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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004884`

染色体: Chr08 坐标: 57913975-57918155 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004884`
名称	SmilChr08G004884
描述	nuclear transport factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57913975 - 57918155 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999538`
GeneID	`130999538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999538`
原始查询	`SmilChr08G004884`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transport factor 2-like
产物	nuclear transport factor 2-like
Arabidopsis	`AT3G25150` (AT3G25150) Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein with RNA binding (RRM-RBD-RNP motifs) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822106] identity=50; qcov=0.87; evalue=5.35e-112; confidence=high
Rice	`Os04g0372800` - identity=49.6; qcov=0.987; evalue=4.94e-104; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF02136 (NTF2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781072.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057781072.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057781072.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781072.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057781072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57914410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:57916582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:57916673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:57917043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:57917086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B140,B61,D4
`Chr8:57917119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:57917376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C12
`Chr8:57917469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B48,B5,C9
`Chr8:57917648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781072.1

479 aa

240

479

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 24-140 aa PF00076 RRM_1 305-363 aa

XP_057781073.1

478 aa

239

478

NTF2

RRM_1

PF02136 NTF2 24-140 aa PF00076 RRM_1 304-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781072.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	24	140	4.4e-32	111.7	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057781072.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	305	363	2.4e-12	47.2	RNA recognition motif
`XP_057781073.1`	Pfam	`PF02136`	NTF2	Domain	24	140	4.3e-32	111.7	Nuclear transport factor 2 (NTF2) domain
`XP_057781073.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	304	362	2.4e-12	47.3	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925089.1
TGCCACAAAAATTCTCTCTCTCTCTCTCACACGCACACACACACATGTATATATAGTATATATACGCATTGATTAAATCTTGAAGAAAACCCTTTTTCCCACCTTCCCATTCGAGATCCACCACTCCTCCACCGCATTCGCCTCTTAAACCCTAGAAACCACCGCCGGGGCTGCGGGAATCACTCGCCGGAGTTTTTCAGAGATTCGGAGCTGAAGTCAGAAGTAGAGGGAGAAATAACCGAGGTCCGGTTTCTCTCTCC...

XM_057925090.1
TCTCTCTCTCTCTCACACGCACACACACACATGTATATATAGTATATATACGCATTGATTAAATCTTGAAGAAAACCCTTTTTCCCACCTTCCCATTCGAGATCCACCACTCCTCCACCGCATTCGCCTCTTAAACCCTAGAAACCACCGCCGGGGCTGCGGGAATCACTCGCCGGAGTTTTTCAGAGATTCGGAGCTGAAGTCAGAAGTAGAGGGAGAAATAACCGAGGTCCGGTTTCTCTCTCCGCGCTCTTTGATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999538
ATGGCAGCACCAGCGGCGGAGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGAGACTCCGCAACCGGTTACTGCTCAAGTTGTCGGAAACGCATTTGTGACGCAGTACTATCACATACTGCATAAGTCACCAGGGCTTGTTCACAAATTTTATCAGGATGTCAGTAAGCTTGGTCGTCCTGAGGAGGATGGCTCCATGAGCATCACCACCACTATGCAAGCCATCAACGACAAAATTGTTTCGCTCAACTACTGGGACTTCACAGCTGAGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781072.1
MAAPAAEVAVAVAETPQPVTAQVVGNAFVTQYYHILHKSPGLVHKFYQDVSKLGRPEEDGSMSITTTMQAINDKIVSLNYWDFTAEIKSVDSQESFNGGVHVLVTGYLTGKDSKVSHFAQSFFLAPQDRGYFVLNDMFRYVNNFDANPALVPDVVAPVPEEPAAPVPAPENHVSEQSTPSAEEAVSGEVYNPPENGDVPITEEVEEEEEVPVPEVVDEVQDNTEPMVETPAKTEAPKKSYASIVMHLKETAATFSPPPTA...

XP_057781073.1
MAAPAAEVAVAVAETPQPVTAQVVGNAFVTQYYHILHKSPGLVHKFYQDVSKLGRPEEDGSMSITTTMQAINDKIVSLNYWDFTAEIKSVDSQESFNGGVHVLVTGYLTGKDSKVSHFAQSFFLAPQDRGYFVLNDMFRYVNNFDANPALVPDVVAPVPEEPAPVPAPENHVSEQSTPSAEEAVSGEVYNPPENGDVPITEEVEEEEEVPVPEVVDEVQDNTEPMVETPAKTEAPKKSYASIVMHLKETAATFSPPPTAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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