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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004920`

染色体: Chr08 坐标: 58136382-58139161 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004920`
名称	SmilChr08G004920
描述	vesicle transport protein GOT1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58136382 - 58139161 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999571`
GeneID	`130999571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999571`
原始查询	`SmilChr08G004920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle transport protein GOT1-like
产物	vesicle transport protein GOT1-like
Arabidopsis	`AT3G49420` (AT3G49420) Got1/Sft2-like vescicle transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824104] identity=82.9; qcov=1; evalue=6.21e-82; confidence=high
Rice	`Os03g0209400` (GOT1B) - identity=82.1; qcov=1; evalue=8.47e-79; confidence=high
GO	GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi)
KEGG	-
Pfam	PF04178 (Got1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057781112.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057781112.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057781112.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057781112.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057781112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58136725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B23,D11
`Chr8:58137735`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A2,C18
`Chr8:58137735`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A2,C18
`Chr8:58138093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B66,C46,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781112.1

140 aa

140

Got1

PF04178 Got1 16-115 aa

XP_057781113.1

140 aa

140

Got1

PF04178 Got1 16-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781112.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	16	115	4.5e-12	47.2	Got1/Sft2-like family
`XP_057781113.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	16	115	4.5e-12	47.2	Got1/Sft2-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925129.1
CAATCAATTCGAAACGAGCCGTGTCCGAGTCAACTCGTCCGCGTCACAGTAGTTTCGCGTTCATTTCATTCCAATTGAGATCACGTCATCGCGCAAATGCCATTTGTTTGCTTCTCTTCGAAGTTGTAGTCTTAGCTCGTTACACATATTTACAGCGGTGTAGGGTTTCGGTTGAAGATTTTGTTGGCAAATCTAGGTTGTTTTTTATTGAATCTGAATTGGCGAAGATGATGTCCTTCGAGATGAACGATCGTAAAAAA...

XM_057925130.1
AGATTTCTCAACATTTTGCTAAATACGCATGTATAAATAAGCATATGATTGATTCTATAGTGTGTTAATATTTTATTAGGGGATCGGAATCGAGCGGTGTAGGGTTTCGGTTGAAGATTTTGTTGGCAAATCTAGGTTGTTTTTTATTGAATCTGAATTGGCGAAGATGATGTCCTTCGAGATGAACGATCGTAAAAAAATTGGACTCGGTTTGACGGGGTTTGGAGTATTCTTTTCATTTCTTGGGATCATTTTCTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999571
ATGATGTCCTTCGAGATGAACGATCGTAAAAAAATTGGACTCGGTTTGACGGGGTTTGGAGTATTCTTTTCATTTCTTGGGATCATTTTCTTCTTTGATAAGGGACTGCTTGCAATGGGAAATATCCTTTTCTTCTCAGGCGTGACATTAACCATTGGCCTCAAGTCTTCCGCCCAGTTCTTTATGAAGCGTTCTAATTTCAAGGGAACTGTTTCCTTTGGTGTTGGCTTCTTCCTGGTTATCATTGGATGGCCTATCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781112.1
MMSFEMNDRKKIGLGLTGFGVFFSFLGIIFFFDKGLLAMGNILFFSGVTLTIGLKSSAQFFMKRSNFKGTVSFGVGFFLVIIGWPILGMIVEAYGFVVLFSGFWPTLAVFLQKMPIIGWLFQQPFVRSFFDRYRGKRVPV

XP_057781113.1
MMSFEMNDRKKIGLGLTGFGVFFSFLGIIFFFDKGLLAMGNILFFSGVTLTIGLKSSAQFFMKRSNFKGTVSFGVGFFLVIIGWPILGMIVEAYGFVVLFSGFWPTLAVFLQKMPIIGWLFQQPFVRSFFDRYRGKRVPV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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