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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 108 / 142 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004721 Chr03 NC_080389.1:64431033-64431047promoter 内 2875-2889 bp - 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 64429098-64429921(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACTCCTTC
SmilChr07G001058 Chr07 NC_080393.1:7741820-7741834promoter 内 2872-2886 bp - 1115 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7736645-7740705(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCGGGGA
SmilChr03G003566 Chr03 NC_080389.1:54298843-54298857promoter 内 2834-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54296681-54297690(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTGAAGGTAGGTACA
SmilChr08G002714 Chr08 NC_080394.1:26727781-26727795promoter 内 2812-2826 bp + 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26728970-26735140(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTTTTAC
SmilChr04G002486 Chr04 NC_080390.1:39701388-39701402promoter 内 2767-2781 bp + 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 39697429-39700168(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTGCAGTAGGTGTG
SmilChr04G002511 Chr04 NC_080390.1:40096578-40096592promoter 内 2751-2765 bp + 1236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40092924-40095342(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTGCAGTAGGTGTG
SmilChr03G003683 Chr03 NC_080389.1:55678366-55678380promoter 内 2732-2746 bp - 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 55679635-55681221(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGACAGGTAGGTGCT
SmilChr06G000007 Chr06 NC_080392.1:179049-179063promoter 内 2683-2697 bp + 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 180367-184233(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCAACCGCCACCAC
SmilChr01G000405 Chr01 NC_080387.1:8241444-8241458promoter 内 2663-2677 bp - 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8237862-8240120(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTTACCAGCCACCAC
SmilChr08G002410 Chr08 NC_080394.1:22892169-22892183promoter 内 2655-2669 bp - 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22893515-22896970(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTATAGTAGGTGGT
SmilChr04G002856 Chr04 NC_080390.1:44669675-44669689promoter 内 2650-2664 bp - 1337 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44671026-44672169(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCATCGGTAGGTACA
SmilChr01G004188 Chr01 NC_080387.1:60305860-60305874promoter 内 2629-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 60307232-60320496(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATAGTAGTAGGTGGT
SmilChr07G002284 Chr07 NC_080393.1:21114707-21114721promoter 内 2539-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 21116169-21151610(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTAATGGTAGGTGAT
SmilChr01G001278 Chr01 NC_080387.1:25579290-25579304promoter 内 2489-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 25577118-25577792(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACTATCCG
SmilChr07G003115 Chr07 NC_080393.1:33055670-33055684promoter 内 2477-2491 bp + 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33057194-33061584(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTAACTACCACCAA
SmilChr07G003132 Chr07 NC_080393.1:33254882-33254896promoter 内 2463-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33256420-33260459(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTAACTACCACCAA
SmilChr02G004623 Chr02 NC_080388.1:68741147-68741161promoter 内 2416-2430 bp - 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68739106-68739576(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTTTTAC
SmilChr07G004241 Chr07 NC_080393.1:54828231-54828245promoter 内 2407-2421 bp + 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54829825-54832814(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCTTTTG
SmilChr02G001847 Chr02 NC_080388.1:33699707-33699721promoter 内 2379-2393 bp - 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33701329-33702519(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCAATGGTAGGTAGC
SmilChr02G001937 Chr02 NC_080388.1:34776959-34776973promoter 内 2360-2374 bp + 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 34774139-34775332(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCAATGGTAGGTAGC
SmilChr06G003115 Chr06 NC_080392.1:44007091-44007105promoter 内 2275-2289 bp + 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44000739-44005379(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATATAGGTAGGTGTA
SmilChr07G000344 Chr07 NC_080393.1:2329035-2329049promoter 内 2271-2285 bp + 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2330765-2332327(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTACCTACCGACGG
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SmilChr01G002755 Chr01 NC_080387.1:45859283-45859297promoter 内 2200-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45861084-45862112(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AACACCTACCGAAGT
SmilChr07G002579 Chr07 NC_080393.1:24689890-24689904promoter 内 2174-2188 bp - 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24691717-24692485(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAGTGGTAGTTGAT
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SmilChr05G001526 Chr05 NC_080391.1:13990374-13990388promoter 内 2090-2104 bp - 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 13987881-13988477(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTCCAAG
SmilChr06G001366 Chr06 NC_080392.1:14269922-14269936promoter 内 2053-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 14263395-14267988(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTAAAAGTAGGTGGA
SmilChr08G004613 Chr08 NC_080394.1:55683935-55683949promoter 内 1984-1998 bp - 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 55679317-55681932(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCCAATT
SmilChr02G003338 Chr02 NC_080388.1:54610802-54610816promoter 内 1972-1986 bp - 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54605565-54608787(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACTCTCGC
SmilChr04G003624 Chr04 NC_080390.1:52733391-52733405promoter 内 1949-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52727709-52731353(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTAAAAGTAGGTGGA
SmilChr08G002713 Chr08 NC_080394.1:26727781-26727795promoter 内 1938-1952 bp + 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26720750-26725732(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTAAAAGTAGGTGGA
SmilChr06G002803 Chr06 NC_080392.1:40747769-40747783promoter 内 1808-1822 bp + 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40741892-40745590(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGTAAGTAGGTGGT
SmilChr01G004951 Chr01 NC_080387.1:67595118-67595132promoter 内 1801-1815 bp + 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67590086-67592932(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTTGTGGTAGTTAAA
SmilChr01G002599 Chr01 NC_080387.1:44160519-44160533promoter 内 1728-1742 bp - 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44154876-44158260(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTAACATTTA
SmilChr01G006052 Chr01 NC_080387.1:76016232-76016246promoter 内 1705-1719 bp + 2282 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 76012807-76013950(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGCATAGTAGGTGGT
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SmilChr01G000570 Chr01 NC_080387.1:11835574-11835588promoter 内 1521-1535 bp + 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11838054-11840706(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTTACCAGCCACCAC
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SmilChr04G003667 Chr04 NC_080390.1:53121541-53121555promoter 内 1408-1422 bp - 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53114874-53118962(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTACCTACCCTGTC
SmilChr08G000911 Chr08 NC_080394.1:6725821-6725835promoter 内 1270-1284 bp + 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6728552-6730956(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTTTTAC
SmilChr01G005076 Chr01 NC_080387.1:68636516-68636530promoter 内 1256-1270 bp - 2731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68639261-68642398(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTTTAGTAGGTGGA
SmilChr08G003736 Chr08 NC_080394.1:42237497-42237511promoter 内 1165-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42219041-42234675(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCATCGGTAGGTACA
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SmilChr07G004468 Chr07 NC_080393.1:57252395-57252409promoter 内 1112-1126 bp + 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57255284-57259036(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCTTTTG
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SmilChr08G003261 Chr08 NC_080394.1:33608068-33608082promoter 内 989-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33599650-33605070(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCTTTTG
SmilChr07G004629 Chr07 NC_080393.1:59143561-59143575promoter 内 958-972 bp - 3029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59146604-59161952(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGGATAGTAGGTGGT