Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

功能注释

当前注释数据库已接入。可使用统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID 或 Protein ID 查询。
示例
GO KEGG Pfam InterPro eggNOG NR

查询结果

SmilChr07G000278

来源: GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog 染色体: Chr07 链方向: -

ID 对照

统一新 Gene IDSmilChr07G000278
NCBI Gene IDLOC130991471
GeneID130991471
locus_tag-

基本注释

描述cysteine synthase
产物cysteine synthase
NRGeneID:130991471

数据库注释

ArabidopsisAT4G14880 (OASA1)
O-acetylserine (thiol) lyase (OAS-TL) isoform A1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827145]
identity=84.2; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
RiceOs12g0625000 (rcs1)
-
identity=82.7; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GOGO:0004124 (cysteine synthase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006535 (GO:0006535)
KEGGsmil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01320 (Sulfur cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF00291 (PALP)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130991471

打开 Gene Card