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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 98 / 123 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002621 Chr02 NC_080388.1:45516413-45516427promoter 内 40-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 45520374-45524679(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCACCGACGAGATG
SmilChr03G000385 Chr03 NC_080389.1:4278918-4278932promoter 内 19-33 bp + 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4282900-4291525(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATTAGCGGCGGTGGT
SmilChr08G000918 Chr08 NC_080394.1:6791788-6791802promoter 内 2459-2473 bp - 1528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 6789569-6790260(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GATATTGGCGGCGGG
SmilChr03G003334 Chr03 NC_080389.1:51607497-51607511promoter 内 1733-1747 bp - 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 51609765-51612494(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACCGACCG
SmilChr08G000920 Chr08 NC_080394.1:6791788-6791802promoter 内 547-561 bp - 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 6795242-6797930(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCGCCGCCAATATC
SmilChr06G001680 Chr06 NC_080392.1:19064599-19064613promoter 内 483-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 19068117-19073100(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGGGCGGCGGTGGT
SmilChr06G001301 Chr06 NC_080392.1:13555034-13555048promoter 内 3923-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 13555112-13556113(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCGACCGACACTTCT
SmilChr01G001309 Chr01 NC_080387.1:26044936-26044950promoter 内 3917-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26042074-26044866(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACCTAGCC
SmilChr08G001065 Chr08 NC_080394.1:8223488-8223502promoter 内 3829-3843 bp + 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 8217138-8223330(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TACACCGACAAATAT
SmilChr06G000701 Chr06 NC_080392.1:6259513-6259527promoter 内 3824-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 6259690-6267015(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGGTGAGTCGGTGGG
SmilChr03G000343 Chr03 NC_080389.1:3885700-3885714promoter 内 3751-3765 bp + 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 3883590-3885464(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACAAGCAA
SmilChr06G002059 Chr06 NC_080392.1:27106286-27106300promoter 内 3697-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 27104848-27105996(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATAATGACGGTGGT
SmilChr08G001437 Chr08 NC_080394.1:11522527-11522541promoter 内 3692-3706 bp - 295 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11520739-11522232(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGGGCGGCGGTGGT
SmilChr08G004071 Chr08 NC_080394.1:49351655-49351669promoter 内 3692-3706 bp - 295 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49349857-49351360(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGGGCGGCGGTGGT
SmilChr08G001436 Chr08 NC_080394.1:11517080-11517094promoter 内 3614-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 11515258-11516707(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGGGCGGCGGTGGT
SmilChr03G000335 Chr03 NC_080389.1:3812547-3812561promoter 内 3549-3563 bp - 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 3797148-3812109(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAGTTGTCGGTCGA
SmilChr01G001310 Chr01 NC_080387.1:26044936-26044950promoter 内 3442-3456 bp + 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26045495-26046293(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCTAGGTCGGTGAC
SmilChr03G001258 Chr03 NC_080389.1:14497750-14497764promoter 内 3429-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 14493913-14497192(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACCAAACG
SmilChr05G002240 Chr05 NC_080391.1:24046191-24046205promoter 内 3407-3421 bp + 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 24046785-24048737(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TAATTCGTCGGTGAA
SmilChr01G003714 Chr01 NC_080387.1:55481208-55481222promoter 内 3406-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 55481803-55486554(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CACACCGACAAAATG
SmilChr03G004423 Chr03 NC_080389.1:62397254-62397268promoter 内 3341-3355 bp + 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 62394783-62396608(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CACACCGACATCCAC
SmilChr05G004369 Chr05 NC_080391.1:57208486-57208500promoter 内 3292-3306 bp - 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 57206195-57207791(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTTATCGTCGGTGCA
SmilChr03G004682 Chr03 NC_080389.1:64238094-64238108promoter 内 3264-3278 bp + 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64238831-64239774(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTGTTCGGCGGTGGT
SmilChr05G002239 Chr05 NC_080391.1:24046191-24046205promoter 内 3205-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 24042618-24045409(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACGAATTA
SmilChr06G000774 Chr06 NC_080392.1:7262415-7262429promoter 内 3193-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 7263223-7265863(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCGCCGTCAATATC
SmilChr07G001848 Chr07 NC_080393.1:15995829-15995843promoter 内 3173-3187 bp - 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 15996657-16004685(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AACACCGACACGAAT
SmilChr05G002300 Chr05 NC_080391.1:24823483-24823497promoter 内 3146-3160 bp - 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 24821819-24822642(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCGCCGTCGGTGAG
SmilChr08G004070 Chr08 NC_080394.1:49346206-49346220promoter 内 3096-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49344419-49345315(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGGGCGGCGGTGGT
SmilChr07G001584 Chr07 NC_080393.1:13073745-13073759promoter 内 3095-3109 bp - 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 13061187-13072853(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAAATTGTCGGCGCT
SmilChr03G000364 Chr03 NC_080389.1:4081549-4081563promoter 内 3093-3107 bp + 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 4082457-4083367(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGGGCGGCGGTGGT
SmilChr02G003487 Chr02 NC_080388.1:56131034-56131048promoter 内 3060-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 56131975-56134674(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCGGGCGGCGGTGGT
SmilChr05G000393 Chr05 NC_080391.1:2962168-2962182promoter 内 3008-3022 bp + 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 2958246-2961189(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCGCCGACAAAATT
SmilChr04G000532 Chr04 NC_080390.1:5884424-5884438promoter 内 2952-2966 bp - 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 5880920-5883389(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTTGACGGCGGTGGT
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SmilChr05G000695 Chr05 NC_080391.1:5247704-5247718promoter 内 2870-2884 bp - 1117 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 5248835-5249907(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CACACCGACAAATTT
SmilChr01G003624 Chr01 NC_080387.1:54796965-54796979promoter 内 2819-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54798147-54802830(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATGTGCGTCGGTGCG
SmilChr06G002847 Chr06 NC_080392.1:41236164-41236178promoter 内 2790-2804 bp + 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 41237375-41240138(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAGGCAGTCGGTGGT
SmilChr04G003726 Chr04 NC_080390.1:53595706-53595720promoter 内 2712-2726 bp + 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 53590583-53594431(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCCGG
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SmilChr03G004681 Chr03 NC_080389.1:64238094-64238108promoter 内 2682-2696 bp + 1305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64234590-64236789(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGAACAC
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SmilChr06G002036 Chr06 NC_080392.1:26616043-26616057promoter 内 2538-2552 bp - 1449 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26617506-26618147(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCCTT
SmilChr04G001332 Chr04 NC_080390.1:21516326-21516340promoter 内 2487-2501 bp - 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 21517840-21523385(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACAACCGACAAAACC
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SmilChr07G002696 Chr07 NC_080393.1:26308455-26308469promoter 内 2065-2079 bp + 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26310391-26312877(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTTAGCGGCGGTGGT
SmilChr02G004374 Chr02 NC_080388.1:66097464-66097478promoter 内 2001-2015 bp + 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 66099464-66100314(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCGCCGTCGGTGAG
SmilChr02G004370 Chr02 NC_080388.1:66023673-66023687promoter 内 1939-1953 bp + 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 66025735-66034194(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCGCCGTCGGTGAG