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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004950`

染色体: Chr08 坐标: 58368846-58374796 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004950`
名称	SmilChr08G004950
描述	glucosidase 2 subunit beta
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58368846 - 58374796 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999595`
GeneID	`130999595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999595`
原始查询	`SmilChr08G004950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucosidase 2 subunit beta
产物	glucosidase 2 subunit beta
Arabidopsis	`AT5G56360` (PSL4) calmodulin-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835736] identity=54.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0276800` (Gas2) - identity=54; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006491 (N-glycan processing); GO:0017177 (glucosidase II complex)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07915 (PRKCSH); PF12999 (PRKCSH-like); PF13015 (PRKCSH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057781151.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057781151.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057781151.1`
4	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057781151.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781151.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58369169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:58370550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:58370564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:58372012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C32
`Chr8:58372012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr8:58372018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C39
`Chr8:58372168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr8:58372793`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A1,A10,A25,A5,A6,A9,B10,B100,B105,B107,B11,B110,B118,B120,B127,B128,B133,B134,B140,B16,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B5,B51,B53,B54,B56,B64,B65,B66,B78,B81,B91,B93,B94,B96,B97,B98,C12,C24,C35,C46,C48,C53,C54,C59,C60,C61,C63,C65,C79,C80,C9,D9
`Chr8:58372795`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	60	A1,A10,A25,A5,A6,A9,B10,B100,B105,B107,B11,B110,B118,B120,B127,B128,B133,B134,B140,B16,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B5,B51,B53,B54,B56,B64,B65,B66,B78,B81,B91,B93,B94,B96,B97,B98,C12,C24,C35,C46,C48,C53,C54,C59,C60,C61,C63,C65,C79,C80,C9,D9
`Chr8:58372804`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	60	A1,A10,A25,A5,A6,A9,B10,B100,B105,B107,B11,B110,B118,B120,B127,B128,B133,B134,B140,B16,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B5,B51,B53,B54,B56,B64,B65,B66,B78,B81,B91,B93,B94,B96,B97,B98,C12,C24,C35,C46,C48,C53,C54,C59,C60,C61,C63,C65,C79,C80,C9,D9
`Chr8:58372882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C28
`Chr8:58373582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781151.1

623 aa

312

623

PRKCSH-like

PRKCSH_1

PRKCSH

PF12999 PRKCSH-like 30-183 aa PF13015 PRKCSH_1 464-607 aa PF07915 PRKCSH 503-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781151.1`	Pfam	`PF12999`	PRKCSH-like	Family	30	183	8.4e-39	133.9	Glucosidase II beta subunit-like
`XP_057781151.1`	Pfam	`PF13015`	PRKCSH_1	Family	464	607	5.2e-28	98.4	Glucosidase II beta subunit-like protein
`XP_057781151.1`	Pfam	`PF07915`	PRKCSH	Family	503	555	3.5e-07	31.7	Glucosidase II beta subunit-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925168.1
ACTATAAAGAAAATAGGAAAATAAAATAGTATGGAAATCCTCTCTCTCTCCGACAAGGCGTGGAGAGCCTAAATCCCTAGCTCTGCAGTGATTGAGGGCTTATAACCGATACGTCGTCGTCCGATGCATTTGCAGCTTCAACTGCTTCCGAAACCAAAATCCCTAGCTCTGCACCTCTAATTGCAGCCTCATTCTTGATTATTTGCTGCTCTAATCAAGTCTTAACACAAGATGGAAACCAGAATTGTGCCAAACCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999595
ATGGAAACCAGAATTGTGCCAAACCTAATGCTGTTTGGCTGCAGCATTATTCTATTAGTACATGGCATCACCAGATCGGCGGCATCGCTTCCCCCCATGGACTCACTCTTCGGAGTCTCCCCTGAAGATGAGAGTTATTACAAGGGGTTGTCATCATCGAGTGCGATTAAGTGCAAAGATGGATCGCATAAATTTAACAAATCCCAATTCAACGACGATTTCTGCGACTGTGCTGATGGCTCTGATGAACCCGGAACATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781151.1
METRIVPNLMLFGCSIILLVHGITRSAASLPPMDSLFGVSPEDESYYKGLSSSSAIKCKDGSHKFNKSQFNDDFCDCADGSDEPGTSACPNGKFYCKNAGHAPVVLYSSRVNDGICDCCDGSDEYDGKTKCPNTCWEAGKVAREKLRKKIATYREGVTIRRQEIEKAKLTISKEEAELQKLKEEEKILNGLVEKLKERKEQIEKAEEQERLQKEKEEKERKEAQVTKDEDTKAEDTESTQKDIHDNVGVVDQPPQDSEEH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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