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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004899`

染色体: Chr08 坐标: 58015918-58019179 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004899`
名称	SmilChr08G004899
描述	GTP-binding protein BRASSINAZOLE INSENSITIVE PALE GREEN 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58015918 - 58019179 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999553`
GeneID	`130999553`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999553`
原始查询	`SmilChr08G004899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding protein BRASSINAZOLE INSENSITIVE PALE GREEN 2, chloroplastic-like
产物	GTP-binding protein BRASSINAZOLE INSENSITIVE PALE GREEN 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G10620` (AT4G10620) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826654] identity=58; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0364500` - identity=54.2; qcov=0.863; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF21516 (YqeH-like_C); PF28564 (GEP3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057781097.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057781097.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781097.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781097.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58016071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B76,C34,C5,C87
`Chr8:58016207`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr8:58016207`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr8:58016392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C29
`Chr8:58016459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:58016504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,C14,C46,C54
`Chr8:58016545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:58016593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B120,B19,B48,B56
`Chr8:58016612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr8:58016638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B104,B120,B19,B56
`Chr8:58016644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:58016674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781097.1

627 aa

314

627

GEP3_N

MMR_HSR1

YqeH-like_C

PF28564 GEP3_N 96-199 aa PF01926 MMR_HSR1 339-413 aa PF21516 YqeH-like_C 455-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781097.1`	Pfam	`PF28564`	GEP3_N	Domain	96	199	1.6e-09	39.1	Genetic interactor of prohibitins 3 N-terminal domain
`XP_057781097.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	339	413	3.4e-10	40.8	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057781097.1`	Pfam	`PF21516`	YqeH-like_C	Domain	455	553	1.8e-09	38.7	YqeH-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925114.1
GTTGAAGGCGGCATTCAAAACCTTAAACCTCCATAGCTGAAACGCAAGGAAAACGATGATAGTGAGGAATCTCTCTCCCTCAAGGCTCAGAAAGCTTCTCACTCCATTTTCCCTCTCTACCTATACACACACGAGGCCTGTATCCAGCTCCCTCCACTCACCAATCATCGACCCTTCGCTCACTTTCCCCCTTTCCCAAAACCCTGCTAAAACCCTACCGTTTTTCTTCTTCTTCTCGAAGCCCTTTTCTTCAGAATCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999553
ATGATAGTGAGGAATCTCTCTCCCTCAAGGCTCAGAAAGCTTCTCACTCCATTTTCCCTCTCTACCTATACACACACGAGGCCTGTATCCAGCTCCCTCCACTCACCAATCATCGACCCTTCGCTCACTTTCCCCCTTTCCCAAAACCCTGCTAAAACCCTACCGTTTTTCTTCTTCTTCTCGAAGCCCTTTTCTTCAGAATCCAGAAAGAACAAATCTTTTCCTAATTTACCACTGACCCGCGATGGAAATTACGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781097.1
MIVRNLSPSRLRKLLTPFSLSTYTHTRPVSSSLHSPIIDPSLTFPLSQNPAKTLPFFFFFSKPFSSESRKNKSFPNLPLTRDGNYEEATEHAVAICPGCGIQMQDLDPKQPGYSVKPSAKGQNYKKFKRMTPIVDESEISDSLKRGIANEIMDVDRIESIDSVDDVFDEMPKRAEKEAANQKPVVCARCHSLRHYQRVKEPGVENLLPDFDFDHTVGRRLMSTSGARTVVLLVVDAADFDGSFPRKVASLVSKTIDENAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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