转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 6 / 143 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002451 Chr06 NC_080392.1:35280968-35280979promoter 内 502-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 35284467-35287006(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAG
SmilChr07G000892 Chr07 NC_080393.1:6408657-6408668promoter 内 381-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 2 6412277-6416892(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr01G004965 Chr01 NC_080387.1:67745518-67745529promoter 内 3820-3831 bp - 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 67742964-67745348(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAC
SmilChr02G001605 Chr02 NC_080388.1:29880958-29880969promoter 内 3089-3100 bp + 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 29881870-29888854(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr03G000653 Chr03 NC_080389.1:7253805-7253816promoter 内 2889-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 7254917-7257742(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAG
SmilChr02G002804 Chr02 NC_080388.1:48112759-48112770promoter 内 2780-2791 bp + 1210 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 48113980-48115436(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr01G006070 Chr01 NC_080387.1:76112050-76112061promoter 内 2739-2750 bp + 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 76113312-76114864(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G002795 Chr05 NC_080391.1:32694146-32694157promoter 内 2697-2708 bp + 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 32685250-32692853(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAG
SmilChr01G004259 Chr01 NC_080387.1:60853217-60853228promoter 内 2413-2424 bp + 1577 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 60854805-60856481(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAC
SmilChr02G000177 Chr02 NC_080388.1:2264826-2264837promoter 内 2064-2075 bp + 1926 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 2266763-2270938(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G003535 Chr05 NC_080391.1:47215829-47215840promoter 内 1857-1868 bp + 2133 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 47217973-47221756(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G002708 Chr05 NC_080391.1:31129250-31129261promoter 内 1572-1583 bp - 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 31123141-31126832(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr03G000598 Chr03 NC_080389.1:6629154-6629165promoter 内 1529-1540 bp - 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 6623155-6626693(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr08G000978 Chr08 NC_080394.1:7340523-7340534promoter 内 1508-1519 bp - 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 7334521-7338041(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr02G003570 Chr02 NC_080388.1:56864208-56864219promoter 内 1494-1505 bp + 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 56866715-56870048(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr01G006136 Chr01 NC_080387.1:76880123-76880134promoter 内 1477-1488 bp - 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 76873730-76877610(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr07G003280 Chr07 NC_080393.1:34536474-34536485promoter 内 1441-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 34539034-34540515(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr03G003271 Chr03 NC_080389.1:50677291-50677302promoter 内 1428-1439 bp - 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 50671183-50674729(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr01G000012 Chr01 NC_080387.1:277162-277173promoter 内 1427-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 271082-274599(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr08G003578 Chr08 NC_080394.1:38505714-38505725promoter 内 1414-1425 bp + 2576 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 38508301-38511750(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr07G001804 Chr07 NC_080393.1:15434023-15434034promoter 内 1383-1394 bp - 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 15427957-15431416(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr03G001969 Chr03 NC_080389.1:28366618-28366629promoter 内 1290-1301 bp + 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 28369329-28369772(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr03G001480 Chr03 NC_080389.1:17855124-17855135promoter 内 1196-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 17849127-17852330(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr02G000323 Chr02 NC_080388.1:4048197-4048208promoter 内 1182-1193 bp + 2808 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 4051016-4054345(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr01G000573 Chr01 NC_080387.1:11910436-11910447promoter 内 1168-1179 bp - 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 11905063-11907614(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr07G001764 Chr07 NC_080393.1:14946272-14946283promoter 内 1148-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 14949125-14952346(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr03G001979 Chr03 NC_080389.1:28720497-28720508promoter 内 1114-1125 bp + 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 28723384-28731521(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr07G004568 Chr07 NC_080393.1:58479442-58479453promoter 内 1110-1121 bp - 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 58473329-58476562(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G003385 Chr05 NC_080391.1:44850080-44850091promoter 内 1097-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 44852984-44856191(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr07G003777 Chr07 NC_080393.1:46300115-46300126promoter 内 1081-1092 bp - 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 46285952-46297206(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr03G000468 Chr03 NC_080389.1:4991178-4991189promoter 内 1077-1088 bp + 2913 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 4994102-4997403(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr02G000325 Chr02 NC_080388.1:4083804-4083815promoter 内 1073-1084 bp + 2917 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 4086732-4089943(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G003503 Chr05 NC_080391.1:46703250-46703261promoter 内 1055-1066 bp + 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 46706196-46707983(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr01G000676 Chr01 NC_080387.1:14956304-14956315promoter 内 1014-1025 bp - 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 14952555-14953328(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr04G002200 Chr04 NC_080390.1:35633201-35633212promoter 内 958-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 35627112-35630169(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G001296 Chr05 NC_080391.1:11144984-11144995promoter 内 958-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 11138888-11141952(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr05G003143 Chr05 NC_080391.1:40100931-40100942promoter 内 955-966 bp - 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 40094883-40097896(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr03G000827 Chr03 NC_080389.1:9456644-9456655promoter 内 942-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 9459703-9460153(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr02G003587 Chr02 NC_080388.1:57074465-57074476promoter 内 883-894 bp + 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 57077583-57079296(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr07G003006 Chr07 NC_080393.1:30887445-30887456promoter 内 791-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 30890655-30893055(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAG
SmilChr06G001276 Chr06 NC_080392.1:13358084-13358095promoter 内 789-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 13361296-13364685(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTG
SmilChr03G001938 Chr03 NC_080389.1:27514473-27514484promoter 内 606-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 27517868-27523585(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCGC
SmilChr05G002430 Chr05 NC_080391.1:26778155-26778166promoter 内 306-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 26771574-26774471(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCAG
SmilChr01G005421 Chr01 NC_080387.1:71399922-71399933promoter 内 296-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 71403627-71407525(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr01G000675 Chr01 NC_080387.1:14956304-14956315promoter 内 172-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 14951533-14952486(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr08G003670 Chr08 NC_080394.1:40635107-40635118promoter 内 73-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.1/ 100 1 40628965-40631190(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTG
SmilChr08G003334 Chr08 NC_080394.1:34638211-34638222promoter 内 3326-3337 bp + 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 3 34638886-34640922(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGCCAGCTGTT
SmilChr02G002301 Chr02 NC_080388.1:40608323-40608334promoter 内 873-884 bp - 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 3 40603598-40605206(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGCCAGCTGTT
SmilChr07G002217 Chr07 NC_080393.1:20407961-20407972promoter 内 864-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 3 20411098-20417709(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGTC
SmilChr06G000945 Chr06 NC_080392.1:9058423-9058434promoter 内 3930-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 9058494-9063333(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCGT