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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004821`

染色体: Chr08 坐标: 57491507-57497574 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004821`
名称	SmilChr08G004821
描述	adenylyltransferase and sulfurtransferase MOCS3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57491507 - 57497574 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999485`
GeneID	`130999485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999485`
原始查询	`SmilChr08G004821`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylyltransferase and sulfurtransferase MOCS3
产物	adenylyltransferase and sulfurtransferase MOCS3
Arabidopsis	`AT5G55130` (CNX5) co-factor for nitrate, reductase and xanthine dehydrogenase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835604] identity=67.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0804600` (OsStr15) - identity=52.9; qcov=1.05; evalue=1.93e-173; confidence=high
GO	GO:0002143 (tRNA wobble position uridine thiolation); GO:0004792 (thiosulfate-cyanide sulfurtransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0042292 (URM1 activating enzyme activity); GO:0070566 (adenylyltransferase activity)
KEGG	smil04122 (Sulfur relay system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00581 (Rhodanese); PF00899 (ThiF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781007.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057781007.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057781007.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781007.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57491803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:57491834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57491837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:57491889`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr8:57491889`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr8:57491956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr8:57491963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr8:57492025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,B73,B88,C23,C37
`Chr8:57492127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B111,B63,B91,C82
`Chr8:57492724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B64,C24,C55,C58
`Chr8:57492746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57492811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781007.1

467 aa

234

467

ThiF

Rhodanese

PF00899 ThiF 72-307 aa PF00581 Rhodanese 356-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781007.1`	Pfam	`PF00899`	ThiF	Domain	72	307	2.4e-81	273.1	ThiF family
`XP_057781007.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	356	458	2.2e-10	41.6	Rhodanese-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925024.1
GAATTGAGGTTCACGAATTGATTCGAAAAAGTTTCGTCGAAAATCTTCACAATTTAATGATTGATAAATAAATTTATTTTATCCGCTCCATAGTATTTTCATAGATTTTTTTAAAGTAGCGAGTTAAAATTCATAAAAATTTATTACGATAAAACCCTAACTCCCATCCCATTTTATTCAAACTATCTCACTTCACACTTCGAGCTAGAAAACAGTACGAGCGGGGCTGCCATGAATTCCAACGGCGTCGGCGAGACGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999485
ATGAATTCCAACGGCGTCGGCGAGACGGCGGCGGATATCCGCCGGGAAATCGCCGCTCTACAGAAAGAAAAGGCGGCTATCGACGACCGTATATCAGCTCTGCAAGCGCAGCTCAGCACCTGCGCCTCAGAAGATGGAACCAACGGCGTCAACTGCTGCGCCCGACCGGAGCCGCCTACTGGCGCCAAATTATCGGCGGATATGATATATAGGTACAGCCGCCAGCTGATCCTTCCTTCGTTCGGCGTTGAAGCGCAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781007.1
MNSNGVGETAADIRREIAALQKEKAAIDDRISALQAQLSTCASEDGTNGVNCCARPEPPTGAKLSADMIYRYSRQLILPSFGVEAQANLLKSSVLVIGAGGLGSPALLYLAACGVGRLGIVDHDVVELNNLHRQIIHTEAYIGRSKVESAAAACRSINSTVQIVEHKEAFRTSNALEIMRDYDIVVDATDNVPSRYMISDCCVVLGKPLISGAALGLEGQLTVYNFNGGPCYRCLFPTPPPATACQRCSDSGVLGVVPGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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