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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004919`

染色体: Chr08 坐标: 58132048-58136376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004919`
名称	SmilChr08G004919
描述	probable CoA ligase CCL12
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58132048 - 58136376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999570`
GeneID	`130999570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999570`
原始查询	`SmilChr08G004919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable CoA ligase CCL12
产物	probable CoA ligase CCL12
Arabidopsis	`AT1G55320` (AAE18) acyl-activating enzyme 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841977] identity=68; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0380000` - identity=61.9; qcov=0.162; evalue=1.31e-37; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C); PF27750 (SAM_AAE17_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781110.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057781110.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781110.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781110.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58132266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B49
`Chr8:58132288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B49
`Chr8:58132307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:58132460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B35
`Chr8:58132462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B35
`Chr8:58133054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B139,B33,B6,B67
`Chr8:58133106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C58
`Chr8:58133280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C5
`Chr8:58133302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:58133375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:58133461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:58133508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B132,B23,B36,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781110.1

727 aa

364

727

SAM_AAE17_18

AMP-binding

AMP-binding_C

PF27750 SAM_AAE17_18 6-71 aa PF00501 AMP-binding 188-556 aa PF13193 AMP-binding_C 636-707 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781110.1`	Pfam	`PF27750`	SAM_AAE17_18	Domain	6	71	9.2e-16	58.7	Probable acyl-activating enzyme 17/18, SAM domain
`XP_057781110.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	188	556	1.8e-38	133.0	AMP-binding enzyme
`XP_057781110.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	636	707	2.2e-05	26.0	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925127.1
TTACCTAACACTACTTCCCTACTGAAAATCAGAGGCCTAAACAAAATTATACTCCATAAATGCATAAGACTTGAGAGAAGAAAGTCGTTATGATTGATTAGTTAATCAAATGAGTAATATTTTTTTATATTTCTACTTGTAATTGGTAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGTAAGAGGTATAGGGAGGTGGGAGTGGAGGATTTGGTGGGAAGTGGGATTCCAGTTGAAGAAGCGAAAGATTTGGAAAGAGAGCTTCAAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999570
ATGGGTAAGAGGTATAGGGAGGTGGGAGTGGAGGATTTGGTGGGAAGTGGGATTCCAGTTGAAGAAGCGAAAGATTTGGAAAGAGAGCTTCAAAATGTAAGCAGAAATGGCGGTGGAGCAGAAGAGTTGTGGGGCCGGATTACGGCGCCCAAGCTGTTGAAGCCATGGCACCCGCATGCCCTGCATCAGCTCATCTACTACTCTATCTACCGCGATCGCCATCACGATCACTCCATCCACGCCCCTCCCCTCTATTGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781110.1
MGKRYREVGVEDLVGSGIPVEEAKDLERELQNVSRNGGGAEELWGRITAPKLLKPWHPHALHQLIYYSIYRDRHHDHSIHAPPLYWFPSLSQAKCTNLGRLMESHGPRALGKLYKDPITSFRSFHQFSVQHPEIYWQFVLDELSVQFTVPPKCILDLSDKAKHGGTWLPGAVLNIADCCLQPSSYHKKHDDSLAIVWRQEGCDDHDVERMTLKELREQVMLVANALDLEFCKGDAIAIDMPMTNIAVIIYLAVILAGLVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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