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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004820`

染色体: Chr08 坐标: 57486713-57487612 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004820`
名称	SmilChr08G004820
描述	uncharacterized SmilChr08G004820
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57486713 - 57487612 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998814`
GeneID	`130998814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998814`
原始查询	`SmilChr08G004820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein, putative (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819923]; symbol=AT3G07350; hit=AT3G07350; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein, putative (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819923]; symbol=AT3G07350; hit=AT3G07350; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07350` (AT3G07350) sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein, putative (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819923] identity=39.7; qcov=1.02; evalue=7.35e-65; confidence=medium
Rice	`Os11g0437600` - identity=36.5; qcov=1; evalue=2.41e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780203.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780203.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780203.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780203.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780203.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57486737`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr8:57486737`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr8:57486739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C39,C74,D7
`Chr8:57486806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:57486908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B32,B47,B55
`Chr8:57487060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B47,B55
`Chr8:57487108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,A7,B107
`Chr8:57487270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:57487297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C15,C35
`Chr8:57487336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57487357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:57487414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B73,B88,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780203.1

299 aa

150

299

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 76-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780203.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	76	256	1.1e-58	199.5	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924220.1
ATGAAATCGAGTTTTATGAGAATAAAGAGAGTGACTGACCCGTTCGACGAGAATGCGAAGGCGCGGATCGTCGGCGGTTATATGACCCGACCCGATTACGTCAGCAGCGGCAGCGGCAGCGACCACAGCGCGCAAGCCGACGATGACGTCACCTCCTCGAACCTCTCCGCGCTCTTCATCGGCTGCGGCGACGACGCAGAAGCGGCGGAACCGGCGGCGGAAGGCGGCGAGGGCGCGGATGCGGAGCGGGATCGGTCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998814
ATGAAATCGAGTTTTATGAGAATAAAGAGAGTGACTGACCCGTTCGACGAGAATGCGAAGGCGCGGATCGTCGGCGGTTATATGACCCGACCCGATTACGTCAGCAGCGGCAGCGGCAGCGACCACAGCGCGCAAGCCGACGATGACGTCACCTCCTCGAACCTCTCCGCGCTCTTCATCGGCTGCGGCGACGACGCAGAAGCGGCGGAACCGGCGGCGGAAGGCGGCGAGGGCGCGGATGCGGAGCGGGATCGGTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780203.1
MKSSFMRIKRVTDPFDENAKARIVGGYMTRPDYVSSGSGSDHSAQADDDVTSSNLSALFIGCGDDAEAAEPAAEGGEGADAERDRSISESVDLIGRIVENESDAFRNKLRVQVWRAAEIFACLRSNKQMMRRNVMAYLRNCGYNAAVCKTKWGSCGGLTGGSYEFVDVVDSAPGKTRYVVDFDFAAEFAIARPTSSYERLLRRMPGIFVGSAEELRQILRAVSDAARWSLKSGGLIMPPWRKHRFMQSKWLGPYRRTTSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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