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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004869`

染色体: Chr08 坐标: 57836270-57836734 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004869`
名称	SmilChr08G004869
描述	uncharacterized SmilChr08G004869
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57836270 - 57836734 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998826`
GeneID	`130998826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998826`
原始查询	`SmilChr08G004869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF538 family protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841971]; symbol=AT1G55265; hit=AT1G55265; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF538 family protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841971]; symbol=AT1G55265; hit=AT1G55265; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G55265` (AT1G55265) DUF538 family protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841971] identity=52.9; qcov=0.786; evalue=2.32e-39; confidence=medium
Rice	`Os03g0692700` (OSJNBb0021O11.27) - identity=45.7; qcov=0.753; evalue=5.04e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057780214.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057780214.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780214.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780214.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57836300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:57836318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,A3
`Chr8:57836661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B2,B7
`Chr8:57836701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780214.1

154 aa

154

DUF538

PF04398 DUF538 26-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780214.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	26	135	4.3e-28	98.7	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924231.1
ATGGCACACTTCGCCATAGCACTACTCTCTCTCATCTTCCTCTCTTCAGCGCACCTCTCTCTCGCCGCGATCGACGTCCACGACCTTCTCCCTCTCTTCAACCTCCCCAAGGGGATTATACCGCGGGAAATAAAGTCGTTTTCCTTCTCCAACACCGACAATTCCTTCACGCTCGAGCTGAGCTCAAACCCTTGCTACGTCACATTCGACGATCAGCTCGTCTTCTACGACAGGATCATCAAGGGGAAGCTCGAGTACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998826
ATGGCACACTTCGCCATAGCACTACTCTCTCTCATCTTCCTCTCTTCAGCGCACCTCTCTCTCGCCGCGATCGACGTCCACGACCTTCTCCCTCTCTTCAACCTCCCCAAGGGGATTATACCGCGGGAAATAAAGTCGTTTTCCTTCTCCAACACCGACAATTCCTTCACGCTCGAGCTGAGCTCAAACCCTTGCTACGTCACATTCGACGATCAGCTCGTCTTCTACGACAGGATCATCAAGGGGAAGCTCGAGTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780214.1
MAHFAIALLSLIFLSSAHLSLAAIDVHDLLPLFNLPKGIIPREIKSFSFSNTDNSFTLELSSNPCYVTFDDQLVFYDRIIKGKLEYGKVSGVSGIQAKKFFIWVSVTGMEVDEENDLIEFHVGALSKKLPAADFQRVPSCKSKGLRDLSSSASI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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