靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。
输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00027732-RA_Salv |
SmilChr01G003404 |
bZIP | XP_057773670.1 |
MP00184 |
TTGACAGCTGTA |
9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 134 / 143 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 标准化 motif 得分 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr01G000805 |
Chr01 | NC_080387.1:17420940-17420951promoter 内 199-210 bp |
+ | 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 17424742-17427727(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TTGACAGTTATA |
SmilChr02G002785 |
Chr02 | NC_080388.1:47922337-47922348promoter 内 134-145 bp |
- | 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 47926204-47929556(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TATAACTGTCAA |
SmilChr07G003918 |
Chr07 | NC_080393.1:49467399-49467410promoter 内 91-102 bp |
- | 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.5/ 100 | 1 | 49460715-49463500(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GAGACAGCTGCG |
SmilChr01G000239 |
Chr01 | NC_080387.1:4489282-4489293promoter 内 3786-3797 bp |
+ | 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 4489497-4492600(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AGACCAGCTGTT |
SmilChr03G004139 |
Chr03 | NC_080389.1:60238060-60238071promoter 内 3300-3311 bp |
- | 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 60235348-60237370(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCGACAGCTGCT |
SmilChr07G000449 |
Chr07 | NC_080393.1:3170521-3170532promoter 内 3169-3180 bp |
+ | 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 3164387-3169700(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GGTAGCTGTCAC |
SmilChr01G005438 |
Chr01 | NC_080387.1:71517464-71517475promoter 内 453-464 bp |
- | 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 71509433-71513927(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AGACCAGCTGTT |
SmilChr04G003463 |
Chr04 | NC_080390.1:51107097-51107108promoter 内 254-265 bp |
+ | 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 51110844-51121902(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AGACCAGCTGTT |
SmilChr01G005441 |
Chr01 | NC_080387.1:71517464-71517475promoter 内 35-46 bp |
- | 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 2 | 71521430-71523973(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AACAGCTGGTCT |
SmilChr07G002392 |
Chr07 | NC_080393.1:22298058-22298069promoter 内 3972-3983 bp |
+ | 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 22298087-22301851(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AGACCAGCTGTT |
SmilChr07G004336 |
Chr07 | NC_080393.1:55917974-55917985promoter 内 3971-3982 bp |
- | 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 55915666-55917955(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AAGACAGCTGCA |
SmilChr07G004352 |
Chr07 | NC_080393.1:56067967-56067978promoter 内 3971-3982 bp |
+ | 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 56067997-56070217(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AAGACAGCTGCA |
SmilChr05G001243 |
Chr05 | NC_080391.1:10550845-10550856promoter 内 3910-3921 bp |
- | 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 10550936-10553861(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCCA |
SmilChr01G001240 |
Chr01 | NC_080387.1:24798586-24798597promoter 内 3895-3906 bp |
- | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 24798692-24798797(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr02G003382 |
Chr02 | NC_080388.1:54934287-54934298promoter 内 3895-3906 bp |
+ | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 54934086-54934192(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr03G001883 |
Chr03 | NC_080389.1:26219455-26219466promoter 内 3895-3906 bp |
+ | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 26219255-26219360(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr03G002034 |
Chr03 | NC_080389.1:30599207-30599218promoter 内 3895-3906 bp |
- | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 30599313-30599418(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr04G000791 |
Chr04 | NC_080390.1:9773143-9773154promoter 内 3895-3906 bp |
- | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 9773249-9773354(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr05G001333 |
Chr05 | NC_080391.1:11627992-11628003promoter 内 3895-3906 bp |
- | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 11628098-11628203(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr06G002160 |
Chr06 | NC_080392.1:29626166-29626177promoter 内 3895-3906 bp |
- | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 29626272-29626377(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr06G002355 |
Chr06 | NC_080392.1:34286968-34286979promoter 内 3895-3906 bp |
+ | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 34286768-34286873(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr08G003279 |
Chr08 | NC_080394.1:33913168-33913179promoter 内 3895-3906 bp |
+ | 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 33912968-33913073(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr04G001664 |
Chr04 | NC_080390.1:27601386-27601397promoter 内 3855-3866 bp |
- | 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 27600546-27601251(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GCAACAGCTGAA |
SmilChr01G001085 |
Chr01 | NC_080387.1:22290075-22290086promoter 内 3739-3750 bp |
+ | 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 22287740-22289824(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AACAGCTGGTCT |
SmilChr06G001595 |
Chr06 | NC_080392.1:17653152-17653163promoter 内 3670-3681 bp |
+ | 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 17650383-17652832(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCCAGCTGTTTC |
SmilChr01G001469 |
Chr01 | NC_080387.1:28477490-28477501promoter 内 3561-3572 bp |
+ | 429 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 28471739-28477061(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCTAACTGTCAA |
SmilChr01G000788 |
Chr01 | NC_080387.1:17144093-17144104promoter 内 3482-3493 bp |
- | 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 17141217-17143585(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCAACAGCTGTG |
SmilChr02G002706 |
Chr02 | NC_080388.1:46911720-46911731promoter 内 3428-3439 bp |
- | 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 46906815-46911158(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GAAACAGCTGGG |
SmilChr02G002446 |
Chr02 | NC_080388.1:42689938-42689949promoter 内 3382-3393 bp |
+ | 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 42688073-42689330(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCTAACTGTCAA |
SmilChr04G003535 |
Chr04 | NC_080390.1:51717737-51717748promoter 内 3373-3384 bp |
+ | 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 51714983-51717120(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr05G003287 |
Chr05 | NC_080391.1:42974650-42974661promoter 内 3368-3379 bp |
+ | 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 42975283-42977055(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AAGACAGCTGCA |
SmilChr03G001663 |
Chr03 | NC_080389.1:21566503-21566514promoter 内 3334-3345 bp |
- | 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 21564855-21565847(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCAACAGCTGTG |
SmilChr02G001749 |
Chr02 | NC_080388.1:32108380-32108391promoter 内 3297-3308 bp |
+ | 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 32109084-32110010(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCAACAGCTGTG |
SmilChr07G001165 |
Chr07 | NC_080393.1:8724831-8724842promoter 内 3288-3299 bp |
+ | 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 8719011-8724129(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr07G004379 |
Chr07 | NC_080393.1:56336457-56336468promoter 内 3217-3228 bp |
+ | 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 56337241-56338762(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
CCAACAGCTGTG |
SmilChr07G003645 |
Chr07 | NC_080393.1:43224360-43224371promoter 内 3032-3043 bp |
- | 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 43225329-43226439(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AGCAGCTGTCTC |
SmilChr01G003673 |
Chr01 | NC_080387.1:55169191-55169202promoter 内 2993-3004 bp |
+ | 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 55170199-55171722(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GTTACAGCTGCC |
SmilChr01G003151 |
Chr01 | NC_080387.1:50312425-50312436promoter 内 2725-2736 bp |
+ | 1265 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 50313701-50316532(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GAAACAGCTGGG |
SmilChr08G000453 |
Chr08 | NC_080394.1:3223402-3223413promoter 内 2717-2728 bp |
+ | 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 3216236-3222129(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AGGAGCTGTCAC |
SmilChr08G000833 |
Chr08 | NC_080394.1:6166746-6166757promoter 内 2638-2649 bp |
- | 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 6168109-6171817(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr08G001946 |
Chr08 | NC_080394.1:17122015-17122026promoter 内 2479-2490 bp |
- | 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 17123537-17129853(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GGCAGCTGTAAC |
SmilChr07G001221 |
Chr07 | NC_080393.1:9348259-9348270promoter 内 2404-2415 bp |
- | 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 9349856-9352848(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TTCAGCTGTTGC |
SmilChr01G001447 |
Chr01 | NC_080387.1:28178373-28178384promoter 内 2365-2376 bp |
- | 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 28172135-28176748(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AAGACAGCTGCA |
SmilChr03G003021 |
Chr03 | NC_080389.1:47110587-47110598promoter 内 2284-2295 bp |
+ | 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 47112304-47113024(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
GCAACAGCTGAA |
SmilChr01G001470 |
Chr01 | NC_080387.1:28477490-28477501promoter 内 2256-2267 bp |
+ | 1734 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 28479235-28480794(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TTGACAGTTAGG |
SmilChr05G002037 |
Chr05 | NC_080391.1:21197810-21197821promoter 内 2224-2235 bp |
+ | 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 21199587-21199659(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
AAGACAGCTGCA |
SmilChr08G002430 |
Chr08 | NC_080394.1:23109109-23109120promoter 内 2197-2208 bp |
- | 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 23110913-23120419(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TACAGCTTTCTC |
SmilChr07G000033 |
Chr07 | NC_080393.1:154099-154110promoter 内 2147-2158 bp |
+ | 1843 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 150049-152256(-) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TACAGCTTTCTC |
SmilChr01G001902 |
Chr01 | NC_080387.1:34127277-34127288promoter 内 1992-2003 bp |
- | 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 34129286-34130890(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |
SmilChr04G001338 |
Chr04 | NC_080390.1:21598674-21598685promoter 内 1960-1971 bp |
- | 2030 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 90.4/ 100 | 1 | 21600715-21605879(+) |
SMil_00027732-RA_Salv |
MP00184 |
TGCAGCTGTCTT |