转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 30 / 130 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006157 Chr01 NC_080387.1:76980658-76980670promoter 内 2185-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 76982474-76984000(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCCTTA
SmilChr01G002618 Chr01 NC_080387.1:44451790-44451802promoter 内 2106-2118 bp + 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 44453685-44453765(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr03G000174 Chr03 NC_080389.1:1903659-1903671promoter 内 2096-2108 bp - 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1901080-1901766(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G002913 Chr01 NC_080387.1:47866308-47866320promoter 内 1998-2010 bp - 1991 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47859232-47864317(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGGGAATATTCA
SmilChr01G001601 Chr01 NC_080387.1:30181030-30181042promoter 内 1877-1889 bp + 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 30183154-30186704(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G000533 Chr01 NC_080387.1:10863365-10863377promoter 内 1816-1828 bp + 2173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 10857613-10861192(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTAGATTCTTTG
SmilChr02G003603 Chr02 NC_080388.1:57279184-57279196promoter 内 1801-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57275427-57276996(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCGTTC
SmilChr01G002478 Chr01 NC_080387.1:42518124-42518136promoter 内 1796-1808 bp + 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 42520329-42524352(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr02G003620 Chr02 NC_080388.1:57498422-57498434promoter 内 1751-1763 bp + 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 57494061-57496184(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTAGATTCTTTG
SmilChr03G000739 Chr03 NC_080389.1:8385875-8385887promoter 内 1702-1714 bp + 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 8388174-8391827(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G005376 Chr01 NC_080387.1:70987846-70987858promoter 内 1553-1565 bp - 2436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 70980715-70985410(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TTGAGAATATACC
SmilChr01G002927 Chr01 NC_080387.1:48050387-48050399promoter 内 1527-1539 bp + 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 48052861-48056753(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAAGAATCTACC
SmilChr01G005740 Chr01 NC_080387.1:73521035-73521047promoter 内 1496-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 73517748-73518542(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCCTTA
SmilChr01G006126 Chr01 NC_080387.1:76766311-76766323promoter 内 1489-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 76768823-76770452(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr02G002117 Chr02 NC_080388.1:37918732-37918744promoter 内 1425-1437 bp - 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37914969-37916168(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G005742 Chr01 NC_080387.1:73521035-73521047promoter 内 1355-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 73523681-73524864(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr02G002788 Chr02 NC_080388.1:47948961-47948973promoter 内 1259-1271 bp - 2730 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 47945171-47946231(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAACGAATATTTC
SmilChr03G001224 Chr03 NC_080389.1:14130625-14130637promoter 内 1255-1267 bp + 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14127820-14127891(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGTAGATTCTTTG
SmilChr03G001080 Chr03 NC_080389.1:12504927-12504939promoter 内 1250-1262 bp - 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12498885-12502188(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G004213 Chr01 NC_080387.1:60544334-60544346promoter 内 1202-1214 bp - 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60547133-60549473(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATGCTTGA
SmilChr01G005222 Chr01 NC_080387.1:69775360-69775372promoter 内 1156-1168 bp - 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 69769582-69772527(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr03G000935 Chr03 NC_080389.1:10661415-10661427promoter 内 1123-1135 bp - 2866 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 10655483-10658549(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr03G000150 Chr03 NC_080389.1:1639157-1639169promoter 内 1117-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 1635193-1636285(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCCTTA
SmilChr01G006154 Chr01 NC_080387.1:76980658-76980670promoter 内 1114-1126 bp - 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 76974631-76977783(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr02G001780 Chr02 NC_080388.1:32579196-32579208promoter 内 950-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 32582247-32585220(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G000637 Chr01 NC_080387.1:14309656-14309668promoter 内 915-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14312742-14314457(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAAGAATCTACC
SmilChr01G005952 Chr01 NC_080387.1:75230333-75230345promoter 内 602-614 bp + 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 75224873-75226946(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCCTTA
SmilChr02G001945 Chr02 NC_080388.1:35070183-35070195promoter 内 282-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 35073902-35076549(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr03G001924 Chr03 NC_080389.1:27006233-27006245promoter 内 229-241 bp - 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 27001881-27002473(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TAAGGAATATTTC
SmilChr01G003855 Chr01 NC_080387.1:56818415-56818427promoter 内 1979-1991 bp + 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 4 56820437-56822342(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAGGAATATTCA
SmilChr03G001182 Chr03 NC_080389.1:13571939-13571951promoter 内 1362-1374 bp + 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 4 13574578-13577024(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTACGTATATTCC
SmilChr02G001061 Chr02 NC_080388.1:18920776-18920788promoter 内 3581-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 18921196-18924120(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CCAAGAATATTCT
SmilChr01G001787 Chr01 NC_080387.1:32745961-32745973promoter 内 2456-2468 bp + 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 32743124-32744428(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCCTT
SmilChr03G000345 Chr03 NC_080389.1:3894693-3894705promoter 内 1855-1867 bp - 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 3896839-3897761(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTATT
SmilChr01G005383 Chr01 NC_080387.1:71080839-71080851promoter 内 2-14 bp - 3987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 71070234-71076852(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATTCGTATATTCC
SmilChr02G003148 Chr02 NC_080388.1:52506853-52506865promoter 内 3779-3791 bp - 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 52505293-52506643(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATTCA
SmilChr01G002800 Chr01 NC_080387.1:46491935-46491947promoter 内 3745-3757 bp - 244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 46492191-46494360(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGATATTCTGGT
SmilChr02G002004 Chr02 NC_080388.1:36186992-36187004promoter 内 3462-3474 bp - 527 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 36187531-36187691(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTATT
SmilChr01G006180 Chr01 NC_080387.1:77339271-77339283promoter 内 2889-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 77334811-77338171(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATCTACT
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SmilChr02G000148 Chr02 NC_080388.1:1978604-1978616promoter 内 2165-2177 bp + 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 1980440-1981591(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATTCA
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SmilChr01G004728 Chr01 NC_080387.1:65463449-65463461promoter 内 1902-1914 bp + 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 65459020-65461362(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGAATATACGAAT
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SmilChr02G004758 Chr02 NC_080388.1:69775570-69775582promoter 内 1755-1767 bp + 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 69760159-69773336(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TGAATATTCTATT
SmilChr01G003705 Chr01 NC_080387.1:55413796-55413808promoter 内 1604-1616 bp + 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 55416193-55417162(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CAAAGAATATTCA
SmilChr01G001974 Chr01 NC_080387.1:35159664-35159676promoter 内 1326-1338 bp - 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 35154693-35157001(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 CTACGTATATTCC