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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004955`

染色体: Chr08 坐标: 58389582-58407954 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004955`
名称	SmilChr08G004955
描述	nuclear pore complex protein NUP214
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58389582 - 58407954 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999608`
GeneID	`130999608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999608`
原始查询	`SmilChr08G004955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP214
产物	nuclear pore complex protein NUP214
Arabidopsis	`AT1G55540` (LNO1) Nuclear pore complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842002] identity=40.0; qcov=0.26; evalue=6.66e-101; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0006405 (RNA export from nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore)
KEGG	-
Pfam	PF28654 (NUP214_coiled)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999608

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781176.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057781176.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057781176.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057781176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58389827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A7,B62,C75
`Chr8:58390057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B31,D6
`Chr8:58390065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B100,B120,C48
`Chr8:58390073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:58390090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:58390171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:58390207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:58390378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C65
`Chr8:58390483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A7,B124,B62
`Chr8:58390848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:58390983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B68
`Chr8:58391565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781176.1

1736 aa

868

1736

NUP214_coiled

PF28654 NUP214_coiled 795-982 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781176.1`	Pfam	`PF28654`	NUP214_coiled	Coiled-coil	795	982	5.3e-83	278.1	NUP214 coiled-coil domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925193.1
CTTATATAGAAACAGAGTGAGTAACGTCACCCAAAATCCTTCCCGCCCATTGCCATTCCCCACCGCGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCAATGCCTGCTGATTTGGGTCTCATCAAATTGGATGACGAAATCGACGGAGATGAAATCGGCACCAGAAATTTCCGCTTCTCCAAGATTGGAGAATCCGTCCCTATTCTCCAGTCCGACGGCGCCACCTCCCACTTCGACCCCCAATCCCTTCCTTCCCAGCCTTTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057781176.1_46309
ATGCCTGCTGATTTGGGTCTCATCAAATTGGATGACGAAATCGACGGAGATGAAATCGGCACCAGAAATTTCCGCTTCTCCAAGATTGGAGAATCCGTCCCTATTCTCCAGTCCGACGGCGCCACCTCCCACTTCGACCCCCAATCCCTTCCTTCCCAGCCTTTGGCCGTCTCCGAGCGCTTCGGTCTCCTCTTTCTAGTACATCCGCAGGGCCAAGGGTTTTATGTTGCTCGGACCAAGGACGTGATGGCATCGGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781176.1
MPADLGLIKLDDEIDGDEIGTRNFRFSKIGESVPILQSDGATSHFDPQSLPSQPLAVSERFGLLFLVHPQGQGFYVARTKDVMASAEAIKDKGPAPSLQELSLVHVAIGTVSILALAADDSLLAATVSSHVHFFAISALLHKDQKPSYSVSLEDSLCIKDVRWARKDAKAYIILSTSGKLYHGSGQGPLTCLMEDVDSVDWNIGDNYIAVAINNVISILSSHFKEKLRFLLSFQSVIGDADAGQVIKVDSIRWIRPDSIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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