转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 87 / 143 下载 TSV

上一页 87 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003772 Chr01 NC_080387.1:56080020-56080031promoter 内 1005-1016 bp - 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56083016-56085836(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGC
SmilChr04G000427 Chr04 NC_080390.1:4532768-4532779promoter 内 973-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4528979-4529751(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr01G002841 Chr01 NC_080387.1:46980552-46980563promoter 内 970-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 46983583-46984509(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G000510 Chr02 NC_080388.1:7044204-7044215promoter 内 960-971 bp + 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7047245-7048232(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr08G002363 Chr08 NC_080394.1:22450803-22450814promoter 内 950-961 bp + 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22453854-22454854(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr07G004203 Chr07 NC_080393.1:54139837-54139848promoter 内 949-960 bp - 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54135749-54136796(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr04G002720 Chr04 NC_080390.1:42825297-42825308promoter 内 948-959 bp + 3042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 42828350-42829068(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G002291 Chr01 NC_080387.1:39748300-39748311promoter 内 920-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39751381-39754707(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G003638 Chr01 NC_080387.1:54868868-54868879promoter 内 920-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54871949-54872876(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G004348 Chr03 NC_080389.1:61753795-61753806promoter 内 920-931 bp - 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61749799-61750725(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr06G000669 Chr06 NC_080392.1:5880965-5880976promoter 内 920-931 bp - 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5877013-5877895(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr07G002454 Chr07 NC_080393.1:23064856-23064867promoter 内 920-931 bp - 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23060904-23061786(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G003926 Chr02 NC_080388.1:61328653-61328664promoter 内 914-925 bp + 3076 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61331740-61332604(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr05G001285 Chr05 NC_080391.1:10997446-10997457promoter 内 901-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11000546-11003333(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr01G001079 Chr01 NC_080387.1:22234637-22234648promoter 内 891-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22226648-22231538(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGA
SmilChr05G001113 Chr05 NC_080391.1:9286161-9286172promoter 内 886-897 bp - 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9282220-9283057(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr06G001027 Chr06 NC_080392.1:10180476-10180487promoter 内 884-895 bp + 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10183593-10190866(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAGA
SmilChr04G002870 Chr04 NC_080390.1:44830739-44830750promoter 内 882-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44827411-44827631(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCAG
SmilChr05G000716 Chr05 NC_080391.1:5448513-5448524promoter 内 840-851 bp + 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5451674-5453237(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr08G001781 Chr08 NC_080394.1:15014057-15014068promoter 内 784-795 bp - 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15017274-15019616(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGA
SmilChr07G002103 Chr07 NC_080393.1:19123999-19124010promoter 内 753-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19127247-19129416(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr03G000197 Chr03 NC_080389.1:2245107-2245118promoter 内 751-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2229827-2241868(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr07G002086 Chr07 NC_080393.1:18973660-18973671promoter 内 737-748 bp + 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 18976924-18978780(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr02G005087 Chr02 NC_080388.1:72477018-72477029promoter 内 729-740 bp - 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72480290-72482320(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr04G002044 Chr04 NC_080390.1:33167431-33167442promoter 内 697-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 33163257-33164138(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr04G001344 Chr04 NC_080390.1:21814846-21814857promoter 内 667-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21810830-21811523(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G003548 Chr03 NC_080389.1:54106348-54106359promoter 内 652-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54109697-54111990(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGA
SmilChr04G001233 Chr04 NC_080390.1:19345809-19345820promoter 内 649-660 bp + 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19349161-19349845(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G003265 Chr01 NC_080387.1:51327286-51327297promoter 内 624-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51330663-51335242(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGA
SmilChr04G003182 Chr04 NC_080390.1:48528183-48528194promoter 内 620-631 bp - 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 48524221-48524813(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G004381 Chr03 NC_080389.1:62018753-62018764promoter 内 606-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62022148-62027841(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr01G000726 Chr01 NC_080387.1:16181975-16181986promoter 内 575-586 bp - 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16175692-16178560(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr05G001784 Chr05 NC_080391.1:17573367-17573378promoter 内 567-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 17566128-17569944(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr01G001229 Chr01 NC_080387.1:24578089-24578100promoter 内 551-562 bp - 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24569064-24574650(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr04G003055 Chr04 NC_080390.1:47140204-47140215promoter 内 517-528 bp - 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47135548-47136731(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr08G002977 Chr08 NC_080394.1:29840756-29840767promoter 内 514-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29844243-29845562(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr01G004164 Chr01 NC_080387.1:60129578-60129589promoter 内 511-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60133068-60134915(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G002940 Chr02 NC_080388.1:49897258-49897269promoter 内 500-511 bp - 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49900759-49908125(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr05G002761 Chr05 NC_080391.1:31952433-31952444promoter 内 448-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31955986-31958634(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGA
SmilChr05G002760 Chr05 NC_080391.1:31952433-31952444promoter 内 409-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31945610-31948852(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr08G000993 Chr08 NC_080394.1:7449588-7449599promoter 内 404-415 bp + 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7445292-7446002(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr01G006063 Chr01 NC_080387.1:76050390-76050401promoter 内 385-396 bp + 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 76054006-76058197(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATA
SmilChr07G001359 Chr07 NC_080393.1:10539071-10539082promoter 内 358-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10531922-10535439(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC
SmilChr06G000600 Chr06 NC_080392.1:5175921-5175932promoter 内 342-353 bp - 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5179580-5180877(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr08G003137 Chr08 NC_080394.1:31758436-31758447promoter 内 338-349 bp - 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31762099-31766121(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCTC
SmilChr05G001972 Chr05 NC_080391.1:20345709-20345720promoter 内 333-344 bp - 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20349377-20351418(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTACC
SmilChr05G004296 Chr05 NC_080391.1:56693634-56693645promoter 内 323-334 bp + 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56685955-56689967(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTC
SmilChr01G004416 Chr01 NC_080387.1:62301687-62301698promoter 内 297-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62305391-62306368(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCTT
SmilChr03G004740 Chr03 NC_080389.1:64526696-64526707promoter 内 243-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64530454-64539570(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGA
SmilChr05G000645 Chr05 NC_080391.1:4886043-4886054promoter 内 238-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4889806-4890300(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAC