转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 115 / 136 下载 TSV

上一页 115 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001204 Chr02 NC_080388.1:22199906-22199916promoter 内 3698-3708 bp - 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 8 22198792-22199613(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr06G002281 Chr06 NC_080392.1:32749941-32749951promoter 内 1027-1037 bp + 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 8 32752915-32754573(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr01G000001 Chr01 NC_080387.1:44294-44304promoter 内 556-566 bp + 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 8 47739-50415(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr05G002307 Chr05 NC_080391.1:24926871-24926881promoter 内 3095-3105 bp + 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 6 24925163-24925975(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCA
SmilChr03G002323 Chr03 NC_080389.1:36576517-36576527promoter 内 1084-1094 bp - 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 6 36579434-36582596(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCA
SmilChr08G003500 Chr08 NC_080394.1:37562243-37562253promoter 内 3121-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 5 37559635-37561373(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr08G002191 Chr08 NC_080394.1:19789475-19789485promoter 内 2743-2753 bp - 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 5 19787523-19788227(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr03G002440 Chr03 NC_080389.1:38738346-38738356promoter 内 2082-2092 bp + 1909 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 5 38740265-38741618(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr01G001456 Chr01 NC_080387.1:28252878-28252888promoter 内 1454-1464 bp - 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 5 28243438-28250341(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCA
SmilChr08G003499 Chr08 NC_080394.1:37562243-37562253promoter 内 452-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 5 37556947-37558704(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr07G003004 Chr07 NC_080393.1:30846709-30846719promoter 内 1894-1904 bp + 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 4 30848816-30849862(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr05G001226 Chr05 NC_080391.1:10340278-10340288promoter 内 1169-1179 bp - 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 4 10332894-10337456(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr06G002787 Chr06 NC_080392.1:40555970-40555980promoter 内 613-623 bp + 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 4 40547991-40552592(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAT
SmilChr06G000763 Chr06 NC_080392.1:7080784-7080794promoter 内 487-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 4 7073968-7077280(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCA
SmilChr04G003542 Chr04 NC_080390.1:51774035-51774045promoter 内 3016-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 3 51769028-51773060(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAAGG
SmilChr08G004315 Chr08 NC_080394.1:52847337-52847347promoter 内 2060-2070 bp + 1931 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 3 52849278-52849910(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCA
SmilChr08G004006 Chr08 NC_080394.1:48406196-48406206promoter 内 710-720 bp + 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 3 48399954-48402915(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAT
SmilChr07G001301 Chr07 NC_080393.1:9992256-9992266promoter 内 3124-3134 bp - 867 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 9979735-9991389(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr01G000216 Chr01 NC_080387.1:3783162-3783172promoter 内 3084-3094 bp + 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 3784079-3786946(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr04G002366 Chr04 NC_080390.1:38157773-38157783promoter 内 2916-2926 bp - 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 38152966-38156698(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCA
SmilChr02G001681 Chr02 NC_080388.1:31049419-31049429promoter 内 2658-2668 bp - 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 31050762-31051106(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAT
SmilChr08G003762 Chr08 NC_080394.1:43032162-43032172promoter 内 1627-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 43028563-43029798(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr02G001938 Chr02 NC_080388.1:34829531-34829541promoter 内 1572-1582 bp + 2419 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 34831960-34835432(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr04G002367 Chr04 NC_080390.1:38157811-38157821promoter 内 1225-1235 bp - 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 38160587-38162325(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAAGG
SmilChr07G001302 Chr07 NC_080393.1:9992444-9992454promoter 内 704-714 bp - 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 9995741-9995822(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCA
SmilChr01G000256 Chr01 NC_080387.1:4903447-4903457promoter 内 367-377 bp - 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 4898877-4899823(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCA
SmilChr08G003978 Chr08 NC_080394.1:47858227-47858237promoter 内 305-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 2 47861923-47867821(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCA
SmilChr08G004368 Chr08 NC_080394.1:53422832-53422842promoter 内 3931-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 53422902-53434615(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCA
SmilChr02G000413 Chr02 NC_080388.1:5247613-5247623promoter 内 3875-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 5244170-5247497(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G002329 Chr03 NC_080389.1:36649078-36649088promoter 内 3796-3806 bp + 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 36646086-36648883(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACTT
SmilChr07G003861 Chr07 NC_080393.1:48078965-48078975promoter 内 3734-3744 bp + 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 48075734-48078708(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAAGG
SmilChr07G002377 Chr07 NC_080393.1:22119737-22119747promoter 内 3718-3728 bp - 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 22119394-22119464(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr02G001543 Chr02 NC_080388.1:28682357-28682367promoter 内 3564-3574 bp + 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 28682794-28685836(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCC
SmilChr08G004746 Chr08 NC_080394.1:56833639-56833649promoter 内 3513-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 56830376-56833161(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCC
SmilChr07G003486 Chr07 NC_080393.1:39360922-39360932promoter 内 3427-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 39359894-39360358(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAAGG
SmilChr06G002501 Chr06 NC_080392.1:35894069-35894079promoter 内 3395-3405 bp - 596 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 35891276-35893473(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr01G003715 Chr01 NC_080387.1:55491163-55491173promoter 内 3379-3389 bp + 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 55486465-55490551(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCA
SmilChr07G000076 Chr07 NC_080393.1:359242-359252promoter 内 3315-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 354747-358566(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGTG
SmilChr01G002543 Chr01 NC_080387.1:43505636-43505646promoter 内 3312-3322 bp + 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 43504852-43504957(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr05G003300 Chr05 NC_080391.1:43189506-43189516promoter 内 3305-3315 bp - 686 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 43190202-43190307(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr02G001829 Chr02 NC_080388.1:33303740-33303750promoter 内 3300-3310 bp - 691 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 33304441-33304544(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr02G000680 Chr02 NC_080388.1:10703897-10703907promoter 内 3291-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 10704607-10704712(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G002122 Chr03 NC_080389.1:32990207-32990217promoter 内 3291-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 32990917-32991022(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr08G003868 Chr08 NC_080394.1:45706439-45706449promoter 内 3253-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 45705596-45705701(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G001851 Chr03 NC_080389.1:25489373-25489383promoter 内 3242-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 25490132-25490237(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G001626 Chr03 NC_080389.1:20917410-20917420promoter 内 3240-3250 bp - 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 20918171-20918276(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr06G002004 Chr06 NC_080392.1:25701254-25701264promoter 内 3229-3239 bp + 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 25700387-25700492(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr06G002127 Chr06 NC_080392.1:28600574-28600584promoter 内 3229-3239 bp + 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 28599707-28599812(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G001852 Chr03 NC_080389.1:25508751-25508761promoter 内 3228-3238 bp + 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 25507883-25507988(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G002507 Chr03 NC_080389.1:39915261-39915271promoter 内 3228-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 39916034-39916139(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC