转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 24 / 136 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005996 Chr01 NC_080387.1:75544026-75544036promoter 内 1081-1091 bp + 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 75546946-75548973(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr04G004034 Chr04 NC_080390.1:55583176-55583186promoter 内 1051-1061 bp - 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 55586126-55590610(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGT
SmilChr02G002082 Chr02 NC_080388.1:37407511-37407521promoter 内 896-906 bp - 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 37393825-37404416(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr03G000616 Chr03 NC_080389.1:6814227-6814237promoter 内 860-870 bp + 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 6809784-6811096(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr05G000988 Chr05 NC_080391.1:7997301-7997311promoter 内 756-766 bp + 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 8000546-8004144(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr03G003064 Chr03 NC_080389.1:47581030-47581040promoter 内 663-673 bp - 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 47584368-47589089(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr07G003361 Chr07 NC_080393.1:36186437-36186447promoter 内 618-628 bp + 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 36189820-36194113(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGGC
SmilChr07G002423 Chr07 NC_080393.1:22562133-22562143promoter 内 580-590 bp - 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 22565554-22566997(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr01G005038 Chr01 NC_080387.1:68334994-68335004promoter 内 216-226 bp + 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 68327239-68331219(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr07G003360 Chr07 NC_080393.1:36186437-36186447promoter 内 214-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 36178709-36182660(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr07G002382 Chr07 NC_080393.1:22214359-22214369promoter 内 161-171 bp + 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 22207718-22210529(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTC
SmilChr07G002065 Chr07 NC_080393.1:18780321-18780331promoter 内 40-50 bp - 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 18774292-18776370(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCA
SmilChr08G000677 Chr08 NC_080394.1:5037694-5037704promoter 内 1682-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 5040013-5042279(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGT
SmilChr03G002299 Chr03 NC_080389.1:36213253-36213263promoter 内 1211-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 3 36206403-36210473(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr05G002142 Chr05 NC_080391.1:22595161-22595171promoter 内 2085-2095 bp - 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 22581052-22593255(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGT
SmilChr05G002143 Chr05 NC_080391.1:22595161-22595171promoter 内 1367-1377 bp - 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 22597795-22597990(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr04G003043 Chr04 NC_080390.1:46942778-46942788promoter 内 650-660 bp - 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 46946129-46948705(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr04G003172 Chr04 NC_080390.1:48393285-48393295promoter 内 567-577 bp + 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 48387346-48389861(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr05G003308 Chr05 NC_080391.1:43342452-43342462promoter 内 3893-3903 bp - 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 43339660-43342354(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGCG
SmilChr08G000188 Chr08 NC_080394.1:1271371-1271381promoter 内 3548-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1270218-1270928(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr07G000342 Chr07 NC_080393.1:2317520-2317530promoter 内 3508-3518 bp - 483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 2315615-2317037(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr05G002952 Chr05 NC_080391.1:35641041-35641051promoter 内 3305-3315 bp + 686 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35641737-35653228(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr05G000872 Chr05 NC_080391.1:6914819-6914829promoter 内 2995-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 6915825-6918617(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGT
SmilChr08G003403 Chr08 NC_080394.1:35930826-35930836promoter 内 2915-2925 bp - 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35931912-35933348(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCA
SmilChr01G005850 Chr01 NC_080387.1:74441348-74441358promoter 内 2730-2740 bp + 1261 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74438105-74440087(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr06G002075 Chr06 NC_080392.1:27363753-27363763promoter 内 2140-2150 bp + 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 27365614-27370997(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr08G000189 Chr08 NC_080394.1:1271371-1271381promoter 内 2010-2020 bp + 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1273362-1274964(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGT
SmilChr02G004985 Chr02 NC_080388.1:71731922-71731932promoter 内 1768-1778 bp + 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 71734155-71737705(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr04G001885 Chr04 NC_080390.1:30792758-30792768promoter 内 1499-1509 bp + 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 30795260-30796475(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr05G002136 Chr05 NC_080391.1:22450850-22450860promoter 内 1335-1345 bp + 2656 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 22453516-22454850(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr02G003868 Chr02 NC_080388.1:60688268-60688278promoter 内 1137-1147 bp - 2854 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 60691132-60696390(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCA
SmilChr07G000341 Chr07 NC_080393.1:2317520-2317530promoter 内 1108-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 2312536-2314637(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr03G000461 Chr03 NC_080389.1:4922808-4922818promoter 内 1007-1017 bp - 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 4911930-4919824(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCT
SmilChr05G002903 Chr05 NC_080391.1:34882569-34882579promoter 内 986-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 34885584-34886411(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGC
SmilChr01G000250 Chr01 NC_080387.1:4697694-4697704promoter 内 3707-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 6 4697988-4698093(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGTT
SmilChr03G002879 Chr03 NC_080389.1:45461841-45461851promoter 内 3307-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 6 45460372-45461157(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr07G002920 Chr07 NC_080393.1:29566167-29566177promoter 内 3637-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 29566531-29568818(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr07G001376 Chr07 NC_080393.1:10691290-10691300promoter 内 3293-3303 bp - 698 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 10678577-10690592(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCC
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SmilChr03G002878 Chr03 NC_080389.1:45461841-45461851promoter 内 2485-2495 bp - 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 45457261-45460335(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr03G002414 Chr03 NC_080389.1:38379578-38379588promoter 内 1876-1886 bp + 2115 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 38374693-38377463(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr02G002266 Chr02 NC_080388.1:40112645-40112655promoter 内 1651-1661 bp - 2340 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 40114995-40118370(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr04G002241 Chr04 NC_080390.1:36190691-36190701promoter 内 1606-1616 bp - 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 36193086-36200858(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr01G003332 Chr01 NC_080387.1:52026014-52026024promoter 内 1193-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 52028822-52030455(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr01G003859 Chr01 NC_080387.1:56875016-56875026promoter 内 1057-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 56867968-56872082(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr03G000659 Chr03 NC_080389.1:7359997-7360007promoter 内 921-931 bp - 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 7354519-7356927(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr07G002917 Chr07 NC_080393.1:29566167-29566177promoter 内 775-785 bp + 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 5 29559938-29562951(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG
SmilChr01G001217 Chr01 NC_080387.1:24452996-24453006promoter 内 3004-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 24450229-24452009(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr07G004360 Chr07 NC_080393.1:56146189-56146199promoter 内 2630-2640 bp + 1361 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 56147560-56149252(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGGA
SmilChr05G003475 Chr05 NC_080391.1:46138310-46138320promoter 内 2566-2576 bp + 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 46135295-46136885(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGG