转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 22 / 143 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000432 Chr05 NC_080391.1:3253736-3253747promoter 内 3967-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 5 3252292-3253713(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGTA
SmilChr03G003420 Chr03 NC_080389.1:52543934-52543945promoter 内 1948-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 5 52539660-52541892(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTA
SmilChr07G000483 Chr07 NC_080393.1:3372914-3372925promoter 内 1856-1867 bp + 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 4 3375059-3378902(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGTG
SmilChr03G001706 Chr03 NC_080389.1:22650274-22650285promoter 内 1637-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 4 22652638-22657573(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr04G001945 Chr04 NC_080390.1:31571555-31571566promoter 内 1023-1034 bp - 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 4 31574533-31576376(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr02G004711 Chr02 NC_080388.1:69374155-69374166promoter 内 31-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 4 69365952-69370196(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTA
SmilChr07G003724 Chr07 NC_080393.1:45231541-45231552promoter 内 1888-1899 bp - 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 45227140-45229439(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr04G003761 Chr04 NC_080390.1:53874044-53874055promoter 内 882-893 bp - 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 53869789-53870936(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGGT
SmilChr08G003604 Chr08 NC_080394.1:39123660-39123671promoter 内 132-143 bp - 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 39113326-39119802(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTA
SmilChr05G002771 Chr05 NC_080391.1:32232882-32232893promoter 内 3963-3974 bp + 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 32232920-32233363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGGA
SmilChr02G002029 Chr02 NC_080388.1:36519896-36519907promoter 内 3947-3958 bp - 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 36519950-36521149(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTT
SmilChr05G001218 Chr05 NC_080391.1:10220936-10220947promoter 内 3434-3445 bp + 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 10221503-10222314(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGAA
SmilChr02G000636 Chr02 NC_080388.1:9618356-9618367promoter 内 3319-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 9619038-9620598(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGA
SmilChr07G002349 Chr07 NC_080393.1:21815388-21815399promoter 内 3264-3275 bp - 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 21813473-21814662(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr04G003424 Chr04 NC_080390.1:50830142-50830153promoter 内 3165-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 50827045-50829317(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr04G001205 Chr04 NC_080390.1:18637520-18637531promoter 内 2823-2834 bp + 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 18638698-18649252(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr07G002350 Chr07 NC_080393.1:21815388-21815399promoter 内 2355-2366 bp - 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 21817034-21822704(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr04G002777 Chr04 NC_080390.1:43578578-43578589promoter 内 2351-2362 bp + 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 43575176-43576939(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTT
SmilChr01G004602 Chr01 NC_080387.1:64004301-64004312promoter 内 2339-2350 bp - 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 64005963-64007353(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTT
SmilChr07G001380 Chr07 NC_080393.1:10722137-10722148promoter 内 2304-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 10718930-10720451(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGGT
SmilChr07G002386 Chr07 NC_080393.1:22270330-22270341promoter 内 2304-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 22267402-22268644(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr08G001211 Chr08 NC_080394.1:9800133-9800144promoter 内 2228-2239 bp + 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 9789896-9798371(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCTC
SmilChr02G000812 Chr02 NC_080388.1:13607499-13607510promoter 内 2220-2231 bp + 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 13609280-13609351(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr05G003214 Chr05 NC_080391.1:41239534-41239545promoter 内 2176-2187 bp - 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 41241359-41241464(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTT
SmilChr07G000894 Chr07 NC_080393.1:6428507-6428518promoter 内 2112-2123 bp + 1878 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 6430396-6431201(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGGA
SmilChr04G001161 Chr04 NC_080390.1:17249138-17249149promoter 内 2066-2077 bp - 1924 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 17246738-17247214(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr07G002848 Chr07 NC_080393.1:28594246-28594257promoter 内 2047-2058 bp - 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 28596200-28597471(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAC
SmilChr08G003343 Chr08 NC_080394.1:34771032-34771043promoter 内 1986-1997 bp - 2004 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 34773047-34774315(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCTT
SmilChr05G001217 Chr05 NC_080391.1:10220936-10220947promoter 内 1977-1988 bp + 2013 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 10216675-10218923(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGA
SmilChr03G003200 Chr03 NC_080389.1:49538976-49538987promoter 内 1902-1913 bp - 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 49541075-49543951(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAG
SmilChr08G001213 Chr08 NC_080394.1:9800133-9800144promoter 内 1847-1858 bp + 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 9802287-9805250(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGTG
SmilChr01G002946 Chr01 NC_080387.1:48333748-48333759promoter 内 1790-1801 bp - 2200 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 48335959-48339486(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr02G002071 Chr02 NC_080388.1:37294376-37294387promoter 内 1693-1704 bp - 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 37296684-37298030(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCGG
SmilChr08G001324 Chr08 NC_080394.1:10590541-10590552promoter 内 1573-1584 bp + 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 10592969-10597296(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr07G003654 Chr07 NC_080393.1:43450868-43450879promoter 内 1133-1144 bp + 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 43453736-43459589(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr02G002418 Chr02 NC_080388.1:42176709-42176720promoter 内 1129-1140 bp - 2861 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 42172958-42173848(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGGT
SmilChr01G001726 Chr01 NC_080387.1:31799929-31799940promoter 内 1098-1109 bp - 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 31794900-31797037(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGGA
SmilChr05G002513 Chr05 NC_080391.1:27888511-27888522promoter 内 1082-1093 bp + 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 27881707-27885603(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAC
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SmilChr01G002014 Chr01 NC_080387.1:35693873-35693884promoter 内 982-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 35689427-35690865(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr08G001899 Chr08 NC_080394.1:16503742-16503753promoter 内 924-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 16506819-16508484(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
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SmilChr05G002864 Chr05 NC_080391.1:34219210-34219221promoter 内 788-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 34212102-34216008(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr01G000460 Chr01 NC_080387.1:9428880-9428891promoter 内 758-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 9423489-9425648(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr03G002016 Chr03 NC_080389.1:30099488-30099499promoter 内 677-688 bp - 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 30095714-30096175(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGGA
SmilChr06G000808 Chr06 NC_080392.1:7595751-7595762promoter 内 475-486 bp + 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 7588222-7592236(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAC
SmilChr05G002863 Chr05 NC_080391.1:34144534-34144545promoter 内 274-285 bp + 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 34148261-34149547(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr05G003383 Chr05 NC_080391.1:44821987-44821998promoter 内 227-238 bp + 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 44825761-44827943(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG