGWISWAINPTGSGMRGSQALVAFRGAGGGMTVKTFNVSAYALDAAADKVWFEVEESAAESSGGVMTLFASLVLPEKGITVVNHVWQVGGAVDGGEKPEGHGFEPDNMNAEGSLDLLSGIAGGGPGAGGDYRTKRRNIHGLLNVISWGFMFPAGAMIARYLRVFPSADPAWFYLHVSCQLSAYAIGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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