转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002803; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020702-RA_Salv SmilChr07G002803 NAC XP_057777238.1 MP00221 ACACGTAACTT

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 7965 个候选靶基因 第 56 / 160 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001320 Chr02 NC_080388.1:24542684-24542694promoter 内 1901-1911 bp + 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 24544784-24546737(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr02G001934 Chr02 NC_080388.1:34760882-34760892promoter 内 1815-1825 bp - 2176 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 34757596-34758706(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr02G001904 Chr02 NC_080388.1:34351779-34351789promoter 内 1812-1822 bp + 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 34345375-34349600(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr05G003572 Chr05 NC_080391.1:47721233-47721243promoter 内 1802-1812 bp - 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 47723432-47725270(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGCTTACGTGA
SmilChr01G000391 Chr01 NC_080387.1:8058611-8058621promoter 内 1340-1350 bp + 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 8061272-8062313(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr01G003855 Chr01 NC_080387.1:56817517-56817527promoter 内 1081-1091 bp - 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56820437-56822342(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGTTTACGTGT
SmilChr05G001265 Chr05 NC_080391.1:10786956-10786966promoter 内 950-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 10780478-10783915(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGCTTACGTGG
SmilChr05G002390 Chr05 NC_080391.1:26400997-26401007promoter 内 945-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 26396998-26397951(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGTTTACGTGT
SmilChr01G000054 Chr01 NC_080387.1:848175-848185promoter 内 905-915 bp + 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 851271-853373(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAAGCG
SmilChr01G003767 Chr01 NC_080387.1:56035132-56035142promoter 内 903-913 bp - 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56038230-56041649(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr02G001750 Chr02 NC_080388.1:32132382-32132392promoter 内 832-842 bp - 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 32127430-32129223(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr05G004232 Chr05 NC_080391.1:56137687-56137697promoter 内 549-559 bp - 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56141139-56142974(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr04G001270 Chr04 NC_080390.1:20201027-20201037promoter 内 533-543 bp + 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 20195045-20197569(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGCTTACGTGG
SmilChr05G002703 Chr05 NC_080391.1:31058395-31058405promoter 内 492-502 bp + 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 31047935-31054896(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr02G003076 Chr02 NC_080388.1:51680229-51680239promoter 内 489-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 51683741-51687524(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACGTTACGTGG
SmilChr05G002409 Chr05 NC_080391.1:26601544-26601554promoter 内 452-462 bp + 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 26605093-26614104(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr04G002898 Chr04 NC_080390.1:45271646-45271656promoter 内 309-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 45266190-45267964(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAAGCG
SmilChr04G001048 Chr04 NC_080390.1:14910076-14910086promoter 内 3958-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14910119-14910960(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAGCA
SmilChr01G003664 Chr01 NC_080387.1:55065575-55065585promoter 内 3950-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55061660-55065534(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr05G002791 Chr05 NC_080391.1:32642130-32642140promoter 内 3929-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32642202-32646200(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr01G003528 Chr01 NC_080387.1:53916169-53916179promoter 内 3924-3934 bp - 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53913710-53916102(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr01G003472 Chr01 NC_080387.1:53257510-53257520promoter 内 3918-3928 bp - 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53255097-53257437(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr05G002914 Chr05 NC_080391.1:35121046-35121056promoter 内 3846-3856 bp + 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35118654-35120901(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr02G002342 Chr02 NC_080388.1:41151594-41151604promoter 内 3845-3855 bp - 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 41147564-41151448(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAAGCG
SmilChr01G003514 Chr01 NC_080387.1:53751713-53751723promoter 内 3781-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53751933-53757502(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr01G000621 Chr01 NC_080387.1:13736559-13736569promoter 内 3763-3773 bp - 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13734991-13736331(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr05G002638 Chr05 NC_080391.1:29795846-29795856promoter 内 3740-3750 bp + 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 29791790-29795595(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr01G002550 Chr01 NC_080387.1:43605468-43605478promoter 内 3717-3727 bp + 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 43605752-43610948(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAGCA
SmilChr02G003522 Chr02 NC_080388.1:56395285-56395295promoter 内 3707-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 56395579-56397687(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGCTTACGTGA
SmilChr04G000780 Chr04 NC_080390.1:9554549-9554559promoter 内 3648-3658 bp + 343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 9554902-9556651(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAAGCG
SmilChr03G004330 Chr03 NC_080389.1:61653887-61653897promoter 内 3633-3643 bp - 358 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 61645624-61653529(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TTACGTAACCA
SmilChr05G002790 Chr05 NC_080391.1:32642130-32642140promoter 内 3630-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32638802-32641769(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr02G000783 Chr02 NC_080388.1:12869642-12869652promoter 内 3613-3623 bp - 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 12865618-12869264(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAAGCG
SmilChr01G000743 Chr01 NC_080387.1:16434625-16434635promoter 内 3598-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 16435028-16436925(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr01G000395 Chr01 NC_080387.1:8117552-8117562promoter 内 3591-3601 bp - 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 8117962-8120106(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGTTTACGTGT
SmilChr03G002209 Chr03 NC_080389.1:34815908-34815918promoter 内 3567-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 34813516-34815484(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr02G004359 Chr02 NC_080388.1:65878868-65878878promoter 内 3560-3570 bp - 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 65875157-65878437(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAAGCA
SmilChr01G004624 Chr01 NC_080387.1:64263859-64263869promoter 内 3509-3519 bp + 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64264351-64266280(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr01G005877 Chr01 NC_080387.1:74710877-74710887promoter 内 3479-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74711399-74715640(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr05G000353 Chr05 NC_080391.1:2636801-2636811promoter 内 3348-3358 bp - 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 2637454-2639308(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGAATACGTGT
SmilChr05G002915 Chr05 NC_080391.1:35121046-35121056promoter 内 3321-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35121726-35124335(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr01G003936 Chr01 NC_080387.1:57665185-57665195promoter 内 3301-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 57663503-57664495(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr05G002948 Chr05 NC_080391.1:35535667-35535677promoter 内 3161-3171 bp + 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35536507-35537648(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CCACGTAAGCG
SmilChr01G003734 Chr01 NC_080387.1:55632097-55632107promoter 内 3065-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 55629769-55631171(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr01G003471 Chr01 NC_080387.1:53251196-53251206promoter 内 3001-3011 bp - 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 53252196-53253778(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAGTTACGTCA
SmilChr01G000648 Chr01 NC_080387.1:14469291-14469301promoter 内 2980-2990 bp - 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 14465091-14468280(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr03G000103 Chr03 NC_080389.1:1145933-1145943promoter 内 2916-2926 bp + 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 1147018-1154474(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC
SmilChr03G000281 Chr03 NC_080389.1:3209565-3209575promoter 内 2802-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 3206167-3208376(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TGTTTACGTGT
SmilChr01G000833 Chr01 NC_080387.1:17960087-17960097promoter 内 2782-2792 bp + 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 17961306-17965999(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAACA
SmilChr04G002186 Chr04 NC_080390.1:35300059-35300069promoter 内 2761-2771 bp + 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 35301299-35320433(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATTCC