转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 87 / 137 下载 TSV

上一页 87 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002658 Chr08 NC_080394.1:26051111-26051125promoter 内 481-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 26054631-26060065(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTTGAATACGTGGCA
SmilChr08G002621 Chr08 NC_080394.1:25555015-25555029promoter 内 424-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 25558592-25565883(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTGTAGA
SmilChr01G005364 Chr01 NC_080387.1:70870357-70870371promoter 内 3982-3996 bp + 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70864563-70870352(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CAAGGACACGTGGCT
SmilChr05G002978 Chr05 NC_080391.1:36329139-36329153promoter 内 3969-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36325748-36329121(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr01G000424 Chr01 NC_080387.1:8508465-8508479promoter 内 3964-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8508502-8511369(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr02G004019 Chr02 NC_080388.1:62500125-62500139promoter 内 3962-3976 bp + 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62498208-62500100(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr01G000607 Chr01 NC_080387.1:13458482-13458496promoter 内 3944-3958 bp - 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 13458369-13458439(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCAGAAAA
SmilChr02G004020 Chr02 NC_080388.1:62500125-62500139promoter 内 3922-3936 bp + 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62500204-62504156(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTAGGACCC
SmilChr03G003035 Chr03 NC_080389.1:47255308-47255322promoter 内 3920-3934 bp - 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47255389-47259511(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CAATGAGACGTGGCC
SmilChr01G005294 Chr01 NC_080387.1:70266898-70266912promoter 内 3904-3918 bp + 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70266995-70270703(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G003326 Chr03 NC_080389.1:51519986-51520000promoter 内 3893-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51520094-51523937(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr08G002876 Chr08 NC_080394.1:28665807-28665821promoter 内 3892-3906 bp - 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 28665916-28668370(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr07G000181 Chr07 NC_080393.1:1141305-1141319promoter 内 3889-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1141417-1145519(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr07G001460 Chr07 NC_080393.1:11438574-11438588promoter 内 3873-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11435569-11438460(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGTCCTACGTGGCC
SmilChr07G003367 Chr07 NC_080393.1:36253232-36253246promoter 内 3865-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36253368-36257034(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G000598 Chr03 NC_080389.1:6626817-6626831promoter 内 3863-3877 bp - 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6623155-6626693(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr02G002525 Chr02 NC_080388.1:43931056-43931070promoter 内 3844-3858 bp + 143 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43931213-43934713(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr08G000978 Chr08 NC_080394.1:7338185-7338199promoter 内 3843-3857 bp - 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7334521-7338041(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr02G003570 Chr02 NC_080388.1:56866552-56866566promoter 内 3838-3852 bp + 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56866715-56870048(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr01G006136 Chr01 NC_080387.1:76877776-76877790promoter 内 3821-3835 bp - 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 76873730-76877610(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr04G001660 Chr04 NC_080390.1:27565085-27565099promoter 内 3810-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27565276-27583680(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGAAGTG
SmilChr07G004307 Chr07 NC_080393.1:55653598-55653612promoter 内 3808-3822 bp - 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55649419-55653419(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr05G002414 Chr05 NC_080391.1:26676210-26676224promoter 内 3796-3810 bp + 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26676415-26679935(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr04G001824 Chr04 NC_080390.1:29751367-29751381promoter 内 3772-3786 bp + 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 29751596-29755212(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G003271 Chr03 NC_080389.1:50674953-50674967promoter 内 3763-3777 bp - 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50671183-50674729(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr03G002833 Chr03 NC_080389.1:44854157-44854171promoter 内 3753-3767 bp + 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44852793-44853923(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GATTTCCACGTGGCC
SmilChr07G001804 Chr07 NC_080393.1:15431677-15431691promoter 内 3726-3740 bp - 261 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15427957-15431416(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr05G003874 Chr05 NC_080391.1:52334936-52334950promoter 内 3697-3711 bp + 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52335240-52337644(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCAGTGCC
SmilChr07G001461 Chr07 NC_080393.1:11438574-11438588promoter 内 3661-3675 bp + 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11438914-11443460(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTAGGACCC
SmilChr07G000814 Chr07 NC_080393.1:5743416-5743430promoter 内 3654-3668 bp + 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5741070-5743083(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CAATTCCACGTGGCA
SmilChr03G001242 Chr03 NC_080389.1:14313113-14313127promoter 内 3642-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14309318-14312768(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr05G000596 Chr05 NC_080391.1:4496175-4496189promoter 内 3618-3632 bp + 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4492527-4495806(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTGTTGACGTGGAG
SmilChr01G001152 Chr01 NC_080387.1:23475457-23475471promoter 内 3604-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23475854-23482002(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr06G002312 Chr06 NC_080392.1:33397829-33397843promoter 内 3587-3601 bp + 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33398243-33401510(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr02G000016 Chr02 NC_080388.1:124177-124191promoter 内 3581-3595 bp + 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 124597-127887(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
SmilChr05G004094 Chr05 NC_080391.1:54801644-54801658promoter 内 3581-3595 bp - 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54797948-54801238(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT
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SmilChr05G003385 Chr05 NC_080391.1:44852423-44852437promoter 内 3440-3454 bp + 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44852984-44856191(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAGCT