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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004813`

染色体: Chr08 坐标: 57426796-57434070 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004813`
名称	SmilChr08G004813
描述	auxin-induced in root cultures protein 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57426796 - 57434070 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999475`
GeneID	`130999475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999475`
原始查询	`SmilChr08G004813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-induced in root cultures protein 12-like
产物	auxin-induced in root cultures protein 12-like
Arabidopsis	`AT3G07390` (AIR12) auxin-induced in root cultures-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819927] identity=44.7; qcov=0.972; evalue=5.61e-48; confidence=medium
Rice	`Os08g0524400` (OJ1191_A10.104) - identity=48.6; qcov=0.723; evalue=2.61e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04526 (DUF568)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780987.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780987.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780987.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780987.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780987.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57427035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C40,C9
`Chr8:57427047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:57427120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:57427152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:57427266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B122,D8
`Chr8:57427288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A25,B8,D10
`Chr8:57427289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B88,C65
`Chr8:57427295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:57427331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:57427354`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	B10,B131,B28,B30,B56,B68,B82,B84,B91,B95,B96,B99,C28,C42,C43,C47,C53,C63,C67,C80,C86
`Chr8:57427368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B65,B74,C11,C69
`Chr8:57427379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780987.1

253 aa

126

253

DUF568

PF04526 DUF568 94-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780987.1`	Pfam	`PF04526`	DUF568	Family	94	195	1.3e-25	90.8	Protein of unknown function (DUF568)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925004.1
TGATCAATGGGAAGCGTGGGCAATATGTTAACCACAAAGACACATATTAATAGCAGTGGGGTATAAATCAAGAAGAATTTCCCCAACTGATAGTTAAACCTCATAACTATACACACACCCCACCACCACCACCACCACCAATCATGGCCTCCTCTCCGCCGCTCACCTCCGCCTCCCTCCTCCTCCTCGCCGCCGCCGTCGCCCTCCACCTCCCCGCAGCGGCCTCCCAAGCATGCAAATCCCAAACATTCTCCACCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999475
ATGGCCTCCTCTCCGCCGCTCACCTCCGCCTCCCTCCTCCTCCTCGCCGCCGCCGTCGCCCTCCACCTCCCCGCAGCGGCCTCCCAAGCATGCAAATCCCAAACATTCTCCACCGCCAAATTCGCCAACTGCACGGACCTCCCCACCCTCAACGCCTCCCTCCACTGGACCTACGACGCCGCCGCGAGGCCCGGCCCGAAGCTGAGCATCGCGTACGTCGCCCCTCCGGCCCGGCCCGACGGCTGGATCGCGTGGGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780987.1
MASSPPLTSASLLLLAAAVALHLPAAASQACKSQTFSTAKFANCTDLPTLNASLHWTYDAAARPGPKLSIAYVAPPARPDGWIAWALNPTSSGMLGAQALVAFGDGDGAGAVAVKTYNISSYGPIAESEIAYAVTGRRAERSGGVIRLFATLALPAGSSGAAAVNQVWQVGAAVRGGVPVKHDFLPENLKSMGSLLLTSAEDGSPAPAPESGGGGNTPSIPRGNNLGGSGRNYGGGFFGVYGVLVLLCVFLGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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