转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 27 / 151 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001175 Chr03 NC_080389.1:13510094-13510106promoter 内 434-446 bp + 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 13505637-13506539(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTAGTAGGTAGG
SmilChr03G004521 Chr03 NC_080389.1:63281622-63281634promoter 内 416-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 63273797-63278049(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCTGT
SmilChr04G001148 Chr04 NC_080390.1:16923642-16923654promoter 内 326-338 bp - 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 16927317-16927945(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATAGTAGGTAAG
SmilChr01G000087 Chr01 NC_080387.1:1612840-1612852promoter 内 321-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1616520-1617599(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTACA
SmilChr03G004458 Chr03 NC_080389.1:62680985-62680997promoter 内 3433-3445 bp - 556 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 62675581-62680429(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCAAA
SmilChr04G000855 Chr04 NC_080390.1:10818790-10818802promoter 内 3387-3399 bp + 602 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 10817802-10818188(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTGCA
SmilChr03G004459 Chr03 NC_080389.1:62680985-62680997promoter 内 3003-3015 bp - 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 62679200-62679999(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCAAA
SmilChr04G001733 Chr04 NC_080390.1:28560541-28560553promoter 内 1301-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 28563241-28566927(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCAAT
SmilChr03G000146 Chr03 NC_080389.1:1610175-1610187promoter 内 1595-1607 bp + 2394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 1602765-1607781(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGTTAGGTAAA
SmilChr02G003839 Chr02 NC_080388.1:60107363-60107375promoter 内 3974-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 60104342-60107348(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr01G006174 Chr01 NC_080387.1:77248531-77248543promoter 内 3783-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 77248749-77252889(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTAAC
SmilChr02G005480 Chr02 NC_080388.1:75012779-75012791promoter 内 3651-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 75009909-75012441(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTGAC
SmilChr03G000032 Chr03 NC_080389.1:402832-402844promoter 内 3569-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 399639-402412(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTAAG
SmilChr01G002483 Chr01 NC_080387.1:42562947-42562959promoter 内 3384-3396 bp - 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 42558945-42562342(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACTAT
SmilChr04G003845 Chr04 NC_080390.1:54463729-54463741promoter 内 2932-2944 bp + 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 54460705-54462672(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGTTAGGTAAG
SmilChr03G001452 Chr03 NC_080389.1:17331669-17331681promoter 内 2913-2925 bp - 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17324997-17330593(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACCCCA
SmilChr05G001904 Chr05 NC_080391.1:19305102-19305114promoter 内 2572-2584 bp + 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 19306531-19308048(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr05G001906 Chr05 NC_080391.1:19314539-19314551promoter 内 2571-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 19315969-19317486(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr02G003182 Chr02 NC_080388.1:52985447-52985459promoter 内 1863-1875 bp - 2126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 52980938-52983321(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTCAC
SmilChr05G000719 Chr05 NC_080391.1:5499274-5499286promoter 内 1600-1612 bp - 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 5501675-5503387(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTGAC
SmilChr01G001008 Chr01 NC_080387.1:21197149-21197161promoter 内 1051-1063 bp + 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21200099-21203029(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTAG
SmilChr02G003990 Chr02 NC_080388.1:62196674-62196686promoter 内 699-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 62191665-62193384(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCAAT
SmilChr01G001855 Chr01 NC_080387.1:33502792-33502804promoter 内 204-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 33497684-33499007(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCCCA
SmilChr01G006115 Chr01 NC_080387.1:76677292-76677304promoter 内 3987-3999 bp + 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 76677306-76680302(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCAAA
SmilChr01G003391 Chr01 NC_080387.1:52629042-52629054promoter 内 3975-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 52629068-52631558(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGTTAGGTAAA
SmilChr02G003840 Chr02 NC_080388.1:60116868-60116880promoter 内 3975-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 60113846-60116854(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr05G001902 Chr05 NC_080391.1:19305102-19305114promoter 内 3951-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 19305152-19305960(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr05G001536 Chr05 NC_080391.1:14043378-14043390promoter 内 3790-3802 bp + 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 14039608-14043179(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGAGTAGGTAAA
SmilChr04G003846 Chr04 NC_080390.1:54463729-54463741promoter 内 3372-3384 bp + 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54464358-54467976(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACCAC
SmilChr03G000433 Chr03 NC_080389.1:4686391-4686403promoter 内 3368-3380 bp - 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 4687024-4693070(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTAAG
SmilChr04G001931 Chr04 NC_080390.1:31409291-31409303promoter 内 3323-3335 bp - 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 31409969-31411453(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTGGTAGGTGAA
SmilChr02G003184 Chr02 NC_080388.1:52985447-52985459promoter 内 3201-3213 bp - 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 52986247-52990483(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGAGTAGGTAAG
SmilChr03G000860 Chr03 NC_080389.1:9819924-9819936promoter 内 3186-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 9820739-9825687(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGGTTAGGTAAA
SmilChr02G004412 Chr02 NC_080388.1:66461864-66461876promoter 内 3030-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 66454537-66460905(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTAGG
SmilChr02G004173 Chr02 NC_080388.1:64017808-64017820promoter 内 2882-2894 bp + 1107 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 64018927-64028159(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACTTG
SmilChr04G000846 Chr04 NC_080390.1:10695201-10695213promoter 内 2718-2730 bp - 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 10692251-10693930(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr05G000995 Chr05 NC_080391.1:8079238-8079250promoter 内 2523-2535 bp - 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 8066534-8077772(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr03G004392 Chr03 NC_080389.1:62101290-62101302promoter 内 2476-2488 bp - 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 62099029-62099777(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCTGA
SmilChr02G004256 Chr02 NC_080388.1:64759030-64759042promoter 内 2431-2443 bp - 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 64760600-64760672(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTGCA
SmilChr03G000268 Chr03 NC_080389.1:3099318-3099330promoter 内 2402-2414 bp + 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3094510-3097731(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTAAG
SmilChr03G000082 Chr03 NC_080389.1:965084-965096promoter 内 2387-2399 bp - 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 966698-968401(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAGGTAGGTAAG
SmilChr03G001853 Chr03 NC_080389.1:25519718-25519730promoter 内 2354-2366 bp + 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 25513957-25518083(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAAGTAGGTAAG
SmilChr03G002540 Chr03 NC_080389.1:40558128-40558140promoter 内 2334-2346 bp + 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 40551539-40556473(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGAGTAGGTAGA
SmilChr05G001384 Chr05 NC_080391.1:12406654-12406666promoter 内 2291-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 12408364-12409517(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr05G001385 Chr05 NC_080391.1:12416101-12416113promoter 内 2291-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 12417811-12418964(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr04G003789 Chr04 NC_080390.1:54057902-54057914promoter 内 2229-2241 bp + 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54059674-54077830(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCAGA
SmilChr01G000195 Chr01 NC_080387.1:3370868-3370880promoter 内 2145-2157 bp + 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3372724-3373659(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr01G000196 Chr01 NC_080387.1:3380269-3380281promoter 内 2145-2157 bp + 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3382125-3383060(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr04G002312 Chr04 NC_080390.1:37436238-37436250promoter 内 2081-2093 bp - 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 37433374-37434330(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCTT
SmilChr04G001930 Chr04 NC_080390.1:31409291-31409303promoter 内 2078-2090 bp - 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 31404416-31407380(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCAGA