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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004918`

染色体: Chr08 坐标: 58127953-58129973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004918`
名称	SmilChr08G004918
描述	constitutive photomorphogenesis protein 10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58127953 - 58129973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999569`
GeneID	`130999569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999569`
原始查询	`SmilChr08G004918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	constitutive photomorphogenesis protein 10
产物	constitutive photomorphogenesis protein 10
Arabidopsis	`AT3G13550` (FUS9) Ubiquitin-conjugating enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820557] identity=68.1; qcov=1.02; evalue=3.89e-92; confidence=high
Rice	`Os07g0577400` - identity=66.5; qcov=0.921; evalue=1.75e-77; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781109.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057781109.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057781109.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781109.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58128206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:58128210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B21
`Chr8:58128254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,D10,D2
`Chr8:58128514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr8:58129312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B135,C21,C34,C5
`Chr8:58129315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C78
`Chr8:58129385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B55
`Chr8:58129588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781109.1

178 aa

178

UQ_con

PF00179 UQ_con 36-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781109.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	36	172	2.9e-42	144.3	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925126.1
GTAAAATAGTAAATTAGTGGCAAGCCAAATAAAATGGGCGAGTGCGACATTGAGCTGCCATCGAAACTAGTTGAGCTTTCCATCGGAATTTGGGGATGAACAGCAGCGGCATGATGATGATGCCGGCGGGAGGCGGAGGCGGTAGAGGTGGCGGAGGCCGCTCCTGGCCGTCGACGACTTCGGTGTCCGCTTCCGGCAAGAGAATTCAGAAGGAGATGTCGGAACTGAGCTCGGATCCTCCGCCGGACTGCTCCGCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999569
ATGAACAGCAGCGGCATGATGATGATGCCGGCGGGAGGCGGAGGCGGTAGAGGTGGCGGAGGCCGCTCCTGGCCGTCGACGACTTCGGTGTCCGCTTCCGGCAAGAGAATTCAGAAGGAGATGTCGGAACTGAGCTCGGATCCTCCGCCGGACTGCTCCGCCGGCCCCAAGGGCGACAATCTCTACCATTGGGTCGCCACTCTCTTCGGTCCTCCCGGGACACCTTATGAAGGAGGAATATTTTTCCTTGATATCACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781109.1
MNSSGMMMMPAGGGGGRGGGGRSWPSTTSVSASGKRIQKEMSELSSDPPPDCSAGPKGDNLYHWVATLFGPPGTPYEGGIFFLDITFPSDYPFKPPKAVFRTRIYHCNVGSSGDVSLDLLKDGWSPALTISKVLVALRSIFTNPDPYKPLVPGVAHLYLADREKHDELAAEWTLRFAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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