转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 110 / 143 下载 TSV

上一页 110 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001178 Chr06 NC_080392.1:12003003-12003014promoter 内 86-97 bp + 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11982009-11999099(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTT
SmilChr05G000366 Chr05 NC_080391.1:2715306-2715317promoter 内 80-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2719227-2721484(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAA
SmilChr05G000360 Chr05 NC_080391.1:2692481-2692492promoter 内 40-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2686892-2688531(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAA
SmilChr02G004189 Chr02 NC_080388.1:64221491-64221502promoter 内 2584-2595 bp - 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 64203209-64220085(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAA
SmilChr08G000006 Chr08 NC_080394.1:88048-88059promoter 内 2581-2592 bp - 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 89468-92992(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACA
SmilChr05G003827 Chr05 NC_080391.1:51682345-51682356promoter 内 1947-1958 bp + 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 51677259-51680302(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGA
SmilChr08G002424 Chr08 NC_080394.1:23015366-23015377promoter 内 547-558 bp + 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 23018820-23019426(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTACAGCTGTT
SmilChr05G003828 Chr05 NC_080391.1:51676596-51676607promoter 内 112-123 bp + 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 51680485-51681503(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCACCAGCTGTT
SmilChr08G001579 Chr08 NC_080394.1:13028698-13028709promoter 内 77-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 13024250-13024785(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTACG
SmilChr01G000505 Chr01 NC_080387.1:10224775-10224786promoter 内 3779-3790 bp - 211 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10222400-10224564(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr04G000789 Chr04 NC_080390.1:9715802-9715813promoter 内 3689-3700 bp + 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9708781-9715501(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr01G000504 Chr01 NC_080387.1:10215293-10215304promoter 内 3541-3552 bp - 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10212918-10214844(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr01G000581 Chr01 NC_080387.1:12297900-12297911promoter 内 3444-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 12292868-12297354(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGT
SmilChr05G000257 Chr05 NC_080391.1:1975979-1975990promoter 内 3308-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1971415-1975297(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGT
SmilChr07G001082 Chr07 NC_080393.1:7927928-7927939promoter 内 3280-3291 bp - 710 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7928649-7930748(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr05G000724 Chr05 NC_080391.1:5532258-5532269promoter 内 3232-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5533027-5534328(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr07G001614 Chr07 NC_080393.1:13545700-13545711promoter 内 3200-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13543418-13544910(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAT
SmilChr01G002077 Chr01 NC_080387.1:36722541-36722552promoter 内 3146-3157 bp - 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 36723396-36724475(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGT
SmilChr07G003019 Chr07 NC_080393.1:31235238-31235249promoter 内 3045-3056 bp - 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31236194-31238241(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCCC
SmilChr05G003761 Chr05 NC_080391.1:50860584-50860595promoter 内 3006-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50861579-50864291(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGT
SmilChr03G001831 Chr03 NC_080389.1:25087493-25087504promoter 内 2949-2960 bp - 1041 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 25088545-25089437(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACA
SmilChr06G002346 Chr06 NC_080392.1:34151541-34151552promoter 内 2917-2928 bp - 1073 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 34146560-34150468(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTC
SmilChr05G000725 Chr05 NC_080391.1:5541924-5541935promoter 内 2737-2748 bp + 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5543188-5544128(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr08G001638 Chr08 NC_080394.1:13586714-13586725promoter 内 2697-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13588018-13589874(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTC
SmilChr07G004216 Chr07 NC_080393.1:54364476-54364487promoter 内 2670-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54357098-54363156(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAA
SmilChr01G005619 Chr01 NC_080387.1:72682552-72682563promoter 内 2638-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72683915-72688856(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr05G001091 Chr05 NC_080391.1:9098332-9098343promoter 内 2559-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9094467-9096901(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAACTGTCAA
SmilChr02G000008 Chr02 NC_080388.1:66514-66525promoter 内 2557-2568 bp + 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63884-65081(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACA
SmilChr05G002663 Chr05 NC_080391.1:30133938-30133949promoter 内 2547-2558 bp - 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30135392-30136909(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATC
SmilChr01G003963 Chr01 NC_080387.1:58043489-58043500promoter 内 2426-2437 bp - 1564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 58045064-58046042(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAACTGTCAA
SmilChr01G000506 Chr01 NC_080387.1:10224775-10224786promoter 内 2327-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10226449-10227917(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr05G001093 Chr05 NC_080391.1:9098332-9098343promoter 内 2301-2312 bp + 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9100032-9103242(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTC
SmilChr04G001311 Chr04 NC_080390.1:20958758-20958769promoter 内 2236-2247 bp + 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 20960523-20961827(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAT
SmilChr05G000535 Chr05 NC_080391.1:4101415-4101426promoter 内 2153-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4097265-4099578(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAT
SmilChr02G003904 Chr02 NC_080388.1:61122377-61122388promoter 内 2152-2163 bp - 1838 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 61115982-61120539(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCACCAGCTGTT
SmilChr06G001333 Chr06 NC_080392.1:13863245-13863256promoter 内 2090-2101 bp - 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13865156-13866996(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr08G002195 Chr08 NC_080394.1:19834258-19834269promoter 内 2082-2093 bp - 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19836177-19841497(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAACTGTCAA
SmilChr02G003906 Chr02 NC_080388.1:61122377-61122388promoter 内 2076-2087 bp - 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 61124302-61124374(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGA
SmilChr02G002066 Chr02 NC_080388.1:37212637-37212648promoter 内 2070-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 37214568-37216041(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATC
SmilChr05G001271 Chr05 NC_080391.1:10863875-10863886promoter 内 1971-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10865905-10871224(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGAA
SmilChr02G004058 Chr02 NC_080388.1:62880056-62880067promoter 内 1873-1884 bp - 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 62882184-62884923(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAT
SmilChr03G003175 Chr03 NC_080389.1:49199447-49199458promoter 内 1810-1821 bp + 2180 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49201638-49202376(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAA
SmilChr08G002521 Chr08 NC_080394.1:24417243-24417254promoter 内 1792-1803 bp - 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 24410241-24415045(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTC
SmilChr03G000308 Chr03 NC_080389.1:3522676-3522687promoter 内 1677-1688 bp + 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3517678-3520363(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAACTGTCAA
SmilChr05G003066 Chr05 NC_080391.1:38519525-38519536promoter 内 1636-1647 bp - 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38521890-38524178(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTATC
SmilChr06G001677 Chr06 NC_080392.1:19043773-19043784promoter 内 1534-1545 bp + 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19046240-19046911(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAT
SmilChr04G003435 Chr04 NC_080390.1:50914000-50914011promoter 内 1493-1504 bp - 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50908225-50911503(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr01G005618 Chr01 NC_080387.1:72682552-72682563promoter 内 1461-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72677249-72680023(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr02G002272 Chr02 NC_080388.1:40189119-40189130promoter 内 1416-1427 bp + 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 40185049-40186545(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCCC
SmilChr02G003415 Chr02 NC_080388.1:55394665-55394676promoter 内 1346-1357 bp + 2644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55397320-55400201(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG