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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 117 / 126 下载 TSV

上一页 117 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001215 Chr03 NC_080389.1:13969153-13969167promoter 内 1218-1232 bp - 2769 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 13971936-13972914(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATTTAGC
SmilChr03G003105 Chr03 NC_080389.1:48192075-48192089promoter 内 1138-1152 bp + 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 48194938-48196021(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCCAAACACGTGGCT
SmilChr01G004161 Chr01 NC_080387.1:60106345-60106359promoter 内 1099-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 60103351-60103457(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGTTTCC
SmilChr01G004162 Chr01 NC_080387.1:60112207-60112221promoter 内 1099-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 60109213-60109319(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGTTTCC
SmilChr05G001410 Chr05 NC_080391.1:12725760-12725774promoter 内 1084-1098 bp + 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 12722751-12722857(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGTTTCC
SmilChr04G001157 Chr04 NC_080390.1:17112079-17112093promoter 内 1061-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 17115019-17115125(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGGTTTCC
SmilChr08G002458 Chr08 NC_080394.1:23398611-23398625promoter 内 999-1013 bp + 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 23401613-23404622(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CCGAACGACGTGGCC
SmilChr01G001187 Chr01 NC_080387.1:23984443-23984457promoter 内 966-980 bp + 3021 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 23987478-24027590(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTAGACACGTGTAA
SmilChr06G001369 Chr06 NC_080392.1:14319380-14319394promoter 内 854-868 bp - 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 14322527-14329787(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCGATTTT
SmilChr01G000464 Chr01 NC_080387.1:9522049-9522063promoter 内 825-839 bp - 3162 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 9525225-9527003(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGTTACA
SmilChr03G004035 Chr03 NC_080389.1:59352851-59352865promoter 内 747-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 59347460-59349611(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTCCACGTGTCTCTA
SmilChr04G000627 Chr04 NC_080390.1:7136528-7136542promoter 内 647-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 7132128-7133188(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGATCCCACGTGGAA
SmilChr04G001111 Chr04 NC_080390.1:15948598-15948612promoter 内 608-622 bp + 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 15944272-15945219(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATCCACGTGGCCTGC
SmilChr02G003943 Chr02 NC_080388.1:61573301-61573315promoter 内 529-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 61576773-61582490(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAATTTG
SmilChr07G001140 Chr07 NC_080393.1:8563220-8563234promoter 内 436-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8556802-8559669(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTGACCTACGTGGCA
SmilChr06G001651 Chr06 NC_080392.1:18716106-18716120promoter 内 398-412 bp - 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 18710658-18712517(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATACAATACGTGGCA
SmilChr05G002616 Chr05 NC_080391.1:29435267-29435281promoter 内 295-309 bp + 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 29428360-29431575(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCATGGTT
SmilChr05G003271 Chr05 NC_080391.1:42508080-42508094promoter 内 155-169 bp + 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 42511926-42514773(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCTATGACGTGGCT
SmilChr01G000509 Chr01 NC_080387.1:10350263-10350277promoter 内 41-55 bp + 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 10339985-10346317(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTTACTA
SmilChr05G000341 Chr05 NC_080391.1:2544455-2544469promoter 内 24-38 bp - 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2548432-2548504(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAATTTAT
SmilChr07G002993 Chr07 NC_080393.1:30594792-30594806promoter 内 21-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 30598772-30602735(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAATAAG
SmilChr02G003802 Chr02 NC_080388.1:59651264-59651278promoter 内 20-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 59655245-59658777(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCATGGTT
SmilChr04G002652 Chr04 NC_080390.1:41911070-41911084promoter 内 3486-3500 bp + 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 5 41909552-41910569(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr04G002611 Chr04 NC_080390.1:41507306-41507320promoter 内 3411-3425 bp + 576 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 5 41505716-41506730(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr08G001958 Chr08 NC_080394.1:17248093-17248107promoter 内 2646-2660 bp + 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 3 17245213-17246752(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCTCGGGG
SmilChr01G003282 Chr01 NC_080387.1:51513348-51513362promoter 内 2394-2408 bp + 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 3 51514955-51522867(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr04G000677 Chr04 NC_080390.1:7739313-7739327promoter 内 2212-2226 bp + 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 7741102-7747480(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr01G002530 Chr01 NC_080387.1:43321208-43321222promoter 内 1582-1596 bp - 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 43317510-43318803(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr01G001388 Chr01 NC_080387.1:27293334-27293348promoter 内 612-626 bp - 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 27283075-27289959(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr08G003869 Chr08 NC_080394.1:45776926-45776940promoter 内 260-274 bp + 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 45780667-45784276(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GATAGCCACGTGGAC
SmilChr05G000146 Chr05 NC_080391.1:1188940-1188954promoter 内 3958-3972 bp - 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 1188983-1190697(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAAACATG
SmilChr07G001824 Chr07 NC_080393.1:15730905-15730919promoter 内 3935-3949 bp - 52 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 15730231-15730853(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GCGTCACACGTGTCT
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SmilChr05G000208 Chr05 NC_080391.1:1652612-1652626promoter 内 3884-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 1649337-1652509(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAGCAAACGTGGCA
SmilChr04G002016 Chr04 NC_080390.1:32680133-32680147promoter 内 3865-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 32677657-32680011(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCTCAACACGTGTCC
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SmilChr03G003198 Chr03 NC_080389.1:49510433-49510447promoter 内 3827-3841 bp + 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49506467-49510273(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGACACGTGTTTTTG
SmilChr02G001477 Chr02 NC_080388.1:27624925-27624939promoter 内 3757-3771 bp - 230 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 27620996-27624695(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr07G001694 Chr07 NC_080393.1:14351606-14351620promoter 内 3737-3751 bp + 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 14351870-14352947(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTGCCAACGTGGCA
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SmilChr07G003414 Chr07 NC_080393.1:37207015-37207029promoter 内 3674-3688 bp + 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 37207342-37210785(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCAACAGACGTGGCT
SmilChr07G003429 Chr07 NC_080393.1:37597519-37597533promoter 内 3612-3626 bp - 375 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 37597908-37600998(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTTGGCACA
SmilChr08G003523 Chr08 NC_080394.1:37837102-37837116promoter 内 3551-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 37836183-37836666(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAAGCCACGTGGAG
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SmilChr06G001796 Chr06 NC_080392.1:21072159-21072173promoter 内 3257-3271 bp - 730 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 21068920-21071429(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAATATTACGTGGCG
SmilChr05G000948 Chr05 NC_080391.1:7656751-7656765promoter 内 3255-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 7657497-7658241(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTGCCAACGTGGCA