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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004853`

染色体: Chr08 坐标: 57729782-57733160 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004853`
名称	SmilChr08G004853
描述	oleoyl-acyl carrier protein thioesterase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57729782 - 57733160 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999513`
GeneID	`130999513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999513`
原始查询	`SmilChr08G004853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oleoyl-acyl carrier protein thioesterase, chloroplastic-like
产物	oleoyl-acyl carrier protein thioesterase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G13050` (AT4G13050) Acyl-ACP thioesterase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826919] identity=74.4; qcov=0.897; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0505300` - identity=78.4; qcov=0.751; evalue=8.48e-160; confidence=high
GO	GO:0000036 (acyl carrier activity); GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0016297 (fatty acyl-[ACP] hydrolase activity)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01643 (Acyl-ACP_TE); PF20791 (Acyl-ACP_TE_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781035.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057781035.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781035.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781035.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57729956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B56,B96,D3
`Chr8:57730011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B103,B139,C4
`Chr8:57730122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,C78
`Chr8:57730172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B103,C4
`Chr8:57732631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr8:57732706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C69
`Chr8:57732709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr8:57732774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C50,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781035.1

370 aa

185

370

Acyl-ACP_TE

Acyl-ACP_TE_C

PF01643 Acyl-ACP_TE 81-217 aa PF20791 Acyl-ACP_TE_C 253-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781035.1`	Pfam	`PF01643`	Acyl-ACP_TE	Domain	81	217	5.3e-46	156.3	Acyl-ACP thioesterase N-terminal domain
`XP_057781035.1`	Pfam	`PF20791`	Acyl-ACP_TE_C	Domain	253	365	1.7e-29	102.7	Acyl-ACP thioesterase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925052.1
CCACCCACCCCTGGGGTGGTGCATCGTTCATATCGACGAACACTACTAAAGAGCGCACGCGCACTATAATATAATCAAATTTTTAATTTTTAATTTTGTGTGGCAAGCAATTCGCTGTGAATTTACATAAATCCCAAATAAAATCCGAATTGCTAGAGCCGCCAATGTTGCTGAGGGGAGGGGCTTTCTCGGCATGCAGCGCCGCCGCCGATAGCAGCGGCAATTGCCGGATTTCCGGCGTGATTCGGCCGCCGCCTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999513
ATGTTGCTGAGGGGAGGGGCTTTCTCGGCATGCAGCGCCGCCGCCGATAGCAGCGGCAATTGCCGGATTTCCGGCGTGATTCGGCCGCCGCCTTCGGTGGCTCGGTGCGGCCGGCAGGGGAGGGCCGCCCCGCTCCGGGTGGCGTCGGTGGCGACGGGCGAGCAGAAGAGCAAGGCGCAGGAGCCGAGCTGCCAGCCGAGCCTCGCCGACCGGCTGCGGCTCGGCAGCTTGAACGAAGACGGCTTGTCGTATAAGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781035.1
MLLRGGAFSACSAAADSSGNCRISGVIRPPPSVARCGRQGRAAPLRVASVATGEQKSKAQEPSCQPSLADRLRLGSLNEDGLSYKEKFIVRCYEVGINKTATVETIANLLQEVGCNHAQYVGFSTDGFATTLTMRKYHLIWVTARMHIEIYKYPAWSDVVEIETWCQSEGRIGTRRDWILKDYSTGEVIGRATSKWVMMNQDTRRLQKVTDEVRDEYLVYCPKTLRLAFPEENNASLKKIAKLDDPADHYKVGLVPRRAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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