预测得分表示 LocPro 模型对候选定位的支持程度,取值为 0–1;不能作为定位概率或实验结论。

丹参亚细胞定位预测

方法与数据说明

得分由五组模型的定位判定汇总:1.0 表示五组模型均支持该位置,0.2 表示一组模型支持。每组模型按标签阈值及归一化得分规则作出判定。基因查询对同一位置保留不同蛋白异构体中的最高得分;蛋白查询仅展示该蛋白。得分为零的记录不展示。

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。

当前结果来自 LocPro 对丹参 Salvia miltiorrhiza 蛋白组的预计算预测。输入统一基因 ID、旧版 GeneID、locus_tag 或蛋白 ID 均可查询,结果展示统一基因 ID 及对应蛋白 ID。

按 ID 查询

示例

下载当前定位候选

数据说明

LocPro 会给出多个可能定位。本页面会先合并同一定位在不同蛋白异构体中的重复记录,再按预测分数保留最多 5 个不同定位,便于快速判断。

方法: LocPro(完整序列特征)
物种: Salvia miltiorrhiza
库内定位记录数(含零得分): 231625

查询结果

查询 ID: SmilChr08G004741. 以下展示最多五个得分大于零的定位候选;得分 ≤0.5 表示支持该定位的模型未过半,所有候选均需实验验证。

排序 定位 预测得分 蛋白 ID 统一基因 ID
1 线粒体 1.00000 XP_057780186.1 SmilChr08G004741