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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G004951

染色体: Chr08 坐标: 58375313-58377892 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G004951
名称SmilChr08G004951
描述pyruvate kinase, cytosolic isozyme
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向58375313 - 58377892 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130999597
GeneID130999597
locus_tag-
NCBI NameLOC130999597
原始查询SmilChr08G004951

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述pyruvate kinase, cytosolic isozyme
产物pyruvate kinase%2C cytosolic isozyme
ArabidopsisAT5G56350 (AT5G56350)
Pyruvate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835735]
identity=87.2; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
RiceOs01g0276700
-
identity=82.7; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GOGO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004743 (pyruvate kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006096 (glycolytic process); GO:0030955 (potassium ion binding)
KEGGsmil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF00224 (PK); PF02887 (PK_C)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130999597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057781153.1
2 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057781153.1
3 Nucleoplasm 核质 0.20000 XP_057781153.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057781153.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057781153.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:58376131 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B105,B108,B53,C21,C72
Chr8:58376150 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B138,B20,B39,C21,D11
Chr8:58376158 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B138,B20,B39,C21,D11
Chr8:58376161 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B138,B20,B39,C21,D11
Chr8:58376170 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B138,B20,B39,C21,D11
Chr8:58376209 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B138,B20,B39,C21,D11
Chr8:58376228 AAG A 2bp_deletion frameshift_variant 128 A10,A11,A13,A14,A19,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B107,B109,B111,B113,B118,B119,B121,B122,B125,B127,B128,B13,B130,B133,B134,B136,B137,B138,B15,B17,B2,B20,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B41,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B52,B54,B55,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B77,B80,B81,B84,B85,B90,B95,B99,C13,C14,C16,C18,C2,C20,C21,C31,C38,C40,C41,C42,C44,C52,C53,C57,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C78,C80,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D8,D9
Chr8:58376234 C CAA 2bp_insertion frameshift_variant 129 A10,A11,A13,A14,A19,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B107,B109,B111,B113,B118,B119,B121,B122,B125,B127,B128,B13,B130,B133,B134,B136,B137,B138,B15,B17,B2,B20,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B41,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B52,B54,B55,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B77,B80,B81,B84,B85,B90,B95,B99,C13,C14,C16,C18,C2,C20,C21,C25,C31,C35,C38,C40,C41,C42,C44,C52,C53,C57,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C78,C80,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D3,D5,D6,D8,D9
Chr8:58376247 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B118,B84
Chr8:58376268 C CAA 2bp_insertion frameshift_variant 138 A10,A11,A13,A14,A19,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B107,B109,B111,B113,B115,B118,B119,B121,B122,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B134,B136,B137,B15,B17,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B41,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B52,B54,B55,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B77,B80,B81,B84,B85,B86,B90,B95,B99,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C25,C31,C35,C38,C40,C41,C42,C44,C52,C53,C57,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C75,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D3,D5,D6,D8,D9
Chr8:58376270 GTC G 2bp_deletion frameshift_variant 138 A10,A11,A13,A14,A19,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B107,B109,B111,B113,B115,B118,B119,B121,B122,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B134,B136,B137,B15,B17,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B41,B43,B44,B46,B47,B5,B50,B52,B54,B55,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B77,B80,B81,B84,B85,B86,B90,B95,B99,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C25,C31,C35,C38,C40,C41,C42,C44,C52,C53,C57,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C67,C69,C74,C75,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D3,D5,D6,D8,D9
Chr8:58376900 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781153.1
510 aa
N
1
255
510
PK
PK_C
C
PF00224 PK 21-345 aa PF02887 PK_C 380-502 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057781153.1 Pfam PF00224 PK Domain 21 345 5.8e-149 496.3 Pyruvate kinase, barrel domain
XP_057781153.1 Pfam PF02887 PK_C Domain 380 502 1.9e-22 80.3 Pyruvate kinase, alpha/beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057925170.1
TGTAACATGTTTGTCTAAGTACGTGGTGAAAAAGAAAAGGAGCAATAATTATTATTATTAATTAATATTTAATAGAGTAGTTATTATTGTGTGTAATTGAGAATGGTAGAGTGCGCCTGCCCTAACTTATTCAAAAAGTTAGCGTTTCATTTCCCTTCACATATAAGTATTTCATTTGCTGCATAACGGATTCCTCCGATTTCCACTCACACACACCCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGACTAACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130999597
ATGACTAACTACTTCGTCGGCGATGGAGGAGAAAATCAGGCCGGCGGCGTCAAGCGGCCGAAGACGAAGATCGTCTGCACTTTGGGCCCTGCCTCTCGCTCCATCCCCATGGTCGAGAAGCTTCTGCGAGCCGGCATGAACGTCGCTCGTTTCAATTTCTCCCACGGATCTCACGAATACCACCAGGAGACTCTCGACAATCTCCGCAAGGCCATGGAAAACACCGGCATCCTCTGCGCCGTCATGCTCGATACCAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057781153.1
MTNYFVGDGGENQAGGVKRPKTKIVCTLGPASRSIPMVEKLLRAGMNVARFNFSHGSHEYHQETLDNLRKAMENTGILCAVMLDTKGPEIRTGFLKDAKPVQLKQGQEITISTDYSIKGDAKTICMSYKKLAEDVKPGMVILCADGTISFTVLECDKKQGLVRCRCENTAVLGERKNVNLPGVVVDLPTLTDKDKEDIIKWGVPNKIDMIALSFVRKGSDLVEVRKLLGHHAKTILLMSKVENQEGVANFDEILANSDAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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