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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004922`

染色体: Chr08 坐标: 58152196-58154621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004922`
名称	SmilChr08G004922
描述	uncharacterized SmilChr08G004922
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58152196 - 58154621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999573`
GeneID	`130999573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999573`
原始查询	`SmilChr08G004922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calcium ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826452]; symbol=SUB1; hit=AT4G08810; species=arabidopsis; confidence=high
产物	calcium ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826452]; symbol=SUB1; hit=AT4G08810; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G08810` (SUB1) calcium ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826452] identity=69.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0633600` (P0519E12.134) - identity=58.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF23269 (DUF7074); PF23272 (DUF7075)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057781115.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781115.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781115.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781115.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58153031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:58153082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B23,C28,D10
`Chr8:58153212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C52
`Chr8:58153298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr8:58153349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:58153441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C29
`Chr8:58153613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C27,C79
`Chr8:58153727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr8:58153749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:58153836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C34,C73
`Chr8:58153909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B3,C64,C66,D4
`Chr8:58153912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B3,C64,C66,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781115.1

550 aa

275

550

DUF7074

DUF7075

PF23269 DUF7074 115-198 aa PF23272 DUF7075 242-535 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781115.1`	Pfam	`PF23269`	DUF7074	Domain	115	198	2.7e-36	124.4	Domain of unknown function (DUF7074)
`XP_057781115.1`	Pfam	`PF23272`	DUF7075	Domain	242	535	1.1e-66	225.7	Domain of unknown function (DUF7075)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925132.1
CCACAGAGTGTTCATGAGCTTCTAATTTGAAGTCTGATTTTTCTATCTCAATCGACACAAATCATACCCAAATCTCTATAATTATGTTGGCAATTACATGTCTTAGATTGCTGTTTCTTCAAGTTTAAGACAAAGCTCACCTAATTACTTCACCTTTTTTCTGTGTAAACAGCATTCTTGCAGTGAAGGGCTCCTTTCAATCGACTCAACCCTGTTGTTTTCTTCAATAATTGCACCTCAATATCCAATCTTGCACACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999573
ATGAAAGAAGTGAATCTAACAGATCCCATTGGGCAAAACGTGATAAAGCTGATAAGCAATGTGTGTTTCTCAGTGTTTGTGTTGTCAGTGCTGATTTTGAGTGTAGTTGCAATCACATACCAACCCCCTGATCCATGGGAGTCATCTAGGGCTCTAACTAAGGTCTTCACGGATGTCGAAAACGCCACGTTTCAGACGGATTCGTCCGTGCTGAAAACGGGTGAGGATGTTGCCACTGCACCAGTGGCAAGCCCTGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781115.1
MKEVNLTDPIGQNVIKLISNVCFSVFVLSVLILSVVAITYQPPDPWESSRALTKVFTDVENATFQTDSSVLKTGEDVATAPVASPVAITEATIERSEEALGKNGTLKSGCEDVSVVNCSDPRVLIAIQRFNLRSFKAIAFLEYQTPVNGSKPDECDVSWRFRNRKDKSWRRYRDFRRFRIGFKDDCSYKVVRTGRWHSGVNARRFRGRNATRSGGRGKAAPPPVRVRDDEINDTIPVLGSDSAFRKGKYLYYSRGGDHCK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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