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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004941`

染色体: Chr08 坐标: 58290489-58297084 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004941`
名称	SmilChr08G004941
描述	subtilisin-like protease SBT3.18
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58290489 - 58297084 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999594`
GeneID	`130999594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999594`
原始查询	`SmilChr08G004941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT3.18
产物	subtilisin-like protease SBT3.18
Arabidopsis	`AT4G26330` (UNE17) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828739] identity=53.2; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0158700` (OsSub27) - identity=50.5; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057781150.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057781150.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781150.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781150.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58292293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B42,B43,D1
`Chr8:58292725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B21
`Chr8:58292741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:58292832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,B98
`Chr8:58293421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:58293449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:58293480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B104,B42,B43
`Chr8:58293494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B83
`Chr8:58293586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:58293639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,B98
`Chr8:58293672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B112,B21,B88
`Chr8:58293705`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781150.1

788 aa

394

788

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 40-119 aa PF00082 Peptidase_S8 148-596 aa PF17766 fn3_6 677-773 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781150.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	40	119	1.8e-14	54.8	Peptidase inhibitor I9
`XP_057781150.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	148	596	6e-45	154.5	Subtilase family
`XP_057781150.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	677	773	1.4e-25	90.1	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925167.1
ATCTCTGTGTTGTCCCTTACTGTGTTAGTTACCTTACCTACTTAATTTAGAAAGAGTTGCTTACGAAAGATTTTGTGATGCTAGTGGTGGTAACTTTTGGTTAAAGATATCACTGCAAACATGAAACAAACTTTCATAAATAAAAAATAGTTTTTTTTTTTTTAATACAATATCAAATTTAGTTGAGAATTTGAAGAGCTAACTGACAGTTTGTTAGTTGAGAAAAAATTGGAACTTTTACAAAAACAGTACTAAAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999594
ATGAAGGTGTGTTGTGAAATTGAGGCAATGGCTACTGGTTTGCAGTGTTTTTGGGGGCTGTCTCTCTCACTTTCACTTTCACTTTGTTTGATTCATGCAATATCCACTACTCCTCATGTTTACATTGTCTACTTAGGGAAAGTCCAGCATTCCGATCCTCTACGTGCACACGAGCATCATCTTCGCCACCTTGGCAGCGTATTCCATAGCAACGAAGAAGCAAAGGAGGCAATGGTCCATAGCTACAAGCTTTCCTTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781150.1
MKVCCEIEAMATGLQCFWGLSLSLSLSLCLIHAISTTPHVYIVYLGKVQHSDPLRAHEHHLRHLGSVFHSNEEAKEAMVHSYKLSLSGFAATLNATQAAILTNRKGVISVFRSRTLKLHTTRSWDFMGLTLPLHGQGQGQLPLQLTHGDDVVVAVFDSGVWPESGSFKEEAGMGPVPKQWKGACDGGEAFDAEKHCNKKLIGARYFKAGFERSYGKINKTRNPEYLSARDILGHGTHTAATAVGSRVKNVDLFGAAGGVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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