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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004936`

染色体: Chr08 坐标: 58272164-58274697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004936`
名称	SmilChr08G004936
描述	50S ribosomal protein L5, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58272164 - 58274697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999588`
GeneID	`130999588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999588`
原始查询	`SmilChr08G004936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	50S ribosomal protein L5, chloroplastic-like
产物	50S ribosomal protein L5%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G01310` (AT4G01310) Ribosomal L5P family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827947] identity=68.9; qcov=0.985; evalue=3.56e-131; confidence=high
Rice	`Os03g0125000` (RPL5) - identity=64.2; qcov=0.813; evalue=1.65e-101; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00281 (Ribosomal_L5); PF00673 (Ribosomal_L5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781139.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781139.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781139.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781139.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58272463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D11
`Chr8:58274338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:58274381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr8:58274440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781139.1

268 aa

134

268

Ribosomal_L5

Ribosomal_L5_C

PF00281 Ribosomal_L5 77-133 aa PF00673 Ribosomal_L5_C 137-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781139.1`	Pfam	`PF00281`	Ribosomal_L5	Domain	77	133	3.2e-26	92.1	Ribosomal protein L5
`XP_057781139.1`	Pfam	`PF00673`	Ribosomal_L5_C	Domain	137	230	1.1e-32	112.7	ribosomal L5P family C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925156.1
CAATTCAATGTGGGACACTTCAATAGTGAGAATCGAGTATGAGTTTATTGAATTTGTAGCCAATGATAGTTGTTAACCTTATAAAAACTCACAAAAACAAAGGTAAAAAGTATTGCCCTTGATGGTAAAATTTAACGGCCGTTCTTATCCTCATCCACACAAAACCCACGAAAAATAGAAATTGCAGCTTCAAACTCAATCCCCAACTCCGCCACACCTACAATGGCGTTATCTCCCGCGCTATTGCACTCCACGGCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999588
ATGGCGTTATCTCCCGCGCTATTGCACTCCACGGCGTCGGCATTTCATGGCCAGTTCTCCGTCCGGCTTCCGTCCGTCAACTTCTCCGGTGTTCGCTCCGGCGGTCTCTCCGTCAAGGCGTCGTCGGTCGTCCTGGTCGAGAAAACCGAAGCCGAGAAAGTCAACCGGCTCAAGACCACTTACATCGAGAAAATTGTGCCGTTGCTCAAAGAAGAGTTCAATTACACCAATGTTCATCAGGTCCCCAAAGTCCAAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781139.1
MALSPALLHSTASAFHGQFSVRLPSVNFSGVRSGGLSVKASSVVLVEKTEAEKVNRLKTTYIEKIVPLLKEEFNYTNVHQVPKVQKIVVNCGIGEAAQNAKGLDAAMNDLALITGQRPIKTRAKKAIATFKIREGQPLGIACTLRGSVMYSFLDRLINLGLPRTRDFQGVSANSFDGNGNYSIGFREQTVFPELSFDLLGKPRGMDVCIETTANTDKEAHRLLALMGMPFREGAGGGGAPTIMRKKKLKAHHFDSKSKAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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