转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000830; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021489-RA_Salv SmilChr05G000830 NAC XP_057764550.1 MP00058 TACGTAAC

可能结合的靶基因

9855 个结合位点 7440 个候选靶基因 第 25 / 149 下载 TSV

上一页 25 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000343 Chr02 NC_080388.1:4466367-4466374promoter 内 161-168 bp - 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 4470207-4470950(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr04G003055 Chr04 NC_080390.1:47140565-47140572promoter 内 160-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 47135548-47136731(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr02G003812 Chr02 NC_080388.1:59747845-59747852promoter 内 153-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 59740148-59744004(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr06G001886 Chr06 NC_080392.1:22514401-22514408promoter 内 146-153 bp + 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 22518256-22520753(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr05G000583 Chr05 NC_080391.1:4395638-4395645promoter 内 140-147 bp - 3854 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 4399499-4401407(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr01G004631 Chr01 NC_080387.1:64355739-64355746promoter 内 139-146 bp - 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 64349703-64351884(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr05G001931 Chr05 NC_080391.1:19652358-19652365promoter 内 136-143 bp - 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 19644143-19648500(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr03G004219 Chr03 NC_080389.1:60764142-60764149promoter 内 133-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 60759102-60760281(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr05G002113 Chr05 NC_080391.1:22165013-22165020promoter 内 130-137 bp + 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 22157781-22161149(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr03G002903 Chr03 NC_080389.1:45781732-45781739promoter 内 128-135 bp - 3866 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 45774815-45777866(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr07G002574 Chr07 NC_080393.1:24570524-24570531promoter 内 123-130 bp - 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 24574402-24579646(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr05G001460 Chr05 NC_080391.1:13328715-13328722promoter 内 115-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 13332601-13334116(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr07G000414 Chr07 NC_080393.1:2856506-2856513promoter 内 115-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 2860392-2862855(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr07G000109 Chr07 NC_080393.1:615799-615806promoter 内 93-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 604234-611898(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr03G004642 Chr03 NC_080389.1:64009546-64009553promoter 内 82-89 bp - 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 64002956-64005634(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr02G001104 Chr02 NC_080388.1:19856913-19856920promoter 内 81-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 19860833-19863526(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr07G000528 Chr07 NC_080393.1:3685375-3685382promoter 内 71-78 bp - 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 3679464-3681452(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr04G002964 Chr04 NC_080390.1:46017129-46017136promoter 内 65-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 46012125-46013200(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr08G002770 Chr08 NC_080394.1:27345497-27345504promoter 内 63-70 bp + 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 27339625-27341566(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr04G000532 Chr04 NC_080390.1:5887328-5887335promoter 内 55-62 bp - 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 5880920-5883389(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr07G004276 Chr07 NC_080393.1:55254916-55254923promoter 内 51-58 bp - 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 55258866-55259702(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr02G003399 Chr02 NC_080388.1:55143912-55143919promoter 内 43-50 bp - 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 55138377-55139961(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr07G004676 Chr07 NC_080393.1:59716665-59716672promoter 内 32-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 59710700-59712703(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr08G000011 Chr08 NC_080394.1:110706-110713promoter 内 30-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 104417-106742(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr05G000270 Chr05 NC_080391.1:2077944-2077951promoter 内 28-35 bp + 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 2081917-2082791(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr05G001250 Chr05 NC_080391.1:10629005-10629012promoter 内 23-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 10632983-10635994(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr04G000945 Chr04 NC_080390.1:12517548-12517555promoter 内 20-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 12503272-12513574(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr08G001834 Chr08 NC_080394.1:15709977-15709984promoter 内 14-21 bp + 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 15713964-15714861(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr06G002050 Chr06 NC_080392.1:26933684-26933691promoter 内 13-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 26928070-26929703(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTG
SmilChr07G001359 Chr07 NC_080393.1:10539432-10539439promoter 内 1-8 bp - 3993 bp 位于靶基因 TSS 上游 100.0/ 100 1 10531922-10535439(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 CACGTAAC
SmilChr05G004396 Chr05 NC_080391.1:57387606-57387613promoter 内 2798-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 5 57388809-57390341(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr02G002044 Chr02 NC_080388.1:36820925-36820932promoter 内 1015-1022 bp + 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 5 36823911-36829703(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr01G000150 Chr01 NC_080387.1:2561786-2561793promoter 内 3992-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 2559918-2561784(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr08G002245 Chr08 NC_080394.1:20619963-20619970promoter 内 3947-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 20616212-20619916(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr03G001992 Chr03 NC_080389.1:29337463-29337470promoter 内 3933-3940 bp + 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 29331425-29337402(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA
SmilChr03G002577 Chr03 NC_080389.1:40984021-40984028promoter 内 3603-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 40984419-40987759(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA
SmilChr07G003867 Chr07 NC_080393.1:48135949-48135956promoter 内 3560-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 48136390-48137041(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr06G001001 Chr06 NC_080392.1:9908202-9908209promoter 内 3513-3520 bp - 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 9905283-9907721(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr04G001426 Chr04 NC_080390.1:23223051-23223058promoter 内 3448-3455 bp - 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 23219970-23222505(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr04G001427 Chr04 NC_080390.1:23224300-23224307promoter 内 3318-3325 bp + 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 23224983-23227458(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr06G000138 Chr06 NC_080392.1:977697-977704promoter 内 3073-3080 bp - 921 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 976456-976776(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr02G003991 Chr02 NC_080388.1:62209714-62209721promoter 内 3053-3060 bp + 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 62210662-62215677(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
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SmilChr07G003399 Chr07 NC_080393.1:36888548-36888555promoter 内 2661-2668 bp - 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 36889888-36894654(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA
SmilChr01G002458 Chr01 NC_080387.1:42201056-42201063promoter 内 2423-2430 bp + 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 42202634-42205023(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAC
SmilChr08G001724 Chr08 NC_080394.1:14487905-14487912promoter 内 2314-2321 bp + 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 14485522-14486225(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA
SmilChr04G000043 Chr04 NC_080390.1:411041-411048promoter 内 2206-2213 bp - 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 412836-414785(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA
SmilChr02G005312 Chr02 NC_080388.1:74011298-74011305promoter 内 1872-1879 bp - 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 74013427-74014978(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA
SmilChr02G001103 Chr02 NC_080388.1:19846711-19846718promoter 内 1814-1821 bp - 2180 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 4 19848898-19852362(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 GTTACGTA