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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004927`

染色体: Chr08 坐标: 58178957-58181932 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004927`
名称	SmilChr08G004927
描述	mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter DTC
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58178957 - 58181932 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999579`
GeneID	`130999579`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999579`
原始查询	`SmilChr08G004927`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter DTC
产物	mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter DTC
Arabidopsis	`AT5G19760` (AT5G19760) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832096] identity=85.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0208000` - identity=86.8; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015367 (oxoglutarate:malate antiporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999579

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057781130.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057781130.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057781130.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781130.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58179212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr8:58179246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C33,C6
`Chr8:58180929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B44,B5,C34,C83
`Chr8:58181335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C35
`Chr8:58181368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781130.1

298 aa

149

298

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 14-90 aa PF00153 Mito_carr 102-195 aa PF00153 Mito_carr 208-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781130.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	14	90	1.5e-55	185.6	Mitochondrial carrier protein
`XP_057781130.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	102	195	1.5e-55	185.6	Mitochondrial carrier protein
`XP_057781130.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	208	292	1.5e-55	185.6	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925147.1
CATCAAGATATGTATGTGTATTTTCGTGGGGAAAAAGCGACAAACTTTGCACTTGGGAAACAAAAAAATTAGAATTTGTAAATATTAATTGCAATGGCGGCCTTAAAAACCCTTCTGCATACTCACTTCACACAAGAAGCCCTCGAATTGTTCACCTCAGTGCGCCCTTTCTCTCTCTAGTAATCTCCTTTTTTGCTCGAGGAAAGCTAGAGAGAAGGAAAACAAAAATGGCCGCCGAGAAGCCGAAGTCAGCTGGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999579
ATGGCCGCCGAGAAGCCGAAGTCAGCTGGGGTTTGGCCTACGGTGAAGCCCTTTGTTAATGGCGGTGCTTCTGGAATGCTCGCTACCTGCGTGATTCAGCCCATCGATATGATCAAGGTGAGAATACAGCTTGGCCAGGGATCAGCTGGTGAGGTGACCAGGAACATGCTTAAAAATGACGGGGTTGGCGCCTTTTACAAGGGTTTGTCTGCTGGGCTTCTTAGACAAGCAACATATACAACTGCTCGTCTTGGATCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781130.1
MAAEKPKSAGVWPTVKPFVNGGASGMLATCVIQPIDMIKVRIQLGQGSAGEVTRNMLKNDGVGAFYKGLSAGLLRQATYTTARLGSFRILTNKAIEANDGKPLPLYQKALCGLTAGAIGACFGSPADLALIRMQADATLPAAQRRNYTNAFHALYRIVADEGVLALWKGAGPTVVRAMALNMGMLASYDQSVEFCKDTLGLGEAATVVGASSVSGFFAAACSLPFDYVKTQIQKMQPDAQGKYPYTGSLDCTMKTLKSGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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