Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004937`

染色体: Chr08 坐标: 58276264-58277580 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004937`
名称	SmilChr08G004937
描述	uncharacterized SmilChr08G004937
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58276264 - 58277580 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999590`
GeneID	`130999590`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999590`
原始查询	`SmilChr08G004937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear polyadenylated RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820550]; symbol=AT3G13480; hit=AT3G13480; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclear polyadenylated RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820550]; symbol=AT3G13480; hit=AT3G13480; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G13480` (AT3G13480) nuclear polyadenylated RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820550] identity=38.09; qcov=0.97; evalue=5.52e-23; confidence=medium
Rice	`Os07g0172900` (P0496D04.34-1) - identity=51.22; qcov=0.306; evalue=5.67e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999590

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781141.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781141.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781144.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58276907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:58277039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B42,B43
`Chr8:58277057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B79,B96,B98
`Chr8:58277081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925162.1
TAAGAGAAAAGGCTTCTACTAGAGTATGTAATGTCACATGAAGGCCTACTTTCTATATCTAAAACTTACTTGAGCTCTTGTGGAAGCAAAGATAGAGGAACTTAGGTGGCAAGAGACATACAAATAAGAGACTTATTGATTTGAGATGTTTTGCTGTGGAAAAAGAATGTGATGTGCTGGTTGACAAAGAAAGGAACCGTTAATTCCTCAAGGGTTGCCAACGTCGTGTTCCTGAATCATGATTCATGCATCTGTCTGAC...

XM_057925161.1
AAGAGAAAAGGCTTCTACTAGAGTATGTAATGTCACATGAAGGCCTACTTTCTATATCTAAAACTTACTTGAGCTCTTGTGGAAGCAAAGATAGAGGAACTTAGGTGGCAAGAGACATACAAATAAGAGACTTATTGATTTGAGATGTTTTGCTGTGGAAAAAGAATGTGATGTGCTGGTTGACAAAGAAAGGAACCGTTAATTCCTCAAGGGTTGTTAGGTGCCTTACAAATTGGTGTATCATCATCTCTTTATAGCTG...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781144.1_46277
ATGCATCTGTCTGACTCTCTGATCCAGTGTCCATTGATGTGCTTCTGCAAGCCCTCTGCTGCTCATCTTTACACTTCAAAGCCATTGAAACTGGAAAGTGCTCCACGCGCCGTTGCTTCAACAGTTTATGCTGTTTCTGGCGTCAAAGAAGAAGGGCGTGTTGTTGATGCGAAGCATGAAGCTGAGACTGCGAGAAAAAGCTGCATACGGAAGCTCTGCCCTCGCCCCGACTCCACCAGACAGGTTGGGAAGAAGAAGAA...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781145.1_46278
ATGCATCTGTCTGACTCTCTGATCCAGTGTCCATTGATGTGCTTCTGCAAGCCCTCTGCTGCTCATCTTTACACTTCAAAGCCATTGAAACTGGAAAGTGCTCCACGCGCCGTTGCTTCAACAGTTTATGCTGTTTCTGGCGTCAAAGAAGAAGGGCGTGTTGTTGATGCGAAGCATGAAGCTGAGACTGCGAGAAAAAGCTGCATACGGAAGCTCTGCCCTCGCCCCGACTCCACCAGACAGGTTGGGAAGAAGAAGAA...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057781141.1
MKETILMRVLLCKIQCPLMCFCKPSAAHLYTSKPLKLESAPRAVASTVYAVSGVKEEGRVVDAKHEAETARKSCIRKLCPRPDSTRQVGKKKKKKVQWMDHLGEELAEIREFESSDSGDTDNEEESSRCLCVIL

XP_057781142.1
MKETILMRVLLCKIQCPLMCFCKPSAAHLYTSKPLKLESAPRAVASTVYAVSGVKEEGRVVDAKHEAETARKSCIRKLCPRPDSTRQVGKKKKKKVQWMDHLGEELAEIREFESSDSGDTDNEEESSRCLCVIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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