转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 38 / 136 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G004633 Chr08 NC_080394.1:55843285-55843295promoter 内 1490-1500 bp + 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 55845796-55846692(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCG
SmilChr08G003793 Chr08 NC_080394.1:43835342-43835352promoter 内 871-881 bp + 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 43831351-43832222(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGGC
SmilChr06G001595 Chr06 NC_080392.1:17655994-17656004promoter 内 829-839 bp - 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 17650383-17652832(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGTA
SmilChr03G001481 Chr03 NC_080389.1:17865914-17865924promoter 内 798-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 17859817-17862721(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr03G001643 Chr03 NC_080389.1:21250603-21250613promoter 内 403-413 bp + 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 21254201-21257239(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr03G002530 Chr03 NC_080389.1:40371189-40371199promoter 内 341-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 40367090-40367539(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr08G004634 Chr08 NC_080394.1:55843285-55843295promoter 内 56-66 bp + 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 55847230-55848237(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCG
SmilChr04G000750 Chr04 NC_080390.1:9190431-9190441promoter 内 3414-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9191018-9192135(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACGC
SmilChr07G000035 Chr07 NC_080393.1:161172-161182promoter 内 3233-3243 bp - 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 160343-160414(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCAGCGCG
SmilChr03G004280 Chr03 NC_080389.1:61232382-61232392promoter 内 3163-3173 bp + 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61233220-61236207(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr08G001353 Chr08 NC_080394.1:10841747-10841757promoter 内 2962-2972 bp + 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10842786-10848123(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr01G000376 Chr01 NC_080387.1:7763630-7763640promoter 内 2599-2609 bp + 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7760085-7762238(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr04G003579 Chr04 NC_080390.1:52210767-52210777promoter 内 2019-2029 bp + 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52212749-52216297(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr06G001399 Chr06 NC_080392.1:14626519-14626529promoter 内 1929-1939 bp - 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14628591-14630720(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr03G003880 Chr03 NC_080389.1:57901054-57901064promoter 内 1618-1628 bp + 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 57894954-57898681(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACGC
SmilChr04G001138 Chr04 NC_080390.1:16751903-16751913promoter 内 1606-1616 bp - 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 16736893-16749518(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr05G001392 Chr05 NC_080391.1:12475158-12475168promoter 内 1425-1435 bp + 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 12467048-12472592(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr07G003819 Chr07 NC_080393.1:47175863-47175873promoter 内 1328-1338 bp + 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47171743-47173200(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr02G004325 Chr02 NC_080388.1:65547634-65547644promoter 内 1311-1321 bp + 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 65542733-65544954(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGGC
SmilChr02G002136 Chr02 NC_080388.1:38461430-38461440promoter 内 1282-1292 bp + 2709 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 38464149-38466625(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr05G000857 Chr05 NC_080391.1:6777546-6777556promoter 内 897-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6771295-6774452(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCG
SmilChr01G000477 Chr01 NC_080387.1:9782214-9782224promoter 内 877-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9785338-9787272(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr03G001196 Chr03 NC_080389.1:13784088-13784098promoter 内 809-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13777504-13780906(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGCG
SmilChr03G004279 Chr03 NC_080389.1:61232382-61232392promoter 内 786-796 bp + 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61227793-61229177(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr08G001352 Chr08 NC_080394.1:10836255-10836265promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10831423-10832996(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr03G000031 Chr03 NC_080389.1:385042-385052promoter 内 627-637 bp - 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 379389-381678(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr03G003631 Chr03 NC_080389.1:54983975-54983985promoter 内 600-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54980478-54980584(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr03G004281 Chr03 NC_080389.1:61232382-61232392promoter 内 392-402 bp + 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61235991-61239443(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr08G003041 Chr08 NC_080394.1:30572540-30572550promoter 内 382-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 30576159-30576794(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCCCAGCGCG
SmilChr01G000375 Chr01 NC_080387.1:7763630-7763640promoter 内 262-272 bp + 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7758780-7759901(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr06G000690 Chr06 NC_080392.1:6114101-6114111promoter 内 46-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6118056-6123423(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr04G000726 Chr04 NC_080390.1:8526122-8526132promoter 内 37-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8530086-8532678(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCC
SmilChr08G001925 Chr08 NC_080394.1:16787656-16787666promoter 内 3860-3870 bp + 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 16781300-16787525(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCT
SmilChr08G004452 Chr08 NC_080394.1:54250087-54250097promoter 内 1501-1511 bp - 2490 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 54245909-54247597(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGGA
SmilChr05G000130 Chr05 NC_080391.1:1056702-1056712promoter 内 3587-3597 bp + 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 1053902-1056298(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGT
SmilChr01G001328 Chr01 NC_080387.1:26439882-26439892promoter 内 1271-1281 bp - 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 26434729-26437162(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCG
SmilChr04G001168 Chr04 NC_080390.1:17399108-17399118promoter 内 630-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 17402479-17402584(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACCT
SmilChr01G001505 Chr01 NC_080387.1:28882220-28882230promoter 内 3812-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 28882409-28888793(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr08G004681 Chr08 NC_080394.1:56287879-56287889promoter 内 2325-2335 bp + 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 56289555-56291105(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr03G004631 Chr03 NC_080389.1:63957986-63957996promoter 内 1887-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 63952085-63955882(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGGA
SmilChr08G001926 Chr08 NC_080394.1:16787656-16787666promoter 内 1651-1661 bp + 2340 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 16790006-16791246(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr06G001455 Chr06 NC_080392.1:15397408-15397418promoter 内 3588-3598 bp + 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15397821-15401897(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr06G000391 Chr06 NC_080392.1:3125981-3125991promoter 内 3513-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 3123050-3125503(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr04G000426 Chr04 NC_080390.1:4520721-4520731promoter 内 3229-3239 bp - 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4521493-4527189(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGGT
SmilChr07G004017 Chr07 NC_080393.1:51249177-51249187promoter 内 3215-3225 bp - 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 51243936-51248401(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCG
SmilChr05G003363 Chr05 NC_080391.1:44440037-44440047promoter 内 3205-3215 bp - 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44433085-44439251(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr03G001223 Chr03 NC_080389.1:14096928-14096938promoter 内 3050-3060 bp + 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 14097879-14100533(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr03G003993 Chr03 NC_080389.1:58966583-58966593promoter 内 2977-2987 bp - 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58962373-58965569(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr07G002965 Chr07 NC_080393.1:30129418-30129428promoter 内 2915-2925 bp - 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30125195-30128342(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCG
SmilChr07G000178 Chr07 NC_080393.1:1115701-1115711promoter 内 2703-2713 bp - 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1116999-1124993(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCT